Protein–RNA interactions for Protein: Q05788

PNP1, Purine nucleoside phosphorylase, yeastyeast

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PNP1Q05788 IRC15YPL017C 1500 nt12.87□□□□□ -0.35
PNP1Q05788 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PNP1Q05788 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PNP1Q05788 MNP1YGL068W 585 nt12.8□□□□□ -0.36
PNP1Q05788 GFD2YCL036W 1701 nt12.78□□□□□ -0.36
PNP1Q05788 ART5YGR068C 1761 nt12.77□□□□□ -0.36
PNP1Q05788 SCC4YER147C 1875 nt12.76□□□□□ -0.37
PNP1Q05788 GIS3YLR094C 1509 nt12.75□□□□□ -0.37
PNP1Q05788 RKM5YLR137W 1104 nt12.7□□□□□ -0.38
PNP1Q05788 RTS2YOR077W 699 nt12.68□□□□□ -0.38
PNP1Q05788 YGR139WYGR139W 339 nt12.64□□□□□ -0.39
PNP1Q05788 PET9YBL030C 957 nt12.64□□□□□ -0.39
PNP1Q05788 TIR4YOR009W 1464 nt12.64□□□□□ -0.39
PNP1Q05788 YKL097CYKL097C 411 nt12.63□□□□□ -0.39
PNP1Q05788 PCH2YBR186W 1695 nt12.58□□□□□ -0.4
PNP1Q05788 GUT2YIL155C 1950 nt12.55□□□□□ -0.4
PNP1Q05788 YCH1YGR203W 447 nt12.53□□□□□ -0.4
PNP1Q05788 SEC11YIR022W 504 nt12.53□□□□□ -0.4
PNP1Q05788 CUE1YMR264W 612 nt12.53□□□□□ -0.4
PNP1Q05788 YSC84YHR016C 1407 nt12.52□□□□□ -0.41
PNP1Q05788 NPL3YDR432W 1245 nt12.5□□□□□ -0.41
PNP1Q05788 YMR057CYMR057C 372 nt12.5□□□□□ -0.41
PNP1Q05788 YHL050CYHL050C 2094 nt12.49□□□□□ -0.41
PNP1Q05788 FPS1YLL043W 2010 nt12.45□□□□□ -0.42
PNP1Q05788 PIB2YGL023C 1908 nt12.43□□□□□ -0.42
PNP1Q05788 RRT12YCR045C 1476 nt12.42□□□□□ -0.42
PNP1Q05788 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.37□□□□□ -0.43
PNP1Q05788 YOL037CYOL037C 354 nt12.36□□□□□ -0.43
PNP1Q05788 YJL152WYJL152W 360 nt12.32□□□□□ -0.44
PNP1Q05788 YIL100WYIL100W 354 nt12.31□□□□□ -0.44
PNP1Q05788 YOR139CYOR139C 393 nt12.3□□□□□ -0.44
PNP1Q05788 PAC11YDR488C 1602 nt12.27□□□□□ -0.44
PNP1Q05788 YLR236CYLR236C 324 nt12.26□□□□□ -0.45
PNP1Q05788 RTF1YGL244W 1677 nt12.25□□□□□ -0.45
PNP1Q05788 YNL195CYNL195C 786 nt12.24□□□□□ -0.45
PNP1Q05788 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.21□□□□□ -0.45
PNP1Q05788 WHI5YOR083W 888 nt12.16□□□□□ -0.46
PNP1Q05788 BOP3YNL042W 1191 nt12.15□□□□□ -0.46
PNP1Q05788 YLR281CYLR281C 468 nt12.14□□□□□ -0.47
PNP1Q05788 PTK1YKL198C 1989 nt12.14□□□□□ -0.47
PNP1Q05788 NCP1YHR042W 2076 nt12.14□□□□□ -0.47
PNP1Q05788 RRD1YIL153W 1182 nt12.07□□□□□ -0.48
PNP1Q05788 LCB1YMR296C 1677 nt12□□□□□ -0.49
PNP1Q05788 DED1YOR204W 1815 nt12□□□□□ -0.49
PNP1Q05788 IDH1YNL037C 1083 nt11.98□□□□□ -0.49
PNP1Q05788 GBP2YCL011C 1284 nt11.97□□□□□ -0.49
PNP1Q05788 FMT1YBL013W 1206 nt11.92□□□□□ -0.5
PNP1Q05788 FMP52YER004W 696 nt11.89□□□□□ -0.51
PNP1Q05788 YPR011CYPR011C 981 nt11.88□□□□□ -0.51
PNP1Q05788 TCD2YKL027W 1344 nt11.87□□□□□ -0.51
PNP1Q05788 PUS2YGL063W 1113 nt11.87□□□□□ -0.51
PNP1Q05788 PCM1YEL058W 1674 nt11.86□□□□□ -0.51
PNP1Q05788 DSK2YMR276W 1122 nt11.85□□□□□ -0.51
PNP1Q05788 CSM2YIL132C 642 nt11.84□□□□□ -0.51
PNP1Q05788 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.83□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.83□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.83□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.83□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.83□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 YFL054CYFL054C 1941 nt11.83□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 IMP2'YIL154C 1041 nt11.81□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 MXR2YCL033C 507 nt11.81□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 ADH2YMR303C 1047 nt11.8□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 SIM1YIL123W 1431 nt11.78□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 FMP45YDL222C 930 nt11.78□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 NVJ2YPR091C 2313 nt11.78□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 SPT8YLR055C 1809 nt11.78□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 LYS4YDR234W 2082 nt11.77□□□□□ -0.52
PNP1Q05788 YDR433WYDR433W 441 nt11.76□□□□□ -0.53
PNP1Q05788 CWP1YKL096W 720 nt11.76□□□□□ -0.53
PNP1Q05788 BIO4YNR057C 714 nt11.74□□□□□ -0.53
PNP1Q05788 SOR2YDL246C 1074 nt11.72□□□□□ -0.53
PNP1Q05788 SOR1YJR159W 1074 nt11.72□□□□□ -0.53
PNP1Q05788 SNF6YHL025W 999 nt11.7□□□□□ -0.54
PNP1Q05788 ERV46YAL042W 1248 nt11.7□□□□□ -0.54
PNP1Q05788 LPX1YOR084W 1164 nt11.7□□□□□ -0.54
PNP1Q05788 FRD1YEL047C 1413 nt11.64□□□□□ -0.55
PNP1Q05788 YIH1YCR059C 777 nt11.61□□□□□ -0.55
PNP1Q05788 YKR040CYKR040C 504 nt11.61□□□□□ -0.55
PNP1Q05788 YCL042WYCL042W 360 nt11.6□□□□□ -0.55
PNP1Q05788 SWE1YJL187C 2460 nt11.6□□□□□ -0.55
PNP1Q05788 MET8YBR213W 825 nt11.59□□□□□ -0.55
PNP1Q05788 CRR1YLR213C 1269 nt11.56□□□□□ -0.56
PNP1Q05788 YLL053CYLL053C 459 nt11.54□□□□□ -0.56
PNP1Q05788 ERF2YLR246W 1080 nt11.54□□□□□ -0.56
PNP1Q05788 RNQ1YCL028W 1218 nt11.53□□□□□ -0.56
PNP1Q05788 CLB6YGR109C 1143 nt11.49□□□□□ -0.57
PNP1Q05788 ATF2YGR177C 1608 nt11.49□□□□□ -0.57
PNP1Q05788 MIC10YCL057C-A 294 nt11.47□□□□□ -0.57
PNP1Q05788 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.45□□□□□ -0.58
PNP1Q05788 DIC1YLR348C 897 nt11.43□□□□□ -0.58
PNP1Q05788 PAU21YOR394W 495 nt11.43□□□□□ -0.58
PNP1Q05788 PAU22YPL282C 495 nt11.43□□□□□ -0.58
PNP1Q05788 FTR1YER145C 1215 nt11.42□□□□□ -0.58
PNP1Q05788 SNG1YGR197C 1644 nt11.41□□□□□ -0.58
PNP1Q05788 BOR1YNL275W 1731 nt11.4□□□□□ -0.58
PNP1Q05788 HEM12YDR047W 1089 nt11.4□□□□□ -0.58
PNP1Q05788 GAL1YBR020W 1587 nt11.39□□□□□ -0.59
PNP1Q05788 TRM5YHR070W 1500 nt11.38□□□□□ -0.59
PNP1Q05788 SPP1YPL138C 1062 nt11.36□□□□□ -0.59
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