Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 SIS1YNL007C 1059 nt13.97□□□□□ -0.17
DSE3Q08729 MEP2YNL142W 1500 nt13.95□□□□□ -0.18
DSE3Q08729 YJL152WYJL152W 360 nt13.92□□□□□ -0.18
DSE3Q08729 RPP2AYOL039W 321 nt13.89□□□□□ -0.19
DSE3Q08729 YPR011CYPR011C 981 nt13.88□□□□□ -0.19
DSE3Q08729 PTP1YDL230W 1008 nt13.84□□□□□ -0.19
DSE3Q08729 DSK2YMR276W 1122 nt13.84□□□□□ -0.19
DSE3Q08729 YLR236CYLR236C 324 nt13.82□□□□□ -0.2
DSE3Q08729 TIR4YOR009W 1464 nt13.81□□□□□ -0.2
DSE3Q08729 DCW1YKL046C 1350 nt13.8□□□□□ -0.2
DSE3Q08729 YCH1YGR203W 447 nt13.79□□□□□ -0.2
DSE3Q08729 ART5YGR068C 1761 nt13.78□□□□□ -0.2
DSE3Q08729 FMP45YDL222C 930 nt13.77□□□□□ -0.21
DSE3Q08729 IMP2'YIL154C 1041 nt13.76□□□□□ -0.21
DSE3Q08729 CAC2YML102W 1407 nt13.73□□□□□ -0.21
DSE3Q08729 MOT3YMR070W 1473 nt13.71□□□□□ -0.21
DSE3Q08729 GFD2YCL036W 1701 nt13.68□□□□□ -0.22
DSE3Q08729 PET9YBL030C 957 nt13.68□□□□□ -0.22
DSE3Q08729 YMR057CYMR057C 372 nt13.68□□□□□ -0.22
DSE3Q08729 IDH1YNL037C 1083 nt13.66□□□□□ -0.22
DSE3Q08729 EMI2YDR516C 1503 nt13.6□□□□□ -0.23
DSE3Q08729 LPX1YOR084W 1164 nt13.59□□□□□ -0.23
DSE3Q08729 GBP2YCL011C 1284 nt13.57□□□□□ -0.24
DSE3Q08729 YDR433WYDR433W 441 nt13.56□□□□□ -0.24
DSE3Q08729 RTS2YOR077W 699 nt13.54□□□□□ -0.24
DSE3Q08729 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.54□□□□□ -0.24
DSE3Q08729 ERV46YAL042W 1248 nt13.52□□□□□ -0.25
DSE3Q08729 YDL221WYDL221W 552 nt13.5□□□□□ -0.25
DSE3Q08729 IRC15YPL017C 1500 nt13.49□□□□□ -0.25
DSE3Q08729 SSA4YER103W 1929 nt13.48□□□□□ -0.25
DSE3Q08729 MXR2YCL033C 507 nt13.47□□□□□ -0.25
DSE3Q08729 YMR090WYMR090W 684 nt13.45□□□□□ -0.26
DSE3Q08729 FPS1YLL043W 2010 nt13.44□□□□□ -0.26
DSE3Q08729 YKR040CYKR040C 504 nt13.43□□□□□ -0.26
DSE3Q08729 SPP1YPL138C 1062 nt13.42□□□□□ -0.26
DSE3Q08729 GIS3YLR094C 1509 nt13.4□□□□□ -0.26
DSE3Q08729 TCD2YKL027W 1344 nt13.37□□□□□ -0.27
DSE3Q08729 CUE1YMR264W 612 nt13.36□□□□□ -0.27
DSE3Q08729 RRD1YIL153W 1182 nt13.31□□□□□ -0.28
DSE3Q08729 DED1YOR204W 1815 nt13.31□□□□□ -0.28
DSE3Q08729 SDH1YKL148C 1923 nt13.3□□□□□ -0.28
DSE3Q08729 YBR220CYBR220C 1683 nt13.28□□□□□ -0.28
DSE3Q08729 SCC4YER147C 1875 nt13.27□□□□□ -0.29
DSE3Q08729 YIL100WYIL100W 354 nt13.21□□□□□ -0.29
DSE3Q08729 FMT1YBL013W 1206 nt13.19□□□□□ -0.3
DSE3Q08729 FRD1YEL047C 1413 nt13.18□□□□□ -0.3
DSE3Q08729 MRPL8YJL063C 717 nt13.15□□□□□ -0.3
DSE3Q08729 RTG1YOL067C 534 nt13.14□□□□□ -0.31
DSE3Q08729 YCL042WYCL042W 360 nt13.11□□□□□ -0.31
DSE3Q08729 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.1□□□□□ -0.31
DSE3Q08729 YEL076CYEL076C 651 nt13.1□□□□□ -0.31
DSE3Q08729 YLR464WYLR464W 651 nt13.1□□□□□ -0.31
DSE3Q08729 SOR2YDL246C 1074 nt13.05□□□□□ -0.32
DSE3Q08729 SOR1YJR159W 1074 nt13.05□□□□□ -0.32
DSE3Q08729 CWP1YKL096W 720 nt13.05□□□□□ -0.32
DSE3Q08729 FMP52YER004W 696 nt13.04□□□□□ -0.32
DSE3Q08729 PTH1YHR189W 573 nt13.04□□□□□ -0.32
DSE3Q08729 ADO1YJR105W 1023 nt13.03□□□□□ -0.32
DSE3Q08729 ADH2YMR303C 1047 nt13.02□□□□□ -0.33
DSE3Q08729 RRT12YCR045C 1476 nt12.97□□□□□ -0.33
DSE3Q08729 YNL195CYNL195C 786 nt12.97□□□□□ -0.33
DSE3Q08729 PCM1YEL058W 1674 nt12.93□□□□□ -0.34
DSE3Q08729 YSC84YHR016C 1407 nt12.92□□□□□ -0.34
DSE3Q08729 BDF1YLR399C 2061 nt12.91□□□□□ -0.34
DSE3Q08729 YLR235CYLR235C 399 nt12.9□□□□□ -0.34
DSE3Q08729 HUA1YGR268C 597 nt12.88□□□□□ -0.35
DSE3Q08729 SNF6YHL025W 999 nt12.88□□□□□ -0.35
DSE3Q08729 YHL050CYHL050C 2094 nt12.87□□□□□ -0.35
DSE3Q08729 YKL030WYKL030W 606 nt12.87□□□□□ -0.35
DSE3Q08729 LCB1YMR296C 1677 nt12.85□□□□□ -0.35
DSE3Q08729 DIC1YLR348C 897 nt12.8□□□□□ -0.36
DSE3Q08729 UBX6YJL048C 1191 nt12.77□□□□□ -0.37
DSE3Q08729 TIM23YNR017W 669 nt12.74□□□□□ -0.37
DSE3Q08729 YIH1YCR059C 777 nt12.73□□□□□ -0.37
DSE3Q08729 RNQ1YCL028W 1218 nt12.73□□□□□ -0.37
DSE3Q08729 TAT1YBR069C 1860 nt12.73□□□□□ -0.37
DSE3Q08729 SEC11YIR022W 504 nt12.72□□□□□ -0.37
DSE3Q08729 SIM1YIL123W 1431 nt12.7□□□□□ -0.38
DSE3Q08729 YLR179CYLR179C 606 nt12.68□□□□□ -0.38
DSE3Q08729 BIO4YNR057C 714 nt12.67□□□□□ -0.38
DSE3Q08729 YLL053CYLL053C 459 nt12.66□□□□□ -0.38
DSE3Q08729 PCH2YBR186W 1695 nt12.64□□□□□ -0.39
DSE3Q08729 YDR094WYDR094W 336 nt12.6□□□□□ -0.39
DSE3Q08729 YPR064WYPR064W 420 nt12.57□□□□□ -0.4
DSE3Q08729 GUT2YIL155C 1950 nt12.56□□□□□ -0.4
DSE3Q08729 FTR1YER145C 1215 nt12.56□□□□□ -0.4
DSE3Q08729 WSC2YNL283C 1512 nt12.55□□□□□ -0.4
DSE3Q08729 GAL1YBR020W 1587 nt12.53□□□□□ -0.4
DSE3Q08729 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.53□□□□□ -0.4
DSE3Q08729 AHT1YHR093W 549 nt12.52□□□□□ -0.41
DSE3Q08729 TAD3YLR316C 969 nt12.51□□□□□ -0.41
DSE3Q08729 TRM5YHR070W 1500 nt12.51□□□□□ -0.41
DSE3Q08729 NCP1YHR042W 2076 nt12.49□□□□□ -0.41
DSE3Q08729 AQY1YPR192W 918 nt12.46□□□□□ -0.41
DSE3Q08729 ATF2YGR177C 1608 nt12.45□□□□□ -0.42
DSE3Q08729 ERF2YLR246W 1080 nt12.42□□□□□ -0.42
DSE3Q08729 BOP3YNL042W 1191 nt12.41□□□□□ -0.42
DSE3Q08729 DDR2YOL052C-A 186 nt12.41□□□□□ -0.42
DSE3Q08729 RTF1YGL244W 1677 nt12.41□□□□□ -0.42
DSE3Q08729 STB1YNL309W 1263 nt12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms