Protein–RNA interactions for Protein: Q12530

RMP1, Ribonuclease MRP protein subunit RMP1, yeastyeast

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RMP1Q12530 ART5YGR068C 1761 nt13.07□□□□□ -0.32
RMP1Q12530 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.06□□□□□ -0.32
RMP1Q12530 GIS3YLR094C 1509 nt13.06□□□□□ -0.32
RMP1Q12530 GFD2YCL036W 1701 nt13.05□□□□□ -0.32
RMP1Q12530 HOM6YJR139C 1080 nt13.03□□□□□ -0.32
RMP1Q12530 RTS2YOR077W 699 nt13.03□□□□□ -0.32
RMP1Q12530 YGR021WYGR021W 873 nt13.02□□□□□ -0.33
RMP1Q12530 MNP1YGL068W 585 nt12.99□□□□□ -0.33
RMP1Q12530 PCH2YBR186W 1695 nt12.93□□□□□ -0.34
RMP1Q12530 TIR4YOR009W 1464 nt12.88□□□□□ -0.35
RMP1Q12530 GUT2YIL155C 1950 nt12.88□□□□□ -0.35
RMP1Q12530 YSC84YHR016C 1407 nt12.88□□□□□ -0.35
RMP1Q12530 PET9YBL030C 957 nt12.87□□□□□ -0.35
RMP1Q12530 SEC11YIR022W 504 nt12.84□□□□□ -0.35
RMP1Q12530 RKM5YLR137W 1104 nt12.84□□□□□ -0.35
RMP1Q12530 YMR057CYMR057C 372 nt12.8□□□□□ -0.36
RMP1Q12530 YHL050CYHL050C 2094 nt12.79□□□□□ -0.36
RMP1Q12530 CUE1YMR264W 612 nt12.78□□□□□ -0.36
RMP1Q12530 RRT12YCR045C 1476 nt12.78□□□□□ -0.36
RMP1Q12530 PAC11YDR488C 1602 nt12.77□□□□□ -0.37
RMP1Q12530 YCH1YGR203W 447 nt12.72□□□□□ -0.37
RMP1Q12530 PIB2YGL023C 1908 nt12.7□□□□□ -0.38
RMP1Q12530 YKL097CYKL097C 411 nt12.68□□□□□ -0.38
RMP1Q12530 FPS1YLL043W 2010 nt12.67□□□□□ -0.38
RMP1Q12530 NPL3YDR432W 1245 nt12.65□□□□□ -0.38
RMP1Q12530 YIL100WYIL100W 354 nt12.63□□□□□ -0.39
RMP1Q12530 YJL152WYJL152W 360 nt12.62□□□□□ -0.39
RMP1Q12530 YNL195CYNL195C 786 nt12.6□□□□□ -0.39
RMP1Q12530 RTF1YGL244W 1677 nt12.59□□□□□ -0.39
RMP1Q12530 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.55□□□□□ -0.4
RMP1Q12530 YLR236CYLR236C 324 nt12.52□□□□□ -0.41
RMP1Q12530 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.49□□□□□ -0.41
RMP1Q12530 BOP3YNL042W 1191 nt12.47□□□□□ -0.41
RMP1Q12530 PTK1YKL198C 1989 nt12.43□□□□□ -0.42
RMP1Q12530 YOL037CYOL037C 354 nt12.43□□□□□ -0.42
RMP1Q12530 NCP1YHR042W 2076 nt12.37□□□□□ -0.43
RMP1Q12530 YOR139CYOR139C 393 nt12.33□□□□□ -0.44
RMP1Q12530 WHI5YOR083W 888 nt12.29□□□□□ -0.44
RMP1Q12530 LCB1YMR296C 1677 nt12.28□□□□□ -0.44
RMP1Q12530 RRD1YIL153W 1182 nt12.24□□□□□ -0.45
RMP1Q12530 YLR281CYLR281C 468 nt12.22□□□□□ -0.45
RMP1Q12530 YFL054CYFL054C 1941 nt12.21□□□□□ -0.46
RMP1Q12530 NVJ2YPR091C 2313 nt12.2□□□□□ -0.46
RMP1Q12530 GBP2YCL011C 1284 nt12.18□□□□□ -0.46
RMP1Q12530 IDH1YNL037C 1083 nt12.16□□□□□ -0.46
RMP1Q12530 DED1YOR204W 1815 nt12.16□□□□□ -0.46
RMP1Q12530 FMT1YBL013W 1206 nt12.1□□□□□ -0.47
RMP1Q12530 PCM1YEL058W 1674 nt12.1□□□□□ -0.47
RMP1Q12530 SPT8YLR055C 1809 nt12.09□□□□□ -0.47
RMP1Q12530 SIM1YIL123W 1431 nt12.08□□□□□ -0.48
RMP1Q12530 TCD2YKL027W 1344 nt12.08□□□□□ -0.48
RMP1Q12530 FMP52YER004W 696 nt12.05□□□□□ -0.48
RMP1Q12530 ADH2YMR303C 1047 nt12.03□□□□□ -0.48
RMP1Q12530 CWP1YKL096W 720 nt12.02□□□□□ -0.49
RMP1Q12530 MXR2YCL033C 507 nt12.01□□□□□ -0.49
RMP1Q12530 PUS2YGL063W 1113 nt12□□□□□ -0.49
RMP1Q12530 LYS4YDR234W 2082 nt11.99□□□□□ -0.49
RMP1Q12530 YDR433WYDR433W 441 nt11.98□□□□□ -0.49
RMP1Q12530 YPR011CYPR011C 981 nt11.98□□□□□ -0.49
RMP1Q12530 BIO4YNR057C 714 nt11.97□□□□□ -0.49
RMP1Q12530 DSK2YMR276W 1122 nt11.96□□□□□ -0.49
RMP1Q12530 SNF6YHL025W 999 nt11.95□□□□□ -0.5
RMP1Q12530 FMP45YDL222C 930 nt11.91□□□□□ -0.5
RMP1Q12530 SWE1YJL187C 2460 nt11.89□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 IMP2'YIL154C 1041 nt11.88□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.85□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.85□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.85□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.85□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.85□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 LPX1YOR084W 1164 nt11.85□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 SOR2YDL246C 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 SOR1YJR159W 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
RMP1Q12530 BOR1YNL275W 1731 nt11.83□□□□□ -0.52
RMP1Q12530 YCL042WYCL042W 360 nt11.82□□□□□ -0.52
RMP1Q12530 FRD1YEL047C 1413 nt11.77□□□□□ -0.52
RMP1Q12530 YLL053CYLL053C 459 nt11.77□□□□□ -0.53
RMP1Q12530 YIH1YCR059C 777 nt11.76□□□□□ -0.53
RMP1Q12530 ERV46YAL042W 1248 nt11.76□□□□□ -0.53
RMP1Q12530 CRR1YLR213C 1269 nt11.76□□□□□ -0.53
RMP1Q12530 ERF2YLR246W 1080 nt11.75□□□□□ -0.53
RMP1Q12530 YKR040CYKR040C 504 nt11.73□□□□□ -0.53
RMP1Q12530 MIC10YCL057C-A 294 nt11.73□□□□□ -0.53
RMP1Q12530 ATF2YGR177C 1608 nt11.71□□□□□ -0.54
RMP1Q12530 RNQ1YCL028W 1218 nt11.7□□□□□ -0.54
RMP1Q12530 HSP60YLR259C 1719 nt11.69□□□□□ -0.54
RMP1Q12530 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.68□□□□□ -0.54
RMP1Q12530 HEM12YDR047W 1089 nt11.65□□□□□ -0.54
RMP1Q12530 SNG1YGR197C 1644 nt11.64□□□□□ -0.55
RMP1Q12530 TRM5YHR070W 1500 nt11.61□□□□□ -0.55
RMP1Q12530 FTR1YER145C 1215 nt11.61□□□□□ -0.55
RMP1Q12530 DIC1YLR348C 897 nt11.61□□□□□ -0.55
RMP1Q12530 CCA1YER168C 1641 nt11.6□□□□□ -0.55
RMP1Q12530 GAL1YBR020W 1587 nt11.59□□□□□ -0.55
RMP1Q12530 GLK1YCL040W 1503 nt11.57□□□□□ -0.56
RMP1Q12530 FUR4YBR021W 1902 nt11.57□□□□□ -0.56
RMP1Q12530 RAX1YOR301W 1308 nt11.56□□□□□ -0.56
RMP1Q12530 YFL067WYFL067W 528 nt11.55□□□□□ -0.56
RMP1Q12530 DDR2YOL052C-A 186 nt11.53□□□□□ -0.56
RMP1Q12530 PTH1YHR189W 573 nt11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms