Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 TPR-208ENST00000492973 453 ntTSL 25.89□□□□□ -1.472e-10■■■■■ 37.7
SRSF7Q16629 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 37.5
SRSF7Q16629 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 37.5
SRSF7Q16629 SLC17A9-207ENST00000488738 3992 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 37.5
SRSF7Q16629 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 211.48□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 37.3
SRSF7Q16629 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 214.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 36.7
SRSF7Q16629 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 36.7
SRSF7Q16629 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 36.7
SRSF7Q16629 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 36.7
SRSF7Q16629 QRICH2-204ENST00000532549 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.52□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 36.5
SRSF7Q16629 QRICH2-202ENST00000447564 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.34□□□□□ -0.272e-10■■■■■ 36.5
SRSF7Q16629 PPARGC1A-204ENST00000506055 2627 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 36.5
SRSF7Q16629 PLCB1-220ENST00000630757 857 ntTSL 36.32□□□□□ -1.45e-11■■■■■ 36.2
SRSF7Q16629 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 52.95□□□□□ -1.945e-11■■■■■ 36.2
SRSF7Q16629 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 36.1
SRSF7Q16629 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.262e-9■■■■■ 35.6
SRSF7Q16629 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 46.89□□□□□ -1.312e-9■■■■■ 35.6
SRSF7Q16629 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.38e-11■■■■■ 35.4
SRSF7Q16629 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 513.42□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.58e-11■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.28e-11■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.44e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 29.81□□□□□ -0.844e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-206ENST00000487231 3088 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.914e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 PIGS-207ENST00000492429 2658 ntTSL 29.34□□□□□ -0.914e-15■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.168e-11■■■■■ 35.2
SRSF7Q16629 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 25.27□□□□□ -1.572e-12■■■■■ 35.1
SRSF7Q16629 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 34.6
SRSF7Q16629 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 34.6
SRSF7Q16629 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 34.6
SRSF7Q16629 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 34.6
SRSF7Q16629 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC10.93□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-221ENST00000513230 248 ntTSL 318.93■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 417.46■□□□□ 0.391e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-245ENST00000523137 1563 ntTSL 415.89■□□□□ 0.131e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-228ENST00000515714 690 ntTSL 414.59□□□□□ -0.071e-11■■■■■ 33.9
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SRSF7Q16629 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 313.51□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 33.9
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SRSF7Q16629 HNRNPH1-225ENST00000515158 850 ntTSL 412.15□□□□□ -0.461e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-242ENST00000522256 492 ntTSL 412.02□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-213ENST00000505811 1155 ntTSL 511.93□□□□□ -0.51e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-224ENST00000514731 1371 ntTSL 211.7□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-220ENST00000513225 805 ntTSL 411.53□□□□□ -0.561e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 211.42□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-215ENST00000508103 610 ntTSL 210.65□□□□□ -0.71e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-217ENST00000510431 620 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-234ENST00000519707 582 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 510.62□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-233ENST00000519455 451 ntTSL 410.4□□□□□ -0.741e-11■■■■■ 33.9
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SRSF7Q16629 HNRNPH1-214ENST00000506721 602 ntTSL 510.29□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-209ENST00000504348 594 ntTSL 410.29□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-232ENST00000519056 530 ntTSL 49.24□□□□□ -0.931e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 HNRNPH1-219ENST00000512273 501 ntTSL 46.81□□□□□ -1.321e-11■■■■■ 33.9
SRSF7Q16629 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.813e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-201ENST00000504719 754 ntTSL 220.01■□□□□ 0.793e-10■■■■■ 33.8
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SRSF7Q16629 PVT1-204ENST00000517525 392 ntTSL 319.44■□□□□ 0.73e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.583e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-218ENST00000523328 343 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.43e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.213e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-220ENST00000524165 458 ntTSL 213.59□□□□□ -0.233e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 411.72□□□□□ -0.533e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 211.27□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.743e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 210.1□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-215ENST00000522963 568 ntTSL 49.78□□□□□ -0.843e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 59.36□□□□□ -0.913e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 58.68□□□□□ -1.023e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 48.58□□□□□ -1.043e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-216ENST00000523068 844 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.053e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-207ENST00000518528 624 ntTSL 36.94□□□□□ -1.33e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 PVT1-205ENST00000517790 599 ntTSL 24.2□□□□□ -1.743e-10■■■■■ 33.8
SRSF7Q16629 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 216.24■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 414.81□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 213.32□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 312.38□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 412.25□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 411.81□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 411.59□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 411.08□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-218ENST00000574804 631 ntTSL 310.45□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 39.59□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-223ENST00000575958 567 ntTSL 49.41□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 33.7
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