Protein–RNA interactions for Protein: Q04739

GAL83, SNF1 protein kinase subunit beta-3, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GAL83Q04739 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.39□□□□□ -0.59
GAL83Q04739 PIB2YGL023C 1908 nt11.37□□□□□ -0.59
GAL83Q04739 RTS2YOR077W 699 nt11.35□□□□□ -0.59
GAL83Q04739 ART5YGR068C 1761 nt11.35□□□□□ -0.59
GAL83Q04739 GFD2YCL036W 1701 nt11.35□□□□□ -0.59
GAL83Q04739 RTF1YGL244W 1677 nt11.33□□□□□ -0.6
GAL83Q04739 YHL050CYHL050C 2094 nt11.32□□□□□ -0.6
GAL83Q04739 LSM3YLR438C-A 270 nt11.31□□□□□ -0.6
GAL83Q04739 WWM1YFL010C 636 nt11.28□□□□□ -0.6
GAL83Q04739 RRT12YCR045C 1476 nt11.27□□□□□ -0.6
GAL83Q04739 BOP3YNL042W 1191 nt11.23□□□□□ -0.61
GAL83Q04739 SHU1YHL006C 453 nt11.22□□□□□ -0.61
GAL83Q04739 PET9YBL030C 957 nt11.22□□□□□ -0.61
GAL83Q04739 YNL195CYNL195C 786 nt11.22□□□□□ -0.61
GAL83Q04739 CUE1YMR264W 612 nt11.2□□□□□ -0.62
GAL83Q04739 YGR021WYGR021W 873 nt11.18□□□□□ -0.62
GAL83Q04739 PTK1YKL198C 1989 nt11.14□□□□□ -0.63
GAL83Q04739 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.12□□□□□ -0.63
GAL83Q04739 YIL100WYIL100W 354 nt11.12□□□□□ -0.63
GAL83Q04739 YCH1YGR203W 447 nt11.11□□□□□ -0.63
GAL83Q04739 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.1□□□□□ -0.63
GAL83Q04739 YKL097CYKL097C 411 nt11.09□□□□□ -0.63
GAL83Q04739 HOM6YJR139C 1080 nt11.07□□□□□ -0.64
GAL83Q04739 TIR4YOR009W 1464 nt11.06□□□□□ -0.64
GAL83Q04739 YMR057CYMR057C 372 nt11.05□□□□□ -0.64
GAL83Q04739 YLR236CYLR236C 324 nt10.98□□□□□ -0.65
GAL83Q04739 MNP1YGL068W 585 nt10.97□□□□□ -0.65
GAL83Q04739 BOR1YNL275W 1731 nt10.97□□□□□ -0.65
GAL83Q04739 YFL054CYFL054C 1941 nt10.96□□□□□ -0.65
GAL83Q04739 FPS1YLL043W 2010 nt10.95□□□□□ -0.66
GAL83Q04739 NCP1YHR042W 2076 nt10.93□□□□□ -0.66
GAL83Q04739 RKM5YLR137W 1104 nt10.92□□□□□ -0.66
GAL83Q04739 SPT8YLR055C 1809 nt10.86□□□□□ -0.67
GAL83Q04739 YJL152WYJL152W 360 nt10.77□□□□□ -0.69
GAL83Q04739 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.77□□□□□ -0.69
GAL83Q04739 YOL037CYOL037C 354 nt10.76□□□□□ -0.69
GAL83Q04739 LCB1YMR296C 1677 nt10.75□□□□□ -0.69
GAL83Q04739 NPL3YDR432W 1245 nt10.71□□□□□ -0.69
GAL83Q04739 UME6YDR207C 2511 nt10.68□□□□□ -0.7
GAL83Q04739 SWE1YJL187C 2460 nt10.64□□□□□ -0.71
GAL83Q04739 YOR139CYOR139C 393 nt10.64□□□□□ -0.71
GAL83Q04739 HSP60YLR259C 1719 nt10.64□□□□□ -0.71
GAL83Q04739 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.63□□□□□ -0.71
GAL83Q04739 SIM1YIL123W 1431 nt10.57□□□□□ -0.72
GAL83Q04739 ALG12YNR030W 1656 nt10.51□□□□□ -0.73
GAL83Q04739 GLK1YCL040W 1503 nt10.51□□□□□ -0.73
GAL83Q04739 LYS4YDR234W 2082 nt10.51□□□□□ -0.73
GAL83Q04739 MCH5YOR306C 1566 nt10.5□□□□□ -0.73
GAL83Q04739 WHI5YOR083W 888 nt10.49□□□□□ -0.73
GAL83Q04739 YLR281CYLR281C 468 nt10.48□□□□□ -0.73
GAL83Q04739 PCM1YEL058W 1674 nt10.46□□□□□ -0.74
GAL83Q04739 RRD1YIL153W 1182 nt10.44□□□□□ -0.74
GAL83Q04739 FMP52YER004W 696 nt10.43□□□□□ -0.74
GAL83Q04739 YJL225CYJL225C 5277 nt10.41□□□□□ -0.74
GAL83Q04739 FUR4YBR021W 1902 nt10.39□□□□□ -0.75
GAL83Q04739 BIO4YNR057C 714 nt10.37□□□□□ -0.75
GAL83Q04739 IDH1YNL037C 1083 nt10.35□□□□□ -0.75
GAL83Q04739 GBP2YCL011C 1284 nt10.34□□□□□ -0.75
GAL83Q04739 SNF6YHL025W 999 nt10.33□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 IMP2'YIL154C 1041 nt10.33□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 PUS2YGL063W 1113 nt10.31□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 CWP1YKL096W 720 nt10.31□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 ADH2YMR303C 1047 nt10.31□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 TCD2YKL027W 1344 nt10.31□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 DED1YOR204W 1815 nt10.3□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 PRP4YPR178W 1398 nt10.3□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 DSK2YMR276W 1122 nt10.29□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 ERF2YLR246W 1080 nt10.28□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 FMT1YBL013W 1206 nt10.28□□□□□ -0.76
GAL83Q04739 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.27□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 AAC1YMR056C 930 nt10.27□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.26□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 YEL076CYEL076C 651 nt10.26□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.26□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.26□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.26□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.26□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.26□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 YLR464WYLR464W 651 nt10.26□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 NAR1YNL240C 1476 nt10.25□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 CRR1YLR213C 1269 nt10.24□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 CCA1YER168C 1641 nt10.24□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 DPS1YLL018C 1674 nt10.23□□□□□ -0.77
GAL83Q04739 RAX1YOR301W 1308 nt10.21□□□□□ -0.78
GAL83Q04739 HEM12YDR047W 1089 nt10.2□□□□□ -0.78
GAL83Q04739 BMT6YLR063W 1098 nt10.18□□□□□ -0.78
GAL83Q04739 MIC10YCL057C-A 294 nt10.18□□□□□ -0.78
GAL83Q04739 YDR433WYDR433W 441 nt10.14□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 YLL053CYLL053C 459 nt10.14□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 YIH1YCR059C 777 nt10.12□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 ATF2YGR177C 1608 nt10.11□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 YPR011CYPR011C 981 nt10.11□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 YKR005CYKR005C 1578 nt10.1□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 BIO5YNR056C 1686 nt10.1□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 SNG1YGR197C 1644 nt10.1□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 FMP45YDL222C 930 nt10.09□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 YCL042WYCL042W 360 nt10.09□□□□□ -0.79
GAL83Q04739 ERV46YAL042W 1248 nt10.08□□□□□ -0.8
GAL83Q04739 YFL067WYFL067W 528 nt10.07□□□□□ -0.8
GAL83Q04739 SOR2YDL246C 1074 nt10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 138.8 ms