Protein–RNA interactions for Protein: Q04299

YMR087W, Probable ADP-ribose 1''-phosphate phosphatase YML087W, yeastyeast

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR087WQ04299 SHU1YHL006C 453 nt11.26□□□□□ -0.61
YMR087WQ04299 HOM6YJR139C 1080 nt11.26□□□□□ -0.61
YMR087WQ04299 Q0182Q0182 405 nt11.25□□□□□ -0.61
YMR087WQ04299 ART5YGR068C 1761 nt11.25□□□□□ -0.61
YMR087WQ04299 SEC11YIR022W 504 nt11.21□□□□□ -0.61
YMR087WQ04299 PCH2YBR186W 1695 nt11.2□□□□□ -0.62
YMR087WQ04299 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.2□□□□□ -0.62
YMR087WQ04299 RTS2YOR077W 699 nt11.19□□□□□ -0.62
YMR087WQ04299 PET9YBL030C 957 nt11.17□□□□□ -0.62
YMR087WQ04299 GUT2YIL155C 1950 nt11.16□□□□□ -0.62
YMR087WQ04299 MNP1YGL068W 585 nt11.15□□□□□ -0.62
YMR087WQ04299 YSC84YHR016C 1407 nt11.1□□□□□ -0.63
YMR087WQ04299 YCH1YGR203W 447 nt11.1□□□□□ -0.63
YMR087WQ04299 RKM5YLR137W 1104 nt11.1□□□□□ -0.63
YMR087WQ04299 TIR4YOR009W 1464 nt11.1□□□□□ -0.63
YMR087WQ04299 CUE1YMR264W 612 nt11.08□□□□□ -0.64
YMR087WQ04299 PAC11YDR488C 1602 nt11.05□□□□□ -0.64
YMR087WQ04299 YHL050CYHL050C 2094 nt11.03□□□□□ -0.64
YMR087WQ04299 YMR057CYMR057C 372 nt11□□□□□ -0.65
YMR087WQ04299 PIB2YGL023C 1908 nt10.97□□□□□ -0.65
YMR087WQ04299 RRT12YCR045C 1476 nt10.96□□□□□ -0.65
YMR087WQ04299 YKL097CYKL097C 411 nt10.96□□□□□ -0.65
YMR087WQ04299 YIL100WYIL100W 354 nt10.95□□□□□ -0.66
YMR087WQ04299 YNL195CYNL195C 786 nt10.94□□□□□ -0.66
YMR087WQ04299 FPS1YLL043W 2010 nt10.93□□□□□ -0.66
YMR087WQ04299 NPL3YDR432W 1245 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR087WQ04299 RTF1YGL244W 1677 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR087WQ04299 YLR236CYLR236C 324 nt10.88□□□□□ -0.67
YMR087WQ04299 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.85□□□□□ -0.67
YMR087WQ04299 YJL152WYJL152W 360 nt10.84□□□□□ -0.67
YMR087WQ04299 BOP3YNL042W 1191 nt10.84□□□□□ -0.67
YMR087WQ04299 YOL037CYOL037C 354 nt10.81□□□□□ -0.68
YMR087WQ04299 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.8□□□□□ -0.68
YMR087WQ04299 PTK1YKL198C 1989 nt10.74□□□□□ -0.69
YMR087WQ04299 NCP1YHR042W 2076 nt10.7□□□□□ -0.7
YMR087WQ04299 MOT3YMR070W 1473 nt10.67□□□□□ -0.7
YMR087WQ04299 WHI5YOR083W 888 nt10.6□□□□□ -0.71
YMR087WQ04299 YOR139CYOR139C 393 nt10.59□□□□□ -0.71
YMR087WQ04299 LCB1YMR296C 1677 nt10.58□□□□□ -0.72
YMR087WQ04299 NVJ2YPR091C 2313 nt10.57□□□□□ -0.72
YMR087WQ04299 RRD1YIL153W 1182 nt10.56□□□□□ -0.72
YMR087WQ04299 YLR281CYLR281C 468 nt10.56□□□□□ -0.72
YMR087WQ04299 IDH1YNL037C 1083 nt10.55□□□□□ -0.72
YMR087WQ04299 YFL054CYFL054C 1941 nt10.53□□□□□ -0.72
YMR087WQ04299 FMP52YER004W 696 nt10.51□□□□□ -0.73
YMR087WQ04299 GBP2YCL011C 1284 nt10.51□□□□□ -0.73
YMR087WQ04299 SPT8YLR055C 1809 nt10.47□□□□□ -0.73
YMR087WQ04299 YJL225CYJL225C 5277 nt10.46□□□□□ -0.73
YMR087WQ04299 TCD2YKL027W 1344 nt10.46□□□□□ -0.73
YMR087WQ04299 DED1YOR204W 1815 nt10.46□□□□□ -0.74
YMR087WQ04299 PCM1YEL058W 1674 nt10.44□□□□□ -0.74
YMR087WQ04299 SIM1YIL123W 1431 nt10.43□□□□□ -0.74
YMR087WQ04299 FMT1YBL013W 1206 nt10.4□□□□□ -0.74
YMR087WQ04299 IMP2'YIL154C 1041 nt10.38□□□□□ -0.75
YMR087WQ04299 LYS4YDR234W 2082 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR087WQ04299 DSK2YMR276W 1122 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR087WQ04299 CWP1YKL096W 720 nt10.34□□□□□ -0.75
YMR087WQ04299 ADH2YMR303C 1047 nt10.34□□□□□ -0.75
YMR087WQ04299 BIO4YNR057C 714 nt10.34□□□□□ -0.75
YMR087WQ04299 SNF6YHL025W 999 nt10.33□□□□□ -0.76
YMR087WQ04299 PUS2YGL063W 1113 nt10.32□□□□□ -0.76
YMR087WQ04299 YDR433WYDR433W 441 nt10.31□□□□□ -0.76
YMR087WQ04299 SWE1YJL187C 2460 nt10.29□□□□□ -0.76
YMR087WQ04299 SOR2YDL246C 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
YMR087WQ04299 SOR1YJR159W 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
YMR087WQ04299 MXR2YCL033C 507 nt10.28□□□□□ -0.76
YMR087WQ04299 BOR1YNL275W 1731 nt10.27□□□□□ -0.76
YMR087WQ04299 FMP45YDL222C 930 nt10.25□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 YPR011CYPR011C 981 nt10.23□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 YCL042WYCL042W 360 nt10.23□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 ERF2YLR246W 1080 nt10.22□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 CRR1YLR213C 1269 nt10.21□□□□□ -0.77
YMR087WQ04299 YIH1YCR059C 777 nt10.19□□□□□ -0.78
YMR087WQ04299 ERV46YAL042W 1248 nt10.19□□□□□ -0.78
YMR087WQ04299 LPX1YOR084W 1164 nt10.16□□□□□ -0.78
YMR087WQ04299 RNQ1YCL028W 1218 nt10.15□□□□□ -0.78
YMR087WQ04299 FRD1YEL047C 1413 nt10.15□□□□□ -0.79
YMR087WQ04299 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.14□□□□□ -0.79
YMR087WQ04299 YKR040CYKR040C 504 nt10.14□□□□□ -0.79
YMR087WQ04299 YLL053CYLL053C 459 nt10.14□□□□□ -0.79
YMR087WQ04299 HSP60YLR259C 1719 nt10.12□□□□□ -0.79
YMR087WQ04299 HEM12YDR047W 1089 nt10.1□□□□□ -0.79
YMR087WQ04299 ATF2YGR177C 1608 nt10.09□□□□□ -0.79
YMR087WQ04299 MIC10YCL057C-A 294 nt10.08□□□□□ -0.8
YMR087WQ04299 FTR1YER145C 1215 nt10.05□□□□□ -0.8
YMR087WQ04299 YFL067WYFL067W 528 nt10.05□□□□□ -0.8
YMR087WQ04299 SNG1YGR197C 1644 nt10.04□□□□□ -0.8
YMR087WQ04299 GLK1YCL040W 1503 nt10.03□□□□□ -0.8
YMR087WQ04299 DIC1YLR348C 897 nt10.03□□□□□ -0.8
YMR087WQ04299 RAX1YOR301W 1308 nt10.03□□□□□ -0.8
YMR087WQ04299 GAL1YBR020W 1587 nt10.01□□□□□ -0.81
YMR087WQ04299 CCA1YER168C 1641 nt10.01□□□□□ -0.81
YMR087WQ04299 FUR4YBR021W 1902 nt10.01□□□□□ -0.81
YMR087WQ04299 TRM5YHR070W 1500 nt10.01□□□□□ -0.81
YMR087WQ04299 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms