Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 YDR095CYDR095C 411 nt12.15□□□□□ -0.46
TRM8Q12009 MEP2YNL142W 1500 nt12.12□□□□□ -0.47
TRM8Q12009 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.11□□□□□ -0.47
TRM8Q12009 NVJ2YPR091C 2313 nt12.11□□□□□ -0.47
TRM8Q12009 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.1□□□□□ -0.47
TRM8Q12009 SSA4YER103W 1929 nt12.05□□□□□ -0.48
TRM8Q12009 FPS1YLL043W 2010 nt12.03□□□□□ -0.48
TRM8Q12009 SIS1YNL007C 1059 nt12.02□□□□□ -0.49
TRM8Q12009 IMP2'YIL154C 1041 nt11.99□□□□□ -0.49
TRM8Q12009 DSK2YMR276W 1122 nt11.99□□□□□ -0.49
TRM8Q12009 YPR011CYPR011C 981 nt11.96□□□□□ -0.49
TRM8Q12009 YLR236CYLR236C 324 nt11.95□□□□□ -0.5
TRM8Q12009 DCW1YKL046C 1350 nt11.93□□□□□ -0.5
TRM8Q12009 YJL152WYJL152W 360 nt11.91□□□□□ -0.5
TRM8Q12009 RPP2AYOL039W 321 nt11.91□□□□□ -0.5
TRM8Q12009 FMP45YDL222C 930 nt11.89□□□□□ -0.51
TRM8Q12009 PTP1YDL230W 1008 nt11.87□□□□□ -0.51
TRM8Q12009 YCH1YGR203W 447 nt11.87□□□□□ -0.51
TRM8Q12009 TIR4YOR009W 1464 nt11.87□□□□□ -0.51
TRM8Q12009 ART5YGR068C 1761 nt11.8□□□□□ -0.52
TRM8Q12009 IDH1YNL037C 1083 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM8Q12009 EMI2YDR516C 1503 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM8Q12009 PET9YBL030C 957 nt11.77□□□□□ -0.53
TRM8Q12009 YMR090WYMR090W 684 nt11.76□□□□□ -0.53
TRM8Q12009 ERV46YAL042W 1248 nt11.74□□□□□ -0.53
TRM8Q12009 GFD2YCL036W 1701 nt11.74□□□□□ -0.53
TRM8Q12009 CAC2YML102W 1407 nt11.73□□□□□ -0.53
TRM8Q12009 LPX1YOR084W 1164 nt11.73□□□□□ -0.53
TRM8Q12009 YMR057CYMR057C 372 nt11.7□□□□□ -0.54
TRM8Q12009 YDL221WYDL221W 552 nt11.68□□□□□ -0.54
TRM8Q12009 GBP2YCL011C 1284 nt11.66□□□□□ -0.54
TRM8Q12009 YDR433WYDR433W 441 nt11.65□□□□□ -0.54
TRM8Q12009 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.63□□□□□ -0.55
TRM8Q12009 YKR040CYKR040C 504 nt11.61□□□□□ -0.55
TRM8Q12009 YBR220CYBR220C 1683 nt11.59□□□□□ -0.55
TRM8Q12009 SDH1YKL148C 1923 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM8Q12009 SPP1YPL138C 1062 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM8Q12009 MXR2YCL033C 507 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM8Q12009 IRC15YPL017C 1500 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM8Q12009 BDF1YLR399C 2061 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM8Q12009 MRPL8YJL063C 717 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM8Q12009 RTS2YOR077W 699 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM8Q12009 TCD2YKL027W 1344 nt11.51□□□□□ -0.57
TRM8Q12009 GIS3YLR094C 1509 nt11.5□□□□□ -0.57
TRM8Q12009 SCC4YER147C 1875 nt11.49□□□□□ -0.57
TRM8Q12009 DED1YOR204W 1815 nt11.47□□□□□ -0.57
TRM8Q12009 CUE1YMR264W 612 nt11.47□□□□□ -0.57
TRM8Q12009 RRD1YIL153W 1182 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM8Q12009 RTG1YOL067C 534 nt11.44□□□□□ -0.58
TRM8Q12009 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.41□□□□□ -0.58
TRM8Q12009 YEL076CYEL076C 651 nt11.41□□□□□ -0.58
TRM8Q12009 YLR464WYLR464W 651 nt11.41□□□□□ -0.58
TRM8Q12009 ADO1YJR105W 1023 nt11.4□□□□□ -0.58
TRM8Q12009 TAT1YBR069C 1860 nt11.4□□□□□ -0.59
TRM8Q12009 FRD1YEL047C 1413 nt11.38□□□□□ -0.59
TRM8Q12009 FMT1YBL013W 1206 nt11.33□□□□□ -0.6
TRM8Q12009 SOR2YDL246C 1074 nt11.31□□□□□ -0.6
TRM8Q12009 SOR1YJR159W 1074 nt11.31□□□□□ -0.6
TRM8Q12009 YIL100WYIL100W 354 nt11.3□□□□□ -0.6
TRM8Q12009 YCL042WYCL042W 360 nt11.29□□□□□ -0.6
TRM8Q12009 FMP52YER004W 696 nt11.28□□□□□ -0.6
TRM8Q12009 YSC84YHR016C 1407 nt11.24□□□□□ -0.61
TRM8Q12009 SEC11YIR022W 504 nt11.22□□□□□ -0.61
TRM8Q12009 YNL195CYNL195C 786 nt11.22□□□□□ -0.61
TRM8Q12009 HUA1YGR268C 597 nt11.2□□□□□ -0.62
TRM8Q12009 PTH1YHR189W 573 nt11.19□□□□□ -0.62
TRM8Q12009 YLR235CYLR235C 399 nt11.18□□□□□ -0.62
TRM8Q12009 CWP1YKL096W 720 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM8Q12009 RRT12YCR045C 1476 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM8Q12009 PCH2YBR186W 1695 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM8Q12009 ADH2YMR303C 1047 nt11.16□□□□□ -0.62
TRM8Q12009 YHL050CYHL050C 2094 nt11.14□□□□□ -0.63
TRM8Q12009 YKL030WYKL030W 606 nt11.14□□□□□ -0.63
TRM8Q12009 UBX6YJL048C 1191 nt11.11□□□□□ -0.63
TRM8Q12009 PCM1YEL058W 1674 nt11.11□□□□□ -0.63
TRM8Q12009 UME6YDR207C 2511 nt11.1□□□□□ -0.63
TRM8Q12009 GUT2YIL155C 1950 nt11.1□□□□□ -0.63
TRM8Q12009 LCB1YMR296C 1677 nt11.08□□□□□ -0.64
TRM8Q12009 SNF6YHL025W 999 nt11.06□□□□□ -0.64
TRM8Q12009 DIC1YLR348C 897 nt11.03□□□□□ -0.64
TRM8Q12009 YDR094WYDR094W 336 nt11.02□□□□□ -0.65
TRM8Q12009 TIM23YNR017W 669 nt11□□□□□ -0.65
TRM8Q12009 RNQ1YCL028W 1218 nt10.99□□□□□ -0.65
TRM8Q12009 YIH1YCR059C 777 nt10.98□□□□□ -0.65
TRM8Q12009 RTF1YGL244W 1677 nt10.93□□□□□ -0.66
TRM8Q12009 YLR179CYLR179C 606 nt10.92□□□□□ -0.66
TRM8Q12009 BOP3YNL042W 1191 nt10.9□□□□□ -0.66
TRM8Q12009 PIB2YGL023C 1908 nt10.88□□□□□ -0.67
TRM8Q12009 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.88□□□□□ -0.67
TRM8Q12009 BIO4YNR057C 714 nt10.88□□□□□ -0.67
TRM8Q12009 YPR064WYPR064W 420 nt10.86□□□□□ -0.67
TRM8Q12009 SIM1YIL123W 1431 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM8Q12009 YLL053CYLL053C 459 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM8Q12009 WSC2YNL283C 1512 nt10.84□□□□□ -0.67
TRM8Q12009 AHT1YHR093W 549 nt10.84□□□□□ -0.67
TRM8Q12009 TAD3YLR316C 969 nt10.82□□□□□ -0.68
TRM8Q12009 FTR1YER145C 1215 nt10.81□□□□□ -0.68
TRM8Q12009 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM8Q12009 YFR018CYFR018C 1092 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM8Q12009 AQY1YPR192W 918 nt10.79□□□□□ -0.68
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