Protein–RNA interactions for Protein: Q12177

YLL056C, Uncharacterized protein YLL056C, yeastyeast

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL056CQ12177 ART5YGR068C 1761 nt12.58□□□□□ -0.39
YLL056CQ12177 YDL221WYDL221W 552 nt12.58□□□□□ -0.4
YLL056CQ12177 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.57□□□□□ -0.4
YLL056CQ12177 TIR4YOR009W 1464 nt12.55□□□□□ -0.4
YLL056CQ12177 GFD2YCL036W 1701 nt12.55□□□□□ -0.4
YLL056CQ12177 YLR281CYLR281C 468 nt12.53□□□□□ -0.4
YLL056CQ12177 PET9YBL030C 957 nt12.52□□□□□ -0.41
YLL056CQ12177 WHI5YOR083W 888 nt12.52□□□□□ -0.41
YLL056CQ12177 YCH1YGR203W 447 nt12.51□□□□□ -0.41
YLL056CQ12177 YJL152WYJL152W 360 nt12.49□□□□□ -0.41
YLL056CQ12177 IRC15YPL017C 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
YLL056CQ12177 YBR220CYBR220C 1683 nt12.45□□□□□ -0.42
YLL056CQ12177 RTS2YOR077W 699 nt12.43□□□□□ -0.42
YLL056CQ12177 SDH1YKL148C 1923 nt12.43□□□□□ -0.42
YLL056CQ12177 YMR057CYMR057C 372 nt12.41□□□□□ -0.42
YLL056CQ12177 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.38□□□□□ -0.43
YLL056CQ12177 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.38□□□□□ -0.43
YLL056CQ12177 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.38□□□□□ -0.43
YLL056CQ12177 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.38□□□□□ -0.43
YLL056CQ12177 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.38□□□□□ -0.43
YLL056CQ12177 GIS3YLR094C 1509 nt12.37□□□□□ -0.43
YLL056CQ12177 PUS2YGL063W 1113 nt12.37□□□□□ -0.43
YLL056CQ12177 SCC4YER147C 1875 nt12.35□□□□□ -0.43
YLL056CQ12177 BDF1YLR399C 2061 nt12.32□□□□□ -0.44
YLL056CQ12177 CUE1YMR264W 612 nt12.3□□□□□ -0.44
YLL056CQ12177 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.29□□□□□ -0.44
YLL056CQ12177 IMP2'YIL154C 1041 nt12.26□□□□□ -0.45
YLL056CQ12177 DSK2YMR276W 1122 nt12.26□□□□□ -0.45
YLL056CQ12177 FPS1YLL043W 2010 nt12.26□□□□□ -0.45
YLL056CQ12177 IDH1YNL037C 1083 nt12.24□□□□□ -0.45
YLL056CQ12177 YLR236CYLR236C 324 nt12.21□□□□□ -0.45
YLL056CQ12177 TAT1YBR069C 1860 nt12.19□□□□□ -0.46
YLL056CQ12177 YIL100WYIL100W 354 nt12.17□□□□□ -0.46
YLL056CQ12177 YPR011CYPR011C 981 nt12.15□□□□□ -0.46
YLL056CQ12177 GBP2YCL011C 1284 nt12.15□□□□□ -0.46
YLL056CQ12177 FMP45YDL222C 930 nt12.08□□□□□ -0.48
YLL056CQ12177 YSC84YHR016C 1407 nt12.06□□□□□ -0.48
YLL056CQ12177 YDR433WYDR433W 441 nt12.05□□□□□ -0.48
YLL056CQ12177 TCD2YKL027W 1344 nt12.04□□□□□ -0.48
YLL056CQ12177 YNL195CYNL195C 786 nt12.03□□□□□ -0.48
YLL056CQ12177 SEC11YIR022W 504 nt12.02□□□□□ -0.49
YLL056CQ12177 RRD1YIL153W 1182 nt12.01□□□□□ -0.49
YLL056CQ12177 ERV46YAL042W 1248 nt12□□□□□ -0.49
YLL056CQ12177 LPX1YOR084W 1164 nt12□□□□□ -0.49
YLL056CQ12177 RRT12YCR045C 1476 nt11.99□□□□□ -0.49
YLL056CQ12177 YHL050CYHL050C 2094 nt11.98□□□□□ -0.49
YLL056CQ12177 MXR2YCL033C 507 nt11.97□□□□□ -0.49
YLL056CQ12177 DED1YOR204W 1815 nt11.97□□□□□ -0.49
YLL056CQ12177 PCH2YBR186W 1695 nt11.95□□□□□ -0.5
YLL056CQ12177 YKR040CYKR040C 504 nt11.92□□□□□ -0.5
YLL056CQ12177 FMP52YER004W 696 nt11.91□□□□□ -0.5
YLL056CQ12177 GUT2YIL155C 1950 nt11.88□□□□□ -0.51
YLL056CQ12177 FMT1YBL013W 1206 nt11.86□□□□□ -0.51
YLL056CQ12177 MOT3YMR070W 1473 nt11.86□□□□□ -0.51
YLL056CQ12177 YCL042WYCL042W 360 nt11.8□□□□□ -0.52
YLL056CQ12177 SOR2YDL246C 1074 nt11.79□□□□□ -0.52
YLL056CQ12177 SOR1YJR159W 1074 nt11.79□□□□□ -0.52
YLL056CQ12177 CWP1YKL096W 720 nt11.78□□□□□ -0.52
YLL056CQ12177 FRD1YEL047C 1413 nt11.77□□□□□ -0.52
YLL056CQ12177 PCM1YEL058W 1674 nt11.77□□□□□ -0.53
YLL056CQ12177 ADH2YMR303C 1047 nt11.76□□□□□ -0.53
YLL056CQ12177 SPP1YPL138C 1062 nt11.71□□□□□ -0.53
YLL056CQ12177 SNF6YHL025W 999 nt11.7□□□□□ -0.54
YLL056CQ12177 RTF1YGL244W 1677 nt11.7□□□□□ -0.54
YLL056CQ12177 PIB2YGL023C 1908 nt11.68□□□□□ -0.54
YLL056CQ12177 BOP3YNL042W 1191 nt11.67□□□□□ -0.54
YLL056CQ12177 LCB1YMR296C 1677 nt11.65□□□□□ -0.54
YLL056CQ12177 SIM1YIL123W 1431 nt11.63□□□□□ -0.55
YLL056CQ12177 NCP1YHR042W 2076 nt11.62□□□□□ -0.55
YLL056CQ12177 BIO4YNR057C 714 nt11.59□□□□□ -0.55
YLL056CQ12177 YIH1YCR059C 777 nt11.56□□□□□ -0.56
YLL056CQ12177 PTH1YHR189W 573 nt11.55□□□□□ -0.56
YLL056CQ12177 RNQ1YCL028W 1218 nt11.54□□□□□ -0.56
YLL056CQ12177 DIC1YLR348C 897 nt11.53□□□□□ -0.56
YLL056CQ12177 YLR235CYLR235C 399 nt11.52□□□□□ -0.57
YLL056CQ12177 PTK1YKL198C 1989 nt11.5□□□□□ -0.57
YLL056CQ12177 YLL053CYLL053C 459 nt11.48□□□□□ -0.57
YLL056CQ12177 RTG1YOL067C 534 nt11.43□□□□□ -0.58
YLL056CQ12177 YKL030WYKL030W 606 nt11.42□□□□□ -0.58
YLL056CQ12177 ERF2YLR246W 1080 nt11.42□□□□□ -0.58
YLL056CQ12177 FTR1YER145C 1215 nt11.4□□□□□ -0.58
YLL056CQ12177 TIM23YNR017W 669 nt11.4□□□□□ -0.58
YLL056CQ12177 LYS4YDR234W 2082 nt11.39□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 CRR1YLR213C 1269 nt11.39□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.36□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 YEL076CYEL076C 651 nt11.36□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 YLR179CYLR179C 606 nt11.36□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 YLR464WYLR464W 651 nt11.36□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 GAL1YBR020W 1587 nt11.36□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 MRPL8YJL063C 717 nt11.35□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 ATF2YGR177C 1608 nt11.34□□□□□ -0.59
YLL056CQ12177 TRM5YHR070W 1500 nt11.33□□□□□ -0.6
YLL056CQ12177 YFL054CYFL054C 1941 nt11.33□□□□□ -0.6
YLL056CQ12177 AQY1YPR192W 918 nt11.32□□□□□ -0.6
YLL056CQ12177 YFL067WYFL067W 528 nt11.31□□□□□ -0.6
YLL056CQ12177 DDR2YOL052C-A 186 nt11.28□□□□□ -0.6
YLL056CQ12177 ADO1YJR105W 1023 nt11.27□□□□□ -0.61
YLL056CQ12177 HEM12YDR047W 1089 nt11.26□□□□□ -0.61
YLL056CQ12177 HUA1YGR268C 597 nt11.25□□□□□ -0.61
YLL056CQ12177 YPR064WYPR064W 420 nt11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.9 ms