Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 DNM1-227ENST00000637999 1429 ntTSL 512.46□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 33.9
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PUM1Q14671 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 ISY1-204ENST00000471306 552 ntTSL 210.03□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 MROH1-204ENST00000527071 680 ntTSL 313.14□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 210.84□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 33.8
PUM1Q14671 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.19■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 33.1
PUM1Q14671 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 33.1
PUM1Q14671 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 33.1
PUM1Q14671 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.69□□□□□ -0.389e-7■■■■■ 33.1
PUM1Q14671 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 33.1
PUM1Q14671 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 33.1
PUM1Q14671 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.899e-7■■■■■ 33.1
PUM1Q14671 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.485e-6■■■■■ 32.8
PUM1Q14671 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.485e-6■■■■■ 32.8
PUM1Q14671 MTCH1-205ENST00000471737 629 ntTSL 213.04□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 32.8
PUM1Q14671 MTCH1-203ENST00000418541 602 ntTSL 39.29□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 32.8
PUM1Q14671 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 32.4
PUM1Q14671 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 215.16■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.916e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.866e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 SDCCAG3-203ENST00000371723 865 ntTSL 226.51■■□□□ 1.836e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.456e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.528e-7■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 SREBF1-213ENST00000485080 1230 ntTSL 517.88■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 32.3
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PUM1Q14671 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.139e-22■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 ANKRD39-202ENST00000443120 4965 ntTSL 214.75□□□□□ -0.059e-22■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.069e-22■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.96e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 CD2AP-205ENST00000486693 548 ntTSL 48.74□□□□□ -1.016e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.323e-7■■■■■ 32.3
PUM1Q14671 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 32.2
PUM1Q14671 LMNB2-203ENST00000490554 689 ntTSL 217.14■□□□□ 0.339e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 PRKRIP1-206ENST00000482465 2257 ntTSL 214.94□□□□□ -0.029e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 PRKRIP1-203ENST00000468316 2045 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.039e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.089e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.399e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.399e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.459e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.829e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.839e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 LIN54-205ENST00000505905 810 ntTSL 28.56□□□□□ -1.049e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 RDX-207ENST00000529774 512 ntTSL 27.04□□□□□ -1.289e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 32.1
PUM1Q14671 PEBP1-202ENST00000542939 708 ntTSL 316.35■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 32.1
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PUM1Q14671 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 31.7
PUM1Q14671 DNAJC25-203ENST00000463589 2572 ntTSL 518.61■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 31.7
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PUM1Q14671 TOP1MT-203ENST00000517857 624 ntTSL 214.65□□□□□ -0.062e-14■■■■■ 31.5
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PUM1Q14671 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-23■■■■■ 31.3
PUM1Q14671 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.313e-23■■■■■ 31.3
PUM1Q14671 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 35.97□□□□□ -1.453e-23■■■■■ 31.3
PUM1Q14671 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.493e-23■■■■■ 31.3
PUM1Q14671 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.863e-23■■■■■ 31.3
PUM1Q14671 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 31.3
PUM1Q14671 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-13■■■■■ 30.8
PUM1Q14671 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.341e-13■■■■■ 30.8
PUM1Q14671 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.911e-13■■■■■ 30.8
PUM1Q14671 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 520.4■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 DDX54-208ENST00000551344 872 ntTSL 519.63■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.3■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.674e-14■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 216.95■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 ESYT2-205ENST00000497111 663 ntTSL 415.73■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 DDX54-210ENST00000552375 780 ntTSL 514.71□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 SMARCA2-238ENST00000635273 672 ntTSL 56.98□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 SMARCA2-240ENST00000635392 291 ntTSL 56.55□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 30.7
PUM1Q14671 ERCC3-207ENST00000490062 576 ntTSL 417.19■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 ERCC3-206ENST00000462306 963 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 ERCC3-202ENST00000426778 2916 ntTSL 213.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 ERCC3-209ENST00000494464 1367 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 ERCC3-203ENST00000445889 2920 ntTSL 213.59□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 AFDN-215ENST00000497596 728 ntTSL 29.17□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 30.6
PUM1Q14671 SLTM-210ENST00000497088 716 ntTSL 25.46□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 30.6
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