Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SSF2Q12153 SIS1YNL007C 1059 nt14.37□□□□□ -0.11
SSF2Q12153 RPP2AYOL039W 321 nt14.35□□□□□ -0.11
SSF2Q12153 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.33□□□□□ -0.12
SSF2Q12153 PUS2YGL063W 1113 nt14.32□□□□□ -0.12
SSF2Q12153 YJL152WYJL152W 360 nt14.25□□□□□ -0.13
SSF2Q12153 DCW1YKL046C 1350 nt14.24□□□□□ -0.13
SSF2Q12153 PTP1YDL230W 1008 nt14.24□□□□□ -0.13
SSF2Q12153 TIR4YOR009W 1464 nt14.17□□□□□ -0.14
SSF2Q12153 ART5YGR068C 1761 nt14.17□□□□□ -0.14
SSF2Q12153 CAC2YML102W 1407 nt14.13□□□□□ -0.15
SSF2Q12153 DSK2YMR276W 1122 nt14.1□□□□□ -0.15
SSF2Q12153 YCH1YGR203W 447 nt14.09□□□□□ -0.15
SSF2Q12153 PET9YBL030C 957 nt14.09□□□□□ -0.15
SSF2Q12153 EMI2YDR516C 1503 nt14.09□□□□□ -0.15
SSF2Q12153 GFD2YCL036W 1701 nt14.08□□□□□ -0.16
SSF2Q12153 IMP2'YIL154C 1041 nt14.08□□□□□ -0.16
SSF2Q12153 SSA4YER103W 1929 nt14.04□□□□□ -0.16
SSF2Q12153 YMR057CYMR057C 372 nt14.03□□□□□ -0.16
SSF2Q12153 YLR236CYLR236C 324 nt14.02□□□□□ -0.17
SSF2Q12153 YMR090WYMR090W 684 nt14.01□□□□□ -0.17
SSF2Q12153 YPR011CYPR011C 981 nt14□□□□□ -0.17
SSF2Q12153 IDH1YNL037C 1083 nt13.99□□□□□ -0.17
SSF2Q12153 YDL221WYDL221W 552 nt13.98□□□□□ -0.17
SSF2Q12153 FMP45YDL222C 930 nt13.98□□□□□ -0.17
SSF2Q12153 RTS2YOR077W 699 nt13.94□□□□□ -0.18
SSF2Q12153 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.93□□□□□ -0.18
SSF2Q12153 IRC15YPL017C 1500 nt13.9□□□□□ -0.18
SSF2Q12153 GBP2YCL011C 1284 nt13.87□□□□□ -0.19
SSF2Q12153 YDR433WYDR433W 441 nt13.83□□□□□ -0.2
SSF2Q12153 GIS3YLR094C 1509 nt13.81□□□□□ -0.2
SSF2Q12153 LPX1YOR084W 1164 nt13.8□□□□□ -0.2
SSF2Q12153 FPS1YLL043W 2010 nt13.8□□□□□ -0.2
SSF2Q12153 CUE1YMR264W 612 nt13.79□□□□□ -0.2
SSF2Q12153 SDH1YKL148C 1923 nt13.78□□□□□ -0.2
SSF2Q12153 ERV46YAL042W 1248 nt13.77□□□□□ -0.21
SSF2Q12153 YBR220CYBR220C 1683 nt13.75□□□□□ -0.21
SSF2Q12153 SCC4YER147C 1875 nt13.74□□□□□ -0.21
SSF2Q12153 TCD2YKL027W 1344 nt13.7□□□□□ -0.22
SSF2Q12153 MXR2YCL033C 507 nt13.7□□□□□ -0.22
SSF2Q12153 YKR040CYKR040C 504 nt13.68□□□□□ -0.22
SSF2Q12153 YIL100WYIL100W 354 nt13.67□□□□□ -0.22
SSF2Q12153 RRD1YIL153W 1182 nt13.61□□□□□ -0.23
SSF2Q12153 DED1YOR204W 1815 nt13.57□□□□□ -0.24
SSF2Q12153 SPP1YPL138C 1062 nt13.55□□□□□ -0.24
SSF2Q12153 YNL195CYNL195C 786 nt13.47□□□□□ -0.25
SSF2Q12153 FMT1YBL013W 1206 nt13.45□□□□□ -0.26
SSF2Q12153 YCL042WYCL042W 360 nt13.45□□□□□ -0.26
SSF2Q12153 FRD1YEL047C 1413 nt13.43□□□□□ -0.26
SSF2Q12153 FMP52YER004W 696 nt13.43□□□□□ -0.26
SSF2Q12153 BDF1YLR399C 2061 nt13.43□□□□□ -0.26
SSF2Q12153 YSC84YHR016C 1407 nt13.39□□□□□ -0.27
SSF2Q12153 SOR2YDL246C 1074 nt13.38□□□□□ -0.27
SSF2Q12153 SOR1YJR159W 1074 nt13.38□□□□□ -0.27
SSF2Q12153 RRT12YCR045C 1476 nt13.37□□□□□ -0.27
SSF2Q12153 CWP1YKL096W 720 nt13.37□□□□□ -0.27
SSF2Q12153 ADH2YMR303C 1047 nt13.33□□□□□ -0.28
SSF2Q12153 YHL050CYHL050C 2094 nt13.29□□□□□ -0.28
SSF2Q12153 SEC11YIR022W 504 nt13.28□□□□□ -0.28
SSF2Q12153 MRPL8YJL063C 717 nt13.28□□□□□ -0.28
SSF2Q12153 PCM1YEL058W 1674 nt13.28□□□□□ -0.28
SSF2Q12153 TAT1YBR069C 1860 nt13.27□□□□□ -0.28
SSF2Q12153 PTH1YHR189W 573 nt13.26□□□□□ -0.29
SSF2Q12153 RTG1YOL067C 534 nt13.26□□□□□ -0.29
SSF2Q12153 SNF6YHL025W 999 nt13.24□□□□□ -0.29
SSF2Q12153 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.23□□□□□ -0.29
SSF2Q12153 YEL076CYEL076C 651 nt13.23□□□□□ -0.29
SSF2Q12153 YLR464WYLR464W 651 nt13.23□□□□□ -0.29
SSF2Q12153 ADO1YJR105W 1023 nt13.19□□□□□ -0.3
SSF2Q12153 YLR235CYLR235C 399 nt13.19□□□□□ -0.3
SSF2Q12153 PCH2YBR186W 1695 nt13.15□□□□□ -0.3
SSF2Q12153 YKL030WYKL030W 606 nt13.12□□□□□ -0.31
SSF2Q12153 DIC1YLR348C 897 nt13.11□□□□□ -0.31
SSF2Q12153 SIM1YIL123W 1431 nt13.08□□□□□ -0.32
SSF2Q12153 HUA1YGR268C 597 nt13.08□□□□□ -0.32
SSF2Q12153 YIH1YCR059C 777 nt13.07□□□□□ -0.32
SSF2Q12153 RNQ1YCL028W 1218 nt13.07□□□□□ -0.32
SSF2Q12153 LCB1YMR296C 1677 nt13.06□□□□□ -0.32
SSF2Q12153 GUT2YIL155C 1950 nt13.06□□□□□ -0.32
SSF2Q12153 TIM23YNR017W 669 nt13.03□□□□□ -0.32
SSF2Q12153 BIO4YNR057C 714 nt13.03□□□□□ -0.32
SSF2Q12153 YLL053CYLL053C 459 nt12.98□□□□□ -0.33
SSF2Q12153 YLR179CYLR179C 606 nt12.97□□□□□ -0.33
SSF2Q12153 BOP3YNL042W 1191 nt12.91□□□□□ -0.34
SSF2Q12153 RTF1YGL244W 1677 nt12.9□□□□□ -0.34
SSF2Q12153 FTR1YER145C 1215 nt12.89□□□□□ -0.35
SSF2Q12153 NCP1YHR042W 2076 nt12.87□□□□□ -0.35
SSF2Q12153 YPR064WYPR064W 420 nt12.86□□□□□ -0.35
SSF2Q12153 GAL1YBR020W 1587 nt12.85□□□□□ -0.35
SSF2Q12153 ERF2YLR246W 1080 nt12.84□□□□□ -0.35
SSF2Q12153 AQY1YPR192W 918 nt12.83□□□□□ -0.36
SSF2Q12153 TRM5YHR070W 1500 nt12.83□□□□□ -0.36
SSF2Q12153 PIB2YGL023C 1908 nt12.82□□□□□ -0.36
SSF2Q12153 WSC2YNL283C 1512 nt12.8□□□□□ -0.36
SSF2Q12153 AHT1YHR093W 549 nt12.79□□□□□ -0.36
SSF2Q12153 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.78□□□□□ -0.36
SSF2Q12153 ATF2YGR177C 1608 nt12.77□□□□□ -0.36
SSF2Q12153 TAD3YLR316C 969 nt12.77□□□□□ -0.37
SSF2Q12153 DDR2YOL052C-A 186 nt12.77□□□□□ -0.37
SSF2Q12153 YFL067WYFL067W 528 nt12.76□□□□□ -0.37
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