Protein–RNA interactions for Protein: Q12477

PCL9, PHO85 cyclin-9, yeastyeast

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCL9Q12477 SCC4YER147C 1875 nt11.19□□□□□ -0.62
PCL9Q12477 ART5YGR068C 1761 nt11.17□□□□□ -0.62
PCL9Q12477 MNP1YGL068W 585 nt11.16□□□□□ -0.62
PCL9Q12477 GFD2YCL036W 1701 nt11.15□□□□□ -0.62
PCL9Q12477 GIS3YLR094C 1509 nt11.14□□□□□ -0.63
PCL9Q12477 YKL097CYKL097C 411 nt11.13□□□□□ -0.63
PCL9Q12477 RKM5YLR137W 1104 nt11.13□□□□□ -0.63
PCL9Q12477 PET9YBL030C 957 nt11.13□□□□□ -0.63
PCL9Q12477 YCH1YGR203W 447 nt11.09□□□□□ -0.63
PCL9Q12477 SEC11YIR022W 504 nt11.06□□□□□ -0.64
PCL9Q12477 RTS2YOR077W 699 nt11.05□□□□□ -0.64
PCL9Q12477 PCH2YBR186W 1695 nt11.01□□□□□ -0.65
PCL9Q12477 TIR4YOR009W 1464 nt11.01□□□□□ -0.65
PCL9Q12477 CUE1YMR264W 612 nt10.99□□□□□ -0.65
PCL9Q12477 GUT2YIL155C 1950 nt10.96□□□□□ -0.66
PCL9Q12477 YMR057CYMR057C 372 nt10.95□□□□□ -0.66
PCL9Q12477 YSC84YHR016C 1407 nt10.94□□□□□ -0.66
PCL9Q12477 NPL3YDR432W 1245 nt10.9□□□□□ -0.66
PCL9Q12477 YIL100WYIL100W 354 nt10.89□□□□□ -0.67
PCL9Q12477 YOL037CYOL037C 354 nt10.89□□□□□ -0.67
PCL9Q12477 YJL152WYJL152W 360 nt10.87□□□□□ -0.67
PCL9Q12477 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.87□□□□□ -0.67
PCL9Q12477 YNL195CYNL195C 786 nt10.87□□□□□ -0.67
PCL9Q12477 YHL050CYHL050C 2094 nt10.86□□□□□ -0.67
PCL9Q12477 FPS1YLL043W 2010 nt10.84□□□□□ -0.67
PCL9Q12477 YLR236CYLR236C 324 nt10.84□□□□□ -0.67
PCL9Q12477 RRT12YCR045C 1476 nt10.83□□□□□ -0.68
PCL9Q12477 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.79□□□□□ -0.68
PCL9Q12477 PIB2YGL023C 1908 nt10.75□□□□□ -0.69
PCL9Q12477 RTF1YGL244W 1677 nt10.75□□□□□ -0.69
PCL9Q12477 PAC11YDR488C 1602 nt10.73□□□□□ -0.69
PCL9Q12477 YJL225CYJL225C 5277 nt10.72□□□□□ -0.69
PCL9Q12477 YOR139CYOR139C 393 nt10.71□□□□□ -0.69
PCL9Q12477 BOP3YNL042W 1191 nt10.7□□□□□ -0.7
PCL9Q12477 WHI5YOR083W 888 nt10.67□□□□□ -0.7
PCL9Q12477 YLR281CYLR281C 468 nt10.64□□□□□ -0.71
PCL9Q12477 IDH1YNL037C 1083 nt10.58□□□□□ -0.72
PCL9Q12477 PTK1YKL198C 1989 nt10.56□□□□□ -0.72
PCL9Q12477 NCP1YHR042W 2076 nt10.54□□□□□ -0.72
PCL9Q12477 GBP2YCL011C 1284 nt10.53□□□□□ -0.72
PCL9Q12477 RRD1YIL153W 1182 nt10.51□□□□□ -0.73
PCL9Q12477 IMP2'YIL154C 1041 nt10.49□□□□□ -0.73
PCL9Q12477 FMP52YER004W 696 nt10.48□□□□□ -0.73
PCL9Q12477 TCD2YKL027W 1344 nt10.48□□□□□ -0.73
PCL9Q12477 LCB1YMR296C 1677 nt10.45□□□□□ -0.74
PCL9Q12477 Q0182Q0182 405 nt10.44□□□□□ -0.74
PCL9Q12477 PUS2YGL063W 1113 nt10.43□□□□□ -0.74
PCL9Q12477 DSK2YMR276W 1122 nt10.42□□□□□ -0.74
PCL9Q12477 DED1YOR204W 1815 nt10.42□□□□□ -0.74
PCL9Q12477 PCM1YEL058W 1674 nt10.4□□□□□ -0.74
PCL9Q12477 YFL054CYFL054C 1941 nt10.39□□□□□ -0.75
PCL9Q12477 SIM1YIL123W 1431 nt10.36□□□□□ -0.75
PCL9Q12477 YDR433WYDR433W 441 nt10.35□□□□□ -0.75
PCL9Q12477 FMT1YBL013W 1206 nt10.35□□□□□ -0.75
PCL9Q12477 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.35□□□□□ -0.75
PCL9Q12477 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.35□□□□□ -0.75
PCL9Q12477 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.33□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.33□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.33□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.33□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.33□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 SNF6YHL025W 999 nt10.31□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 CWP1YKL096W 720 nt10.31□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 ADH2YMR303C 1047 nt10.3□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 SPT8YLR055C 1809 nt10.3□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 FMP45YDL222C 930 nt10.29□□□□□ -0.76
PCL9Q12477 YPR011CYPR011C 981 nt10.27□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 MXR2YCL033C 507 nt10.27□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 BIO4YNR057C 714 nt10.26□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 YCL042WYCL042W 360 nt10.26□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 SOR2YDL246C 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 SOR1YJR159W 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 ERV46YAL042W 1248 nt10.24□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 LYS4YDR234W 2082 nt10.24□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 NVJ2YPR091C 2313 nt10.23□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 YKR040CYKR040C 504 nt10.21□□□□□ -0.77
PCL9Q12477 LPX1YOR084W 1164 nt10.19□□□□□ -0.78
PCL9Q12477 ERF2YLR246W 1080 nt10.17□□□□□ -0.78
PCL9Q12477 YIH1YCR059C 777 nt10.16□□□□□ -0.78
PCL9Q12477 FRD1YEL047C 1413 nt10.14□□□□□ -0.79
PCL9Q12477 RNQ1YCL028W 1218 nt10.13□□□□□ -0.79
PCL9Q12477 SWE1YJL187C 2460 nt10.12□□□□□ -0.79
PCL9Q12477 CRR1YLR213C 1269 nt10.11□□□□□ -0.79
PCL9Q12477 YLL053CYLL053C 459 nt10.1□□□□□ -0.79
PCL9Q12477 BOR1YNL275W 1731 nt10.07□□□□□ -0.8
PCL9Q12477 HEM12YDR047W 1089 nt10.04□□□□□ -0.8
PCL9Q12477 YFL067WYFL067W 528 nt10.03□□□□□ -0.8
PCL9Q12477 FTR1YER145C 1215 nt10.02□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.02□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 DIC1YLR348C 897 nt10.02□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 ATF2YGR177C 1608 nt10.02□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 GAL1YBR020W 1587 nt9.97□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 DDR2YOL052C-A 186 nt9.97□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 MIC10YCL057C-A 294 nt9.97□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 TRM5YHR070W 1500 nt9.97□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 SNG1YGR197C 1644 nt9.96□□□□□ -0.81
PCL9Q12477 RAX1YOR301W 1308 nt9.96□□□□□ -0.82
PCL9Q12477 AQY1YPR192W 918 nt9.92□□□□□ -0.82
PCL9Q12477 HSP60YLR259C 1719 nt9.91□□□□□ -0.82
PCL9Q12477 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.4 ms