Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 YPR011CYPR011C 981 nt12.89□□□□□ -0.35
HRT3Q12347 MEP2YNL142W 1500 nt12.88□□□□□ -0.35
HRT3Q12347 DSK2YMR276W 1122 nt12.88□□□□□ -0.35
HRT3Q12347 YDR095CYDR095C 411 nt12.87□□□□□ -0.35
HRT3Q12347 IMP2'YIL154C 1041 nt12.84□□□□□ -0.35
HRT3Q12347 YLR236CYLR236C 324 nt12.84□□□□□ -0.35
HRT3Q12347 FMP45YDL222C 930 nt12.82□□□□□ -0.36
HRT3Q12347 SIS1YNL007C 1059 nt12.75□□□□□ -0.37
HRT3Q12347 YJL152WYJL152W 360 nt12.72□□□□□ -0.37
HRT3Q12347 YCH1YGR203W 447 nt12.71□□□□□ -0.37
HRT3Q12347 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.71□□□□□ -0.37
HRT3Q12347 DCW1YKL046C 1350 nt12.66□□□□□ -0.38
HRT3Q12347 TIR4YOR009W 1464 nt12.63□□□□□ -0.39
HRT3Q12347 RPP2AYOL039W 321 nt12.62□□□□□ -0.39
HRT3Q12347 BDF1YLR399C 2061 nt12.61□□□□□ -0.39
HRT3Q12347 IDH1YNL037C 1083 nt12.61□□□□□ -0.39
HRT3Q12347 ERV46YAL042W 1248 nt12.6□□□□□ -0.39
HRT3Q12347 LPX1YOR084W 1164 nt12.6□□□□□ -0.39
HRT3Q12347 PTP1YDL230W 1008 nt12.56□□□□□ -0.4
HRT3Q12347 MRPL8YJL063C 717 nt12.52□□□□□ -0.41
HRT3Q12347 ART5YGR068C 1761 nt12.51□□□□□ -0.41
HRT3Q12347 YMR090WYMR090W 684 nt12.51□□□□□ -0.41
HRT3Q12347 EMI2YDR516C 1503 nt12.5□□□□□ -0.41
HRT3Q12347 YDR433WYDR433W 441 nt12.49□□□□□ -0.41
HRT3Q12347 PET9YBL030C 957 nt12.48□□□□□ -0.41
HRT3Q12347 SPP1YPL138C 1062 nt12.47□□□□□ -0.41
HRT3Q12347 GBP2YCL011C 1284 nt12.47□□□□□ -0.41
HRT3Q12347 CAC2YML102W 1407 nt12.45□□□□□ -0.42
HRT3Q12347 TAT1YBR069C 1860 nt12.45□□□□□ -0.42
HRT3Q12347 YKR040CYKR040C 504 nt12.45□□□□□ -0.42
HRT3Q12347 GFD2YCL036W 1701 nt12.45□□□□□ -0.42
HRT3Q12347 YMR057CYMR057C 372 nt12.44□□□□□ -0.42
HRT3Q12347 YBR220CYBR220C 1683 nt12.4□□□□□ -0.42
HRT3Q12347 MXR2YCL033C 507 nt12.38□□□□□ -0.43
HRT3Q12347 YDL221WYDL221W 552 nt12.37□□□□□ -0.43
HRT3Q12347 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.37□□□□□ -0.43
HRT3Q12347 RTG1YOL067C 534 nt12.35□□□□□ -0.43
HRT3Q12347 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.34□□□□□ -0.43
HRT3Q12347 YEL076CYEL076C 651 nt12.34□□□□□ -0.43
HRT3Q12347 ADO1YJR105W 1023 nt12.34□□□□□ -0.43
HRT3Q12347 YLR464WYLR464W 651 nt12.34□□□□□ -0.43
HRT3Q12347 SDH1YKL148C 1923 nt12.31□□□□□ -0.44
HRT3Q12347 TCD2YKL027W 1344 nt12.28□□□□□ -0.44
HRT3Q12347 FPS1YLL043W 2010 nt12.25□□□□□ -0.45
HRT3Q12347 RTS2YOR077W 699 nt12.24□□□□□ -0.45
HRT3Q12347 DED1YOR204W 1815 nt12.23□□□□□ -0.45
HRT3Q12347 RRD1YIL153W 1182 nt12.21□□□□□ -0.45
HRT3Q12347 IRC15YPL017C 1500 nt12.21□□□□□ -0.46
HRT3Q12347 SCC4YER147C 1875 nt12.17□□□□□ -0.46
HRT3Q12347 FRD1YEL047C 1413 nt12.17□□□□□ -0.46
HRT3Q12347 CUE1YMR264W 612 nt12.14□□□□□ -0.47
HRT3Q12347 UBX6YJL048C 1191 nt12.11□□□□□ -0.47
HRT3Q12347 HUA1YGR268C 597 nt12.09□□□□□ -0.47
HRT3Q12347 FMT1YBL013W 1206 nt12.09□□□□□ -0.47
HRT3Q12347 GIS3YLR094C 1509 nt12.09□□□□□ -0.47
HRT3Q12347 SOR2YDL246C 1074 nt12.07□□□□□ -0.48
HRT3Q12347 SOR1YJR159W 1074 nt12.07□□□□□ -0.48
HRT3Q12347 SEC11YIR022W 504 nt12.06□□□□□ -0.48
HRT3Q12347 PCH2YBR186W 1695 nt12.04□□□□□ -0.48
HRT3Q12347 YCL042WYCL042W 360 nt12.04□□□□□ -0.48
HRT3Q12347 PTH1YHR189W 573 nt12.01□□□□□ -0.49
HRT3Q12347 FMP52YER004W 696 nt11.99□□□□□ -0.49
HRT3Q12347 GUT2YIL155C 1950 nt11.98□□□□□ -0.49
HRT3Q12347 YIL100WYIL100W 354 nt11.97□□□□□ -0.49
HRT3Q12347 YLR235CYLR235C 399 nt11.97□□□□□ -0.49
HRT3Q12347 YKL030WYKL030W 606 nt11.96□□□□□ -0.49
HRT3Q12347 YDR094WYDR094W 336 nt11.94□□□□□ -0.5
HRT3Q12347 YSC84YHR016C 1407 nt11.94□□□□□ -0.5
HRT3Q12347 PAC11YDR488C 1602 nt11.91□□□□□ -0.5
HRT3Q12347 CWP1YKL096W 720 nt11.91□□□□□ -0.5
HRT3Q12347 ADH2YMR303C 1047 nt11.89□□□□□ -0.51
HRT3Q12347 LCB1YMR296C 1677 nt11.88□□□□□ -0.51
HRT3Q12347 YHL050CYHL050C 2094 nt11.83□□□□□ -0.52
HRT3Q12347 YNL195CYNL195C 786 nt11.81□□□□□ -0.52
HRT3Q12347 PCM1YEL058W 1674 nt11.8□□□□□ -0.52
HRT3Q12347 RRT12YCR045C 1476 nt11.79□□□□□ -0.52
HRT3Q12347 DIC1YLR348C 897 nt11.77□□□□□ -0.53
HRT3Q12347 SNF6YHL025W 999 nt11.76□□□□□ -0.53
HRT3Q12347 TIM23YNR017W 669 nt11.76□□□□□ -0.53
HRT3Q12347 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.75□□□□□ -0.53
HRT3Q12347 PIB2YGL023C 1908 nt11.74□□□□□ -0.53
HRT3Q12347 RTF1YGL244W 1677 nt11.73□□□□□ -0.53
HRT3Q12347 RNQ1YCL028W 1218 nt11.7□□□□□ -0.54
HRT3Q12347 YIH1YCR059C 777 nt11.69□□□□□ -0.54
HRT3Q12347 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.67□□□□□ -0.54
HRT3Q12347 YLR179CYLR179C 606 nt11.67□□□□□ -0.54
HRT3Q12347 BOP3YNL042W 1191 nt11.67□□□□□ -0.54
HRT3Q12347 YFR018CYFR018C 1092 nt11.62□□□□□ -0.55
HRT3Q12347 YPR064WYPR064W 420 nt11.62□□□□□ -0.55
HRT3Q12347 WSC2YNL283C 1512 nt11.6□□□□□ -0.55
HRT3Q12347 AHT1YHR093W 549 nt11.58□□□□□ -0.56
HRT3Q12347 TAD3YLR316C 969 nt11.58□□□□□ -0.56
HRT3Q12347 PAU16YKL224C 372 nt11.56□□□□□ -0.56
HRT3Q12347 YLL053CYLL053C 459 nt11.55□□□□□ -0.56
HRT3Q12347 BIO4YNR057C 714 nt11.55□□□□□ -0.56
HRT3Q12347 PRE6YOL038W 765 nt11.53□□□□□ -0.56
HRT3Q12347 PTK1YKL198C 1989 nt11.53□□□□□ -0.56
HRT3Q12347 SIM1YIL123W 1431 nt11.52□□□□□ -0.57
HRT3Q12347 RRT5YFR032C 870 nt11.51□□□□□ -0.57
HRT3Q12347 FTR1YER145C 1215 nt11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.1 ms