Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 YJL152WYJL152W 360 nt10.83□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 EMI2YDR516C 1503 nt10.81□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 YMR090WYMR090W 684 nt10.81□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 ART5YGR068C 1761 nt10.8□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 PUS2YGL063W 1113 nt10.8□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.8□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.8□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.8□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.8□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.8□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 YCH1YGR203W 447 nt10.79□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 CAC2YML102W 1407 nt10.78□□□□□ -0.68
NIP7Q08962 TIR4YOR009W 1464 nt10.77□□□□□ -0.69
NIP7Q08962 PET9YBL030C 957 nt10.77□□□□□ -0.69
NIP7Q08962 GFD2YCL036W 1701 nt10.75□□□□□ -0.69
NIP7Q08962 YDL221WYDL221W 552 nt10.74□□□□□ -0.69
NIP7Q08962 IMP2'YIL154C 1041 nt10.69□□□□□ -0.7
NIP7Q08962 YMR057CYMR057C 372 nt10.67□□□□□ -0.7
NIP7Q08962 DSK2YMR276W 1122 nt10.67□□□□□ -0.7
NIP7Q08962 IDH1YNL037C 1083 nt10.64□□□□□ -0.71
NIP7Q08962 RTS2YOR077W 699 nt10.64□□□□□ -0.71
NIP7Q08962 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.64□□□□□ -0.71
NIP7Q08962 IRC15YPL017C 1500 nt10.63□□□□□ -0.71
NIP7Q08962 SDH1YKL148C 1923 nt10.58□□□□□ -0.72
NIP7Q08962 YBR220CYBR220C 1683 nt10.57□□□□□ -0.72
NIP7Q08962 YLR236CYLR236C 324 nt10.57□□□□□ -0.72
NIP7Q08962 GIS3YLR094C 1509 nt10.57□□□□□ -0.72
NIP7Q08962 CUE1YMR264W 612 nt10.55□□□□□ -0.72
NIP7Q08962 SCC4YER147C 1875 nt10.54□□□□□ -0.72
NIP7Q08962 GBP2YCL011C 1284 nt10.54□□□□□ -0.72
NIP7Q08962 FMP45YDL222C 930 nt10.53□□□□□ -0.72
NIP7Q08962 YPR011CYPR011C 981 nt10.51□□□□□ -0.73
NIP7Q08962 FPS1YLL043W 2010 nt10.5□□□□□ -0.73
NIP7Q08962 YDR433WYDR433W 441 nt10.48□□□□□ -0.73
NIP7Q08962 YIL100WYIL100W 354 nt10.47□□□□□ -0.73
NIP7Q08962 TCD2YKL027W 1344 nt10.42□□□□□ -0.74
NIP7Q08962 ERV46YAL042W 1248 nt10.41□□□□□ -0.74
NIP7Q08962 LPX1YOR084W 1164 nt10.41□□□□□ -0.74
NIP7Q08962 MOT3YMR070W 1473 nt10.38□□□□□ -0.75
NIP7Q08962 BDF1YLR399C 2061 nt10.37□□□□□ -0.75
NIP7Q08962 YKR040CYKR040C 504 nt10.36□□□□□ -0.75
NIP7Q08962 YNL195CYNL195C 786 nt10.36□□□□□ -0.75
NIP7Q08962 MXR2YCL033C 507 nt10.35□□□□□ -0.75
NIP7Q08962 RRD1YIL153W 1182 nt10.33□□□□□ -0.76
NIP7Q08962 DED1YOR204W 1815 nt10.29□□□□□ -0.76
NIP7Q08962 FMP52YER004W 696 nt10.27□□□□□ -0.77
NIP7Q08962 YSC84YHR016C 1407 nt10.26□□□□□ -0.77
NIP7Q08962 TAT1YBR069C 1860 nt10.25□□□□□ -0.77
NIP7Q08962 SEC11YIR022W 504 nt10.25□□□□□ -0.77
NIP7Q08962 YCL042WYCL042W 360 nt10.24□□□□□ -0.77
NIP7Q08962 RRT12YCR045C 1476 nt10.22□□□□□ -0.77
NIP7Q08962 FMT1YBL013W 1206 nt10.19□□□□□ -0.78
NIP7Q08962 YHL050CYHL050C 2094 nt10.18□□□□□ -0.78
NIP7Q08962 SOR2YDL246C 1074 nt10.17□□□□□ -0.78
NIP7Q08962 SOR1YJR159W 1074 nt10.17□□□□□ -0.78
NIP7Q08962 CWP1YKL096W 720 nt10.17□□□□□ -0.78
NIP7Q08962 FRD1YEL047C 1413 nt10.16□□□□□ -0.78
NIP7Q08962 SPP1YPL138C 1062 nt10.16□□□□□ -0.78
NIP7Q08962 PCH2YBR186W 1695 nt10.14□□□□□ -0.79
NIP7Q08962 ADH2YMR303C 1047 nt10.12□□□□□ -0.79
NIP7Q08962 PCM1YEL058W 1674 nt10.12□□□□□ -0.79
NIP7Q08962 SNF6YHL025W 999 nt10.11□□□□□ -0.79
NIP7Q08962 GUT2YIL155C 1950 nt10.06□□□□□ -0.8
NIP7Q08962 YLR235CYLR235C 399 nt10.02□□□□□ -0.81
NIP7Q08962 PTH1YHR189W 573 nt10.01□□□□□ -0.81
NIP7Q08962 SIM1YIL123W 1431 nt10□□□□□ -0.81
NIP7Q08962 MRPL8YJL063C 717 nt9.98□□□□□ -0.81
NIP7Q08962 DIC1YLR348C 897 nt9.96□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 BOP3YNL042W 1191 nt9.96□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 YIH1YCR059C 777 nt9.95□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 RTG1YOL067C 534 nt9.95□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 RNQ1YCL028W 1218 nt9.95□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 RTF1YGL244W 1677 nt9.94□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 LCB1YMR296C 1677 nt9.94□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.94□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 YEL076CYEL076C 651 nt9.94□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 YLR464WYLR464W 651 nt9.94□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 BIO4YNR057C 714 nt9.94□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 ADO1YJR105W 1023 nt9.93□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 YKL030WYKL030W 606 nt9.93□□□□□ -0.82
NIP7Q08962 YLL053CYLL053C 459 nt9.88□□□□□ -0.83
NIP7Q08962 TIM23YNR017W 669 nt9.88□□□□□ -0.83
NIP7Q08962 HUA1YGR268C 597 nt9.87□□□□□ -0.83
NIP7Q08962 NCP1YHR042W 2076 nt9.86□□□□□ -0.83
NIP7Q08962 YLR179CYLR179C 606 nt9.85□□□□□ -0.83
NIP7Q08962 PIB2YGL023C 1908 nt9.85□□□□□ -0.83
NIP7Q08962 ERF2YLR246W 1080 nt9.82□□□□□ -0.84
NIP7Q08962 FTR1YER145C 1215 nt9.81□□□□□ -0.84
NIP7Q08962 AQY1YPR192W 918 nt9.79□□□□□ -0.84
NIP7Q08962 GAL1YBR020W 1587 nt9.78□□□□□ -0.84
NIP7Q08962 YPR064WYPR064W 420 nt9.77□□□□□ -0.85
NIP7Q08962 YFL067WYFL067W 528 nt9.76□□□□□ -0.85
NIP7Q08962 TRM5YHR070W 1500 nt9.76□□□□□ -0.85
NIP7Q08962 CRR1YLR213C 1269 nt9.75□□□□□ -0.85
NIP7Q08962 DDR2YOL052C-A 186 nt9.75□□□□□ -0.85
NIP7Q08962 ATF2YGR177C 1608 nt9.73□□□□□ -0.85
NIP7Q08962 PTK1YKL198C 1989 nt9.73□□□□□ -0.85
NIP7Q08962 LYS4YDR234W 2082 nt9.71□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 AHT1YHR093W 549 nt9.7□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 HEM12YDR047W 1089 nt9.69□□□□□ -0.86
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