Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 MNP1YGL068W 585 nt12.21□□□□□ -0.45
RUP1Q12242 LSM3YLR438C-A 270 nt12.2□□□□□ -0.46
RUP1Q12242 TRM9YML014W 840 nt12.2□□□□□ -0.46
RUP1Q12242 IRC15YPL017C 1500 nt12.18□□□□□ -0.46
RUP1Q12242 SIS1YNL007C 1059 nt12.15□□□□□ -0.46
RUP1Q12242 CCT6YDR188W 1641 nt12.13□□□□□ -0.47
RUP1Q12242 GIS3YLR094C 1509 nt12.11□□□□□ -0.47
RUP1Q12242 RKM5YLR137W 1104 nt12.11□□□□□ -0.47
RUP1Q12242 YOR139CYOR139C 393 nt12.11□□□□□ -0.47
RUP1Q12242 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.09□□□□□ -0.47
RUP1Q12242 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.09□□□□□ -0.47
RUP1Q12242 NVJ2YPR091C 2313 nt12.06□□□□□ -0.48
RUP1Q12242 PIB2YGL023C 1908 nt12.05□□□□□ -0.48
RUP1Q12242 NPL3YDR432W 1245 nt12.02□□□□□ -0.49
RUP1Q12242 YOL037CYOL037C 354 nt12.02□□□□□ -0.49
RUP1Q12242 YSC84YHR016C 1407 nt12.02□□□□□ -0.49
RUP1Q12242 GFD2YCL036W 1701 nt12□□□□□ -0.49
RUP1Q12242 ART5YGR068C 1761 nt11.97□□□□□ -0.49
RUP1Q12242 YHL050CYHL050C 2094 nt11.95□□□□□ -0.5
RUP1Q12242 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.94□□□□□ -0.5
RUP1Q12242 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.94□□□□□ -0.5
RUP1Q12242 RTF1YGL244W 1677 nt11.93□□□□□ -0.5
RUP1Q12242 PET9YBL030C 957 nt11.91□□□□□ -0.5
RUP1Q12242 RTS2YOR077W 699 nt11.88□□□□□ -0.51
RUP1Q12242 CUE1YMR264W 612 nt11.85□□□□□ -0.51
RUP1Q12242 BOP3YNL042W 1191 nt11.84□□□□□ -0.51
RUP1Q12242 YCH1YGR203W 447 nt11.83□□□□□ -0.52
RUP1Q12242 RRT12YCR045C 1476 nt11.83□□□□□ -0.52
RUP1Q12242 YNL195CYNL195C 786 nt11.78□□□□□ -0.52
RUP1Q12242 PTK1YKL198C 1989 nt11.76□□□□□ -0.53
RUP1Q12242 YLR281CYLR281C 468 nt11.72□□□□□ -0.53
RUP1Q12242 YIL100WYIL100W 354 nt11.7□□□□□ -0.54
RUP1Q12242 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.69□□□□□ -0.54
RUP1Q12242 WHI5YOR083W 888 nt11.69□□□□□ -0.54
RUP1Q12242 TIR4YOR009W 1464 nt11.69□□□□□ -0.54
RUP1Q12242 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.64□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.64□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.64□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.64□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.64□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 YMR057CYMR057C 372 nt11.63□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 NCP1YHR042W 2076 nt11.62□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 FPS1YLL043W 2010 nt11.61□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 YLR236CYLR236C 324 nt11.59□□□□□ -0.55
RUP1Q12242 PUS2YGL063W 1113 nt11.58□□□□□ -0.56
RUP1Q12242 YJL152WYJL152W 360 nt11.57□□□□□ -0.56
RUP1Q12242 Q0182Q0182 405 nt11.51□□□□□ -0.57
RUP1Q12242 YFL054CYFL054C 1941 nt11.48□□□□□ -0.57
RUP1Q12242 IMP2'YIL154C 1041 nt11.47□□□□□ -0.57
RUP1Q12242 SPT8YLR055C 1809 nt11.45□□□□□ -0.58
RUP1Q12242 DSK2YMR276W 1122 nt11.45□□□□□ -0.58
RUP1Q12242 BOR1YNL275W 1731 nt11.44□□□□□ -0.58
RUP1Q12242 IDH1YNL037C 1083 nt11.39□□□□□ -0.59
RUP1Q12242 YPR011CYPR011C 981 nt11.37□□□□□ -0.59
RUP1Q12242 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.37□□□□□ -0.59
RUP1Q12242 LCB1YMR296C 1677 nt11.36□□□□□ -0.59
RUP1Q12242 FMP45YDL222C 930 nt11.29□□□□□ -0.6
RUP1Q12242 GBP2YCL011C 1284 nt11.29□□□□□ -0.6
RUP1Q12242 UME6YDR207C 2511 nt11.25□□□□□ -0.61
RUP1Q12242 ERV46YAL042W 1248 nt11.23□□□□□ -0.61
RUP1Q12242 YDR433WYDR433W 441 nt11.21□□□□□ -0.61
RUP1Q12242 SWE1YJL187C 2460 nt11.21□□□□□ -0.61
RUP1Q12242 LPX1YOR084W 1164 nt11.2□□□□□ -0.62
RUP1Q12242 TCD2YKL027W 1344 nt11.17□□□□□ -0.62
RUP1Q12242 MOT3YMR070W 1473 nt11.16□□□□□ -0.62
RUP1Q12242 LYS4YDR234W 2082 nt11.16□□□□□ -0.62
RUP1Q12242 HSP60YLR259C 1719 nt11.15□□□□□ -0.62
RUP1Q12242 RRD1YIL153W 1182 nt11.15□□□□□ -0.62
RUP1Q12242 FMP52YER004W 696 nt11.13□□□□□ -0.63
RUP1Q12242 YKR040CYKR040C 504 nt11.13□□□□□ -0.63
RUP1Q12242 MXR2YCL033C 507 nt11.13□□□□□ -0.63
RUP1Q12242 DED1YOR204W 1815 nt11.13□□□□□ -0.63
RUP1Q12242 SIM1YIL123W 1431 nt11.11□□□□□ -0.63
RUP1Q12242 PCM1YEL058W 1674 nt11.07□□□□□ -0.64
RUP1Q12242 ALG12YNR030W 1656 nt11.05□□□□□ -0.64
RUP1Q12242 GLK1YCL040W 1503 nt11.03□□□□□ -0.64
RUP1Q12242 FMT1YBL013W 1206 nt11.02□□□□□ -0.65
RUP1Q12242 SOR2YDL246C 1074 nt10.98□□□□□ -0.65
RUP1Q12242 SOR1YJR159W 1074 nt10.98□□□□□ -0.65
RUP1Q12242 BIO4YNR057C 714 nt10.98□□□□□ -0.65
RUP1Q12242 FRD1YEL047C 1413 nt10.97□□□□□ -0.65
RUP1Q12242 SPP1YPL138C 1062 nt10.96□□□□□ -0.65
RUP1Q12242 MCH5YOR306C 1566 nt10.95□□□□□ -0.66
RUP1Q12242 YCL042WYCL042W 360 nt10.95□□□□□ -0.66
RUP1Q12242 SNF6YHL025W 999 nt10.91□□□□□ -0.66
RUP1Q12242 ERF2YLR246W 1080 nt10.91□□□□□ -0.66
RUP1Q12242 FUR4YBR021W 1902 nt10.91□□□□□ -0.66
RUP1Q12242 CWP1YKL096W 720 nt10.9□□□□□ -0.66
RUP1Q12242 ADH2YMR303C 1047 nt10.89□□□□□ -0.67
RUP1Q12242 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.87□□□□□ -0.67
RUP1Q12242 CRR1YLR213C 1269 nt10.87□□□□□ -0.67
RUP1Q12242 PRP4YPR178W 1398 nt10.79□□□□□ -0.68
RUP1Q12242 AAC1YMR056C 930 nt10.79□□□□□ -0.68
RUP1Q12242 YIH1YCR059C 777 nt10.78□□□□□ -0.68
RUP1Q12242 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.78□□□□□ -0.68
RUP1Q12242 YEL076CYEL076C 651 nt10.78□□□□□ -0.68
RUP1Q12242 YLR464WYLR464W 651 nt10.78□□□□□ -0.68
RUP1Q12242 RAX1YOR301W 1308 nt10.78□□□□□ -0.68
RUP1Q12242 CCA1YER168C 1641 nt10.77□□□□□ -0.68
RUP1Q12242 HEM12YDR047W 1089 nt10.76□□□□□ -0.69
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