Protein–RNA interactions for Protein: Q06616

YPR174C, Nuclear envelope protein YPR174C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR174CQ06616 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.41□□□□□ -0.58
YPR174CQ06616 SIS1YNL007C 1059 nt11.41□□□□□ -0.58
YPR174CQ06616 RPP2AYOL039W 321 nt11.35□□□□□ -0.59
YPR174CQ06616 PTP1YDL230W 1008 nt11.29□□□□□ -0.6
YPR174CQ06616 YJL152WYJL152W 360 nt11.29□□□□□ -0.6
YPR174CQ06616 DSK2YMR276W 1122 nt11.25□□□□□ -0.61
YPR174CQ06616 DCW1YKL046C 1350 nt11.25□□□□□ -0.61
YPR174CQ06616 TIR4YOR009W 1464 nt11.25□□□□□ -0.61
YPR174CQ06616 IMP2'YIL154C 1041 nt11.24□□□□□ -0.61
YPR174CQ06616 ART5YGR068C 1761 nt11.22□□□□□ -0.61
YPR174CQ06616 YCH1YGR203W 447 nt11.21□□□□□ -0.61
YPR174CQ06616 YLR236CYLR236C 324 nt11.21□□□□□ -0.61
YPR174CQ06616 YPR011CYPR011C 981 nt11.21□□□□□ -0.61
YPR174CQ06616 CAC2YML102W 1407 nt11.18□□□□□ -0.62
YPR174CQ06616 PET9YBL030C 957 nt11.17□□□□□ -0.62
YPR174CQ06616 GFD2YCL036W 1701 nt11.16□□□□□ -0.62
YPR174CQ06616 FMP45YDL222C 930 nt11.15□□□□□ -0.62
YPR174CQ06616 YMR057CYMR057C 372 nt11.12□□□□□ -0.63
YPR174CQ06616 IDH1YNL037C 1083 nt11.12□□□□□ -0.63
YPR174CQ06616 EMI2YDR516C 1503 nt11.12□□□□□ -0.63
YPR174CQ06616 MOT3YMR070W 1473 nt11.11□□□□□ -0.63
YPR174CQ06616 SSA4YER103W 1929 nt11.06□□□□□ -0.64
YPR174CQ06616 YDL221WYDL221W 552 nt11.05□□□□□ -0.64
YPR174CQ06616 YMR090WYMR090W 684 nt11.04□□□□□ -0.64
YPR174CQ06616 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.03□□□□□ -0.64
YPR174CQ06616 RTS2YOR077W 699 nt11.02□□□□□ -0.65
YPR174CQ06616 GBP2YCL011C 1284 nt11.02□□□□□ -0.65
YPR174CQ06616 IRC15YPL017C 1500 nt11.01□□□□□ -0.65
YPR174CQ06616 ERV46YAL042W 1248 nt11.01□□□□□ -0.65
YPR174CQ06616 LPX1YOR084W 1164 nt11.01□□□□□ -0.65
YPR174CQ06616 YDR433WYDR433W 441 nt10.99□□□□□ -0.65
YPR174CQ06616 FPS1YLL043W 2010 nt10.96□□□□□ -0.66
YPR174CQ06616 GIS3YLR094C 1509 nt10.94□□□□□ -0.66
YPR174CQ06616 YKR040CYKR040C 504 nt10.92□□□□□ -0.66
YPR174CQ06616 CUE1YMR264W 612 nt10.91□□□□□ -0.66
YPR174CQ06616 MXR2YCL033C 507 nt10.9□□□□□ -0.66
YPR174CQ06616 SDH1YKL148C 1923 nt10.89□□□□□ -0.67
YPR174CQ06616 TCD2YKL027W 1344 nt10.88□□□□□ -0.67
YPR174CQ06616 YBR220CYBR220C 1683 nt10.87□□□□□ -0.67
YPR174CQ06616 SCC4YER147C 1875 nt10.85□□□□□ -0.67
YPR174CQ06616 RRD1YIL153W 1182 nt10.83□□□□□ -0.68
YPR174CQ06616 SPP1YPL138C 1062 nt10.83□□□□□ -0.68
YPR174CQ06616 DED1YOR204W 1815 nt10.83□□□□□ -0.68
YPR174CQ06616 YIL100WYIL100W 354 nt10.78□□□□□ -0.68
YPR174CQ06616 FRD1YEL047C 1413 nt10.71□□□□□ -0.69
YPR174CQ06616 FMT1YBL013W 1206 nt10.71□□□□□ -0.69
YPR174CQ06616 MRPL8YJL063C 717 nt10.7□□□□□ -0.7
YPR174CQ06616 FMP52YER004W 696 nt10.68□□□□□ -0.7
YPR174CQ06616 YCL042WYCL042W 360 nt10.67□□□□□ -0.7
YPR174CQ06616 SOR2YDL246C 1074 nt10.66□□□□□ -0.7
YPR174CQ06616 SOR1YJR159W 1074 nt10.66□□□□□ -0.7
YPR174CQ06616 RTG1YOL067C 534 nt10.65□□□□□ -0.7
YPR174CQ06616 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.62□□□□□ -0.71
YPR174CQ06616 YEL076CYEL076C 651 nt10.62□□□□□ -0.71
YPR174CQ06616 YLR464WYLR464W 651 nt10.62□□□□□ -0.71
YPR174CQ06616 BDF1YLR399C 2061 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR174CQ06616 CWP1YKL096W 720 nt10.6□□□□□ -0.71
YPR174CQ06616 YNL195CYNL195C 786 nt10.6□□□□□ -0.71
YPR174CQ06616 ADO1YJR105W 1023 nt10.59□□□□□ -0.71
YPR174CQ06616 ADH2YMR303C 1047 nt10.58□□□□□ -0.72
YPR174CQ06616 YSC84YHR016C 1407 nt10.56□□□□□ -0.72
YPR174CQ06616 RRT12YCR045C 1476 nt10.55□□□□□ -0.72
YPR174CQ06616 PTH1YHR189W 573 nt10.55□□□□□ -0.72
YPR174CQ06616 PCM1YEL058W 1674 nt10.53□□□□□ -0.72
YPR174CQ06616 YHL050CYHL050C 2094 nt10.51□□□□□ -0.73
YPR174CQ06616 YLR235CYLR235C 399 nt10.51□□□□□ -0.73
YPR174CQ06616 PAC11YDR488C 1602 nt10.49□□□□□ -0.73
YPR174CQ06616 SNF6YHL025W 999 nt10.49□□□□□ -0.73
YPR174CQ06616 TAT1YBR069C 1860 nt10.48□□□□□ -0.73
YPR174CQ06616 YKL030WYKL030W 606 nt10.47□□□□□ -0.73
YPR174CQ06616 HUA1YGR268C 597 nt10.46□□□□□ -0.73
YPR174CQ06616 SEC11YIR022W 504 nt10.46□□□□□ -0.73
YPR174CQ06616 LCB1YMR296C 1677 nt10.42□□□□□ -0.74
YPR174CQ06616 DIC1YLR348C 897 nt10.42□□□□□ -0.74
YPR174CQ06616 YIH1YCR059C 777 nt10.39□□□□□ -0.75
YPR174CQ06616 RNQ1YCL028W 1218 nt10.39□□□□□ -0.75
YPR174CQ06616 PCH2YBR186W 1695 nt10.37□□□□□ -0.75
YPR174CQ06616 TIM23YNR017W 669 nt10.36□□□□□ -0.75
YPR174CQ06616 NVJ2YPR091C 2313 nt10.36□□□□□ -0.75
YPR174CQ06616 SIM1YIL123W 1431 nt10.35□□□□□ -0.75
YPR174CQ06616 BIO4YNR057C 714 nt10.33□□□□□ -0.76
YPR174CQ06616 YLR179CYLR179C 606 nt10.31□□□□□ -0.76
YPR174CQ06616 GUT2YIL155C 1950 nt10.31□□□□□ -0.76
YPR174CQ06616 YLL053CYLL053C 459 nt10.29□□□□□ -0.76
YPR174CQ06616 UBX6YJL048C 1191 nt10.28□□□□□ -0.76
YPR174CQ06616 FTR1YER145C 1215 nt10.24□□□□□ -0.77
YPR174CQ06616 YPR064WYPR064W 420 nt10.24□□□□□ -0.77
YPR174CQ06616 NCP1YHR042W 2076 nt10.22□□□□□ -0.77
YPR174CQ06616 YDR094WYDR094W 336 nt10.22□□□□□ -0.77
YPR174CQ06616 WSC2YNL283C 1512 nt10.21□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.2□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 AHT1YHR093W 549 nt10.2□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 GAL1YBR020W 1587 nt10.2□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 AQY1YPR192W 918 nt10.2□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 TAD3YLR316C 969 nt10.18□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 BOP3YNL042W 1191 nt10.18□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 RTF1YGL244W 1677 nt10.18□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 TRM5YHR070W 1500 nt10.17□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 PIB2YGL023C 1908 nt10.16□□□□□ -0.78
YPR174CQ06616 ERF2YLR246W 1080 nt10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.4 ms