Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.86□□□□□ -0.51
PFA4Q12006 YLR236CYLR236C 324 nt11.86□□□□□ -0.51
PFA4Q12006 DSK2YMR276W 1122 nt11.84□□□□□ -0.51
PFA4Q12006 SIS1YNL007C 1059 nt11.84□□□□□ -0.51
PFA4Q12006 MOT3YMR070W 1473 nt11.82□□□□□ -0.52
PFA4Q12006 FMP45YDL222C 930 nt11.78□□□□□ -0.52
PFA4Q12006 YJL152WYJL152W 360 nt11.77□□□□□ -0.53
PFA4Q12006 MEP2YNL142W 1500 nt11.76□□□□□ -0.53
PFA4Q12006 YCH1YGR203W 447 nt11.76□□□□□ -0.53
PFA4Q12006 IMP2'YIL154C 1041 nt11.76□□□□□ -0.53
PFA4Q12006 TIR4YOR009W 1464 nt11.75□□□□□ -0.53
PFA4Q12006 RPP2AYOL039W 321 nt11.74□□□□□ -0.53
PFA4Q12006 PTP1YDL230W 1008 nt11.73□□□□□ -0.53
PFA4Q12006 ART5YGR068C 1761 nt11.65□□□□□ -0.54
PFA4Q12006 LPX1YOR084W 1164 nt11.63□□□□□ -0.55
PFA4Q12006 DCW1YKL046C 1350 nt11.63□□□□□ -0.55
PFA4Q12006 IDH1YNL037C 1083 nt11.62□□□□□ -0.55
PFA4Q12006 GFD2YCL036W 1701 nt11.6□□□□□ -0.55
PFA4Q12006 ERV46YAL042W 1248 nt11.59□□□□□ -0.55
PFA4Q12006 CAC2YML102W 1407 nt11.59□□□□□ -0.55
PFA4Q12006 PET9YBL030C 957 nt11.57□□□□□ -0.56
PFA4Q12006 YMR057CYMR057C 372 nt11.56□□□□□ -0.56
PFA4Q12006 YDR433WYDR433W 441 nt11.52□□□□□ -0.57
PFA4Q12006 GBP2YCL011C 1284 nt11.51□□□□□ -0.57
PFA4Q12006 SPP1YPL138C 1062 nt11.5□□□□□ -0.57
PFA4Q12006 MXR2YCL033C 507 nt11.47□□□□□ -0.57
PFA4Q12006 EMI2YDR516C 1503 nt11.46□□□□□ -0.57
PFA4Q12006 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.46□□□□□ -0.57
PFA4Q12006 YKR040CYKR040C 504 nt11.45□□□□□ -0.58
PFA4Q12006 RTS2YOR077W 699 nt11.45□□□□□ -0.58
PFA4Q12006 IRC15YPL017C 1500 nt11.41□□□□□ -0.58
PFA4Q12006 FPS1YLL043W 2010 nt11.41□□□□□ -0.58
PFA4Q12006 YDL221WYDL221W 552 nt11.4□□□□□ -0.58
PFA4Q12006 MRPL8YJL063C 717 nt11.38□□□□□ -0.59
PFA4Q12006 TCD2YKL027W 1344 nt11.35□□□□□ -0.59
PFA4Q12006 DED1YOR204W 1815 nt11.34□□□□□ -0.59
PFA4Q12006 RRD1YIL153W 1182 nt11.33□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 RTG1YOL067C 534 nt11.33□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 CUE1YMR264W 612 nt11.31□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 SSA4YER103W 1929 nt11.31□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 GIS3YLR094C 1509 nt11.3□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.28□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 YEL076CYEL076C 651 nt11.28□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 YLR464WYLR464W 651 nt11.28□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 YMR090WYMR090W 684 nt11.28□□□□□ -0.6
PFA4Q12006 FRD1YEL047C 1413 nt11.25□□□□□ -0.61
PFA4Q12006 FMT1YBL013W 1206 nt11.23□□□□□ -0.61
PFA4Q12006 ADO1YJR105W 1023 nt11.22□□□□□ -0.61
PFA4Q12006 SDH1YKL148C 1923 nt11.21□□□□□ -0.62
PFA4Q12006 YBR220CYBR220C 1683 nt11.17□□□□□ -0.62
PFA4Q12006 SCC4YER147C 1875 nt11.17□□□□□ -0.62
PFA4Q12006 SOR2YDL246C 1074 nt11.17□□□□□ -0.62
PFA4Q12006 SOR1YJR159W 1074 nt11.17□□□□□ -0.62
PFA4Q12006 YIL100WYIL100W 354 nt11.13□□□□□ -0.63
PFA4Q12006 YCL042WYCL042W 360 nt11.12□□□□□ -0.63
PFA4Q12006 PTH1YHR189W 573 nt11.1□□□□□ -0.63
PFA4Q12006 FMP52YER004W 696 nt11.09□□□□□ -0.63
PFA4Q12006 CWP1YKL096W 720 nt11.05□□□□□ -0.64
PFA4Q12006 HUA1YGR268C 597 nt11.04□□□□□ -0.64
PFA4Q12006 ADH2YMR303C 1047 nt11.04□□□□□ -0.64
PFA4Q12006 UBX6YJL048C 1191 nt11.03□□□□□ -0.64
PFA4Q12006 YLR235CYLR235C 399 nt11.01□□□□□ -0.65
PFA4Q12006 YKL030WYKL030W 606 nt10.99□□□□□ -0.65
PFA4Q12006 LCB1YMR296C 1677 nt10.96□□□□□ -0.65
PFA4Q12006 PCM1YEL058W 1674 nt10.95□□□□□ -0.66
PFA4Q12006 SNF6YHL025W 999 nt10.91□□□□□ -0.66
PFA4Q12006 RRT12YCR045C 1476 nt10.91□□□□□ -0.66
PFA4Q12006 DIC1YLR348C 897 nt10.9□□□□□ -0.66
PFA4Q12006 YSC84YHR016C 1407 nt10.89□□□□□ -0.67
PFA4Q12006 YDR094WYDR094W 336 nt10.88□□□□□ -0.67
PFA4Q12006 YNL195CYNL195C 786 nt10.88□□□□□ -0.67
PFA4Q12006 TIM23YNR017W 669 nt10.86□□□□□ -0.67
PFA4Q12006 YHL050CYHL050C 2094 nt10.86□□□□□ -0.67
PFA4Q12006 YIH1YCR059C 777 nt10.84□□□□□ -0.67
PFA4Q12006 BDF1YLR399C 2061 nt10.84□□□□□ -0.67
PFA4Q12006 RNQ1YCL028W 1218 nt10.82□□□□□ -0.68
PFA4Q12006 YLR179CYLR179C 606 nt10.78□□□□□ -0.68
PFA4Q12006 BIO4YNR057C 714 nt10.75□□□□□ -0.69
PFA4Q12006 Q0182Q0182 405 nt10.74□□□□□ -0.69
PFA4Q12006 WSC2YNL283C 1512 nt10.74□□□□□ -0.69
PFA4Q12006 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.73□□□□□ -0.69
PFA4Q12006 YLL053CYLL053C 459 nt10.72□□□□□ -0.69
PFA4Q12006 TAT1YBR069C 1860 nt10.72□□□□□ -0.69
PFA4Q12006 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.71□□□□□ -0.69
PFA4Q12006 SIM1YIL123W 1431 nt10.71□□□□□ -0.69
PFA4Q12006 AHT1YHR093W 549 nt10.69□□□□□ -0.7
PFA4Q12006 SEC11YIR022W 504 nt10.69□□□□□ -0.7
PFA4Q12006 YPR064WYPR064W 420 nt10.69□□□□□ -0.7
PFA4Q12006 FTR1YER145C 1215 nt10.66□□□□□ -0.7
PFA4Q12006 TAD3YLR316C 969 nt10.66□□□□□ -0.7
PFA4Q12006 YFR018CYFR018C 1092 nt10.64□□□□□ -0.71
PFA4Q12006 PRE6YOL038W 765 nt10.63□□□□□ -0.71
PFA4Q12006 GAL1YBR020W 1587 nt10.63□□□□□ -0.71
PFA4Q12006 PCH2YBR186W 1695 nt10.62□□□□□ -0.71
PFA4Q12006 PAU16YKL224C 372 nt10.61□□□□□ -0.71
PFA4Q12006 AQY1YPR192W 918 nt10.61□□□□□ -0.71
PFA4Q12006 TRM5YHR070W 1500 nt10.6□□□□□ -0.71
PFA4Q12006 GUT2YIL155C 1950 nt10.56□□□□□ -0.72
PFA4Q12006 ATF2YGR177C 1608 nt10.56□□□□□ -0.72
PFA4Q12006 NCP1YHR042W 2076 nt10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.4 ms