Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.26□□□□□ -0.61
PRP46Q12417 MEP2YNL142W 1500 nt11.25□□□□□ -0.61
PRP46Q12417 Q0182Q0182 405 nt11.19□□□□□ -0.62
PRP46Q12417 RPP2AYOL039W 321 nt11.18□□□□□ -0.62
PRP46Q12417 PTP1YDL230W 1008 nt11.16□□□□□ -0.62
PRP46Q12417 IMP2'YIL154C 1041 nt11.14□□□□□ -0.63
PRP46Q12417 DSK2YMR276W 1122 nt11.12□□□□□ -0.63
PRP46Q12417 YPR011CYPR011C 981 nt11.1□□□□□ -0.63
PRP46Q12417 TIR4YOR009W 1464 nt11.09□□□□□ -0.63
PRP46Q12417 YLR236CYLR236C 324 nt11.09□□□□□ -0.63
PRP46Q12417 YCH1YGR203W 447 nt11.08□□□□□ -0.64
PRP46Q12417 YJL152WYJL152W 360 nt11.05□□□□□ -0.64
PRP46Q12417 DCW1YKL046C 1350 nt11.04□□□□□ -0.64
PRP46Q12417 PET9YBL030C 957 nt11.03□□□□□ -0.64
PRP46Q12417 MOT3YMR070W 1473 nt11.02□□□□□ -0.65
PRP46Q12417 ART5YGR068C 1761 nt11.02□□□□□ -0.65
PRP46Q12417 FMP45YDL222C 930 nt11□□□□□ -0.65
PRP46Q12417 GFD2YCL036W 1701 nt11□□□□□ -0.65
PRP46Q12417 CAC2YML102W 1407 nt11□□□□□ -0.65
PRP46Q12417 IDH1YNL037C 1083 nt10.96□□□□□ -0.65
PRP46Q12417 EMI2YDR516C 1503 nt10.94□□□□□ -0.66
PRP46Q12417 ERV46YAL042W 1248 nt10.93□□□□□ -0.66
PRP46Q12417 YMR057CYMR057C 372 nt10.91□□□□□ -0.66
PRP46Q12417 YDL221WYDL221W 552 nt10.88□□□□□ -0.67
PRP46Q12417 LPX1YOR084W 1164 nt10.87□□□□□ -0.67
PRP46Q12417 IRC15YPL017C 1500 nt10.87□□□□□ -0.67
PRP46Q12417 SSA4YER103W 1929 nt10.86□□□□□ -0.67
PRP46Q12417 GBP2YCL011C 1284 nt10.84□□□□□ -0.67
PRP46Q12417 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.83□□□□□ -0.68
PRP46Q12417 YMR090WYMR090W 684 nt10.82□□□□□ -0.68
PRP46Q12417 FPS1YLL043W 2010 nt10.81□□□□□ -0.68
PRP46Q12417 YDR433WYDR433W 441 nt10.8□□□□□ -0.68
PRP46Q12417 RTS2YOR077W 699 nt10.8□□□□□ -0.68
PRP46Q12417 YKR040CYKR040C 504 nt10.79□□□□□ -0.68
PRP46Q12417 CUE1YMR264W 612 nt10.77□□□□□ -0.69
PRP46Q12417 GIS3YLR094C 1509 nt10.74□□□□□ -0.69
PRP46Q12417 MXR2YCL033C 507 nt10.73□□□□□ -0.69
PRP46Q12417 TCD2YKL027W 1344 nt10.72□□□□□ -0.69
PRP46Q12417 RRD1YIL153W 1182 nt10.71□□□□□ -0.69
PRP46Q12417 SDH1YKL148C 1923 nt10.71□□□□□ -0.69
PRP46Q12417 SPP1YPL138C 1062 nt10.7□□□□□ -0.7
PRP46Q12417 YBR220CYBR220C 1683 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP46Q12417 DED1YOR204W 1815 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP46Q12417 MRPL8YJL063C 717 nt10.68□□□□□ -0.7
PRP46Q12417 SCC4YER147C 1875 nt10.66□□□□□ -0.7
PRP46Q12417 FRD1YEL047C 1413 nt10.59□□□□□ -0.71
PRP46Q12417 FMT1YBL013W 1206 nt10.59□□□□□ -0.71
PRP46Q12417 RTG1YOL067C 534 nt10.59□□□□□ -0.71
PRP46Q12417 SOR2YDL246C 1074 nt10.58□□□□□ -0.72
PRP46Q12417 YIL100WYIL100W 354 nt10.58□□□□□ -0.72
PRP46Q12417 SOR1YJR159W 1074 nt10.58□□□□□ -0.72
PRP46Q12417 FMP52YER004W 696 nt10.57□□□□□ -0.72
PRP46Q12417 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.55□□□□□ -0.72
PRP46Q12417 YEL076CYEL076C 651 nt10.55□□□□□ -0.72
PRP46Q12417 YLR464WYLR464W 651 nt10.55□□□□□ -0.72
PRP46Q12417 ADO1YJR105W 1023 nt10.52□□□□□ -0.73
PRP46Q12417 YCL042WYCL042W 360 nt10.48□□□□□ -0.73
PRP46Q12417 BDF1YLR399C 2061 nt10.43□□□□□ -0.74
PRP46Q12417 ADH2YMR303C 1047 nt10.42□□□□□ -0.74
PRP46Q12417 CWP1YKL096W 720 nt10.41□□□□□ -0.74
PRP46Q12417 YLR235CYLR235C 399 nt10.39□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 YNL195CYNL195C 786 nt10.38□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 PCM1YEL058W 1674 nt10.38□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 YSC84YHR016C 1407 nt10.36□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 PTH1YHR189W 573 nt10.36□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 HUA1YGR268C 597 nt10.35□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 YKL030WYKL030W 606 nt10.35□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 RRT12YCR045C 1476 nt10.35□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 YHL050CYHL050C 2094 nt10.34□□□□□ -0.75
PRP46Q12417 TAT1YBR069C 1860 nt10.32□□□□□ -0.76
PRP46Q12417 SNF6YHL025W 999 nt10.32□□□□□ -0.76
PRP46Q12417 SEC11YIR022W 504 nt10.31□□□□□ -0.76
PRP46Q12417 YIH1YCR059C 777 nt10.29□□□□□ -0.76
PRP46Q12417 LCB1YMR296C 1677 nt10.28□□□□□ -0.76
PRP46Q12417 DIC1YLR348C 897 nt10.28□□□□□ -0.76
PRP46Q12417 RNQ1YCL028W 1218 nt10.27□□□□□ -0.77
PRP46Q12417 TIM23YNR017W 669 nt10.23□□□□□ -0.77
PRP46Q12417 PAC11YDR488C 1602 nt10.21□□□□□ -0.78
PRP46Q12417 UBX6YJL048C 1191 nt10.2□□□□□ -0.78
PRP46Q12417 PCH2YBR186W 1695 nt10.19□□□□□ -0.78
PRP46Q12417 BIO4YNR057C 714 nt10.19□□□□□ -0.78
PRP46Q12417 YJL225CYJL225C 5277 nt10.18□□□□□ -0.78
PRP46Q12417 YDR094WYDR094W 336 nt10.16□□□□□ -0.78
PRP46Q12417 SIM1YIL123W 1431 nt10.15□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 GUT2YIL155C 1950 nt10.14□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 YLL053CYLL053C 459 nt10.14□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 YLR179CYLR179C 606 nt10.14□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 WSC2YNL283C 1512 nt10.12□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 FTR1YER145C 1215 nt10.11□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 AHT1YHR093W 549 nt10.11□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.1□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 AQY1YPR192W 918 nt10.1□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 YPR064WYPR064W 420 nt10.09□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 NCP1YHR042W 2076 nt10.09□□□□□ -0.79
PRP46Q12417 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.08□□□□□ -0.8
PRP46Q12417 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.08□□□□□ -0.8
PRP46Q12417 GAL1YBR020W 1587 nt10.06□□□□□ -0.8
PRP46Q12417 TAD3YLR316C 969 nt10.06□□□□□ -0.8
PRP46Q12417 ERF2YLR246W 1080 nt10.03□□□□□ -0.8
PRP46Q12417 PIB2YGL023C 1908 nt10.03□□□□□ -0.8
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