Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	PIB2	YGL023C	1908 nt		11.79	□□□□□ -0.52
VIK1	Q12045	IRC15	YPL017C	1500 nt		11.75	□□□□□ -0.53
VIK1	Q12045	YSC84	YHR016C	1407 nt		11.74	□□□□□ -0.53
VIK1	Q12045	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		11.73	□□□□□ -0.53
VIK1	Q12045	RTF1	YGL244W	1677 nt		11.72	□□□□□ -0.53
VIK1	Q12045	YGR021W	YGR021W	873 nt		11.72	□□□□□ -0.53
VIK1	Q12045	GIS3	YLR094C	1509 nt		11.7	□□□□□ -0.54
VIK1	Q12045	FPS1	YLL043W	2010 nt		11.68	□□□□□ -0.54
VIK1	Q12045	GFD2	YCL036W	1701 nt		11.64	□□□□□ -0.55
VIK1	Q12045	ART5	YGR068C	1761 nt		11.64	□□□□□ -0.55
VIK1	Q12045	YHL050C	YHL050C	2094 nt		11.62	□□□□□ -0.55
VIK1	Q12045	HOM6	YJR139C	1080 nt		11.61	□□□□□ -0.55
VIK1	Q12045	BOP3	YNL042W	1191 nt		11.6	□□□□□ -0.55
VIK1	Q12045	PET9	YBL030C	957 nt		11.59	□□□□□ -0.55
VIK1	Q12045	YJL225C	YJL225C	5277 nt		11.57	□□□□□ -0.56
VIK1	Q12045	SHU1	YHL006C	453 nt		11.57	□□□□□ -0.56
VIK1	Q12045	RTS2	YOR077W	699 nt		11.56	□□□□□ -0.56
VIK1	Q12045	YCH1	YGR203W	447 nt		11.55	□□□□□ -0.56
VIK1	Q12045	BOR1	YNL275W	1731 nt		11.53	□□□□□ -0.56
VIK1	Q12045	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		11.52	□□□□□ -0.57
VIK1	Q12045	PTK1	YKL198C	1989 nt		11.51	□□□□□ -0.57
VIK1	Q12045	CUE1	YMR264W	612 nt		11.49	□□□□□ -0.57
VIK1	Q12045	RRT12	YCR045C	1476 nt		11.48	□□□□□ -0.57
VIK1	Q12045	MNP1	YGL068W	585 nt		11.46	□□□□□ -0.57
VIK1	Q12045	RKM5	YLR137W	1104 nt		11.45	□□□□□ -0.58
VIK1	Q12045	YNL195C	YNL195C	786 nt		11.45	□□□□□ -0.58
VIK1	Q12045	TIR4	YOR009W	1464 nt		11.44	□□□□□ -0.58
VIK1	Q12045	UME6	YDR207C	2511 nt		11.42	□□□□□ -0.58
VIK1	Q12045	YIL100W	YIL100W	354 nt		11.38	□□□□□ -0.59
VIK1	Q12045	YMR057C	YMR057C	372 nt		11.37	□□□□□ -0.59
VIK1	Q12045	YFL054C	YFL054C	1941 nt		11.3	□□□□□ -0.6
VIK1	Q12045	YLR236C	YLR236C	324 nt		11.29	□□□□□ -0.6
VIK1	Q12045	NPL3	YDR432W	1245 nt		11.27	□□□□□ -0.61
VIK1	Q12045	YKL097C	YKL097C	411 nt		11.27	□□□□□ -0.61
VIK1	Q12045	SPT8	YLR055C	1809 nt		11.24	□□□□□ -0.61
VIK1	Q12045	NCP1	YHR042W	2076 nt		11.23	□□□□□ -0.61
VIK1	Q12045	YJL152W	YJL152W	360 nt		11.22	□□□□□ -0.61
VIK1	Q12045	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		11.21	□□□□□ -0.61
VIK1	Q12045	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		11.19	□□□□□ -0.62
VIK1	Q12045	YOL037C	YOL037C	354 nt		11.16	□□□□□ -0.62
VIK1	Q12045	MCH5	YOR306C	1566 nt		11.12	□□□□□ -0.63
VIK1	Q12045	HSP60	YLR259C	1719 nt		11.09	□□□□□ -0.63
VIK1	Q12045	ALG12	YNR030W	1656 nt		11.06	□□□□□ -0.64
VIK1	Q12045	SWE1	YJL187C	2460 nt		10.98	□□□□□ -0.65
VIK1	Q12045	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		10.97	□□□□□ -0.65
VIK1	Q12045	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		10.97	□□□□□ -0.65
VIK1	Q12045	LCB1	YMR296C	1677 nt		10.94	□□□□□ -0.66
VIK1	Q12045	WHI5	YOR083W	888 nt		10.93	□□□□□ -0.66
VIK1	Q12045	GLK1	YCL040W	1503 nt		10.93	□□□□□ -0.66
VIK1	Q12045	FMP52	YER004W	696 nt		10.9	□□□□□ -0.66
VIK1	Q12045	IDH1	YNL037C	1083 nt		10.9	□□□□□ -0.66
VIK1	Q12045	RRD1	YIL153W	1182 nt		10.89	□□□□□ -0.67
VIK1	Q12045	YLR281C	YLR281C	468 nt		10.89	□□□□□ -0.67
VIK1	Q12045	YOR139C	YOR139C	393 nt		10.85	□□□□□ -0.67
VIK1	Q12045	GBP2	YCL011C	1284 nt		10.85	□□□□□ -0.67
VIK1	Q12045	TCD2	YKL027W	1344 nt		10.83	□□□□□ -0.68
VIK1	Q12045	SIM1	YIL123W	1431 nt		10.81	□□□□□ -0.68
VIK1	Q12045	PCM1	YEL058W	1674 nt		10.8	□□□□□ -0.68
VIK1	Q12045	DSK2	YMR276W	1122 nt		10.78	□□□□□ -0.68
VIK1	Q12045	DED1	YOR204W	1815 nt		10.78	□□□□□ -0.68
VIK1	Q12045	IMP2'	YIL154C	1041 nt		10.76	□□□□□ -0.69
VIK1	Q12045	NAR1	YNL240C	1476 nt		10.75	□□□□□ -0.69
VIK1	Q12045	Q0182	Q0182	405 nt		10.73	□□□□□ -0.69
VIK1	Q12045	FUR4	YBR021W	1902 nt		10.73	□□□□□ -0.69
VIK1	Q12045	LYS4	YDR234W	2082 nt		10.71	□□□□□ -0.69
VIK1	Q12045	FMT1	YBL013W	1206 nt		10.71	□□□□□ -0.69
VIK1	Q12045	SNF6	YHL025W	999 nt		10.7	□□□□□ -0.7
VIK1	Q12045	AAC1	YMR056C	930 nt		10.7	□□□□□ -0.7
VIK1	Q12045	CWP1	YKL096W	720 nt		10.69	□□□□□ -0.7
VIK1	Q12045	BIO4	YNR057C	714 nt		10.69	□□□□□ -0.7
VIK1	Q12045	ADH2	YMR303C	1047 nt		10.68	□□□□□ -0.7
VIK1	Q12045	PRP4	YPR178W	1398 nt		10.66	□□□□□ -0.7
VIK1	Q12045	YDR433W	YDR433W	441 nt		10.63	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	YEL076C-A	YEL076C-A	651 nt		10.62	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	YEL076C	YEL076C	651 nt		10.62	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	PUS2	YGL063W	1113 nt		10.62	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	ERF2	YLR246W	1080 nt		10.62	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	YLR464W	YLR464W	651 nt		10.62	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	SOR2	YDL246C	1074 nt		10.61	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	SOR1	YJR159W	1074 nt		10.61	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	DPS1	YLL018C	1674 nt		10.6	□□□□□ -0.71
VIK1	Q12045	YCL042W	YCL042W	360 nt		10.58	□□□□□ -0.72
VIK1	Q12045	CRR1	YLR213C	1269 nt		10.57	□□□□□ -0.72
VIK1	Q12045	MXR2	YCL033C	507 nt		10.57	□□□□□ -0.72
VIK1	Q12045	YIH1	YCR059C	777 nt		10.56	□□□□□ -0.72
VIK1	Q12045	FMP45	YDL222C	930 nt		10.56	□□□□□ -0.72
VIK1	Q12045	BMT6	YLR063W	1098 nt		10.56	□□□□□ -0.72
VIK1	Q12045	RPM1	RPM1	483 nt		10.52	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	RNQ1	YCL028W	1218 nt		10.51	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	BIO5	YNR056C	1686 nt		10.5	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	YHR056W-A	YHR056W-A	435 nt		10.5	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	ERV46	YAL042W	1248 nt		10.5	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	YLL053C	YLL053C	459 nt		10.5	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		10.49	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		10.49	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		10.49	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		10.49	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		10.49	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	CYT2	YKL087C	675 nt		10.49	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	YPR011C	YPR011C	981 nt		10.49	□□□□□ -0.73

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