Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 114.2
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PABPC4Q13310 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.666e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.666e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.566e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.536e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)30.83■■■□□ 2.536e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.486e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.26e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 226.13■■□□□ 1.776e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.046e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 517■□□□□ 0.316e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.26e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.136e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 AC127070.1-201ENST00000488441 484 ntBASIC12.85□□□□□ -0.356e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 28.92□□□□□ -0.986e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.266e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.476e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.686e-13■■■■■ 112.3
PABPC4Q13310 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.23■□□□□ 0.511e-323■■■■■ 111.4
PABPC4Q13310 ZNF581-204ENST00000588537 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.189e-17■■■■■ 108.3
PABPC4Q13310 ZNF581-201ENST00000270451 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.189e-17■■■■■ 108.3
PABPC4Q13310 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.255e-13■■■■■ 106.8
PABPC4Q13310 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.125e-13■■■■■ 106.8
PABPC4Q13310 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.515e-13■■■■■ 106.8
PABPC4Q13310 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.32e-9■■■■■ 106.1
PABPC4Q13310 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 106.1
PABPC4Q13310 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.789e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.069e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.29e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.539e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC10.64□□□□□ -0.719e-33■■■■■ 105.6
PABPC4Q13310 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.675e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.345e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.275e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.245e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 EGR2-206ENST00000639815 1075 ntTSL 515.84■□□□□ 0.135e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.045e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -05e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.645e-12■■■■■ 104.3
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PABPC4Q13310 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.855e-12■■■■■ 104.3
PABPC4Q13310 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.363e-24■■■■■ 103
PABPC4Q13310 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.122e-10■■■■■ 102
PABPC4Q13310 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.552e-10■■■■■ 102
PABPC4Q13310 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.676e-25■■■■■ 101.7
PABPC4Q13310 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.586e-25■■■■■ 101.7
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PABPC4Q13310 ZNF749-203ENST00000597296 677 ntTSL 217.73■□□□□ 0.432e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 ZNF749-204ENST00000600697 459 ntTSL 315.41■□□□□ 0.062e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 101.5
PABPC4Q13310 AC010343.1-201ENST00000467270 629 ntBASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 99.2
PABPC4Q13310 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.63e-14■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.333e-14■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.663e-14■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 UNC119-205ENST00000484980 4189 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.673e-14■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-323■■■■■ 97.2
PABPC4Q13310 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.164e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.494e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 210.93□□□□□ -0.664e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 DAD1-202ENST00000489532 339 ntTSL 33.56□□□□□ -1.844e-89■■■■■ 97
PABPC4Q13310 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.114e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-211ENST00000513303 714 ntTSL 215.17■□□□□ 0.024e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 STAT1-205ENST00000415035 663 ntTSL 314.55□□□□□ -0.084e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 C10orf90-208ENST00000488181 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.42□□□□□ -0.14e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.144e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-208ENST00000510965 787 ntTSL 513.67□□□□□ -0.224e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-201ENST00000505309 573 ntTSL 213.67□□□□□ -0.224e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-206ENST00000370689 4513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.294e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 STAT1-212ENST00000540176 4216 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.364e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-215ENST00000515626 566 ntTSL 412.56□□□□□ -0.44e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.454e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-206ENST00000509276 738 ntTSL 511.73□□□□□ -0.534e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-202ENST00000506078 799 ntTSL 211.16□□□□□ -0.624e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 ADAM9-201ENST00000379917 3836 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.684e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 ADAM9-207ENST00000481873 3793 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.764e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.784e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 ADAM9-204ENST00000468065 3755 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.814e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-212ENST00000514218 1047 ntTSL 59.1□□□□□ -0.954e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.024e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-211ENST00000432111 662 ntTSL 57.81□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-210ENST00000417530 686 ntTSL 27.81□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-210ENST00000512980 4175 ntTSL 27.53□□□□□ -1.24e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-216ENST00000470673 752 ntTSL 37.06□□□□□ -1.284e-11■■■■■ 96.3
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