Protein–RNA interactions for Protein: Q04119

PPN1, Endopolyphosphatase, yeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPN1	Q04119	MEP2	YNL142W	1500 nt		12.36	□□□□□ -0.43
PPN1	Q04119	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		12.3	□□□□□ -0.44
PPN1	Q04119	YHR165W-A	YHR165W-A	312 nt		12.29	□□□□□ -0.44
PPN1	Q04119	SIS1	YNL007C	1059 nt		12.22	□□□□□ -0.45
PPN1	Q04119	IMP2'	YIL154C	1041 nt		12.21	□□□□□ -0.45
PPN1	Q04119	DSK2	YMR276W	1122 nt		12.18	□□□□□ -0.46
PPN1	Q04119	BDF1	YLR399C	2061 nt		12.18	□□□□□ -0.46
PPN1	Q04119	YJL152W	YJL152W	360 nt		12.16	□□□□□ -0.46
PPN1	Q04119	RPP2A	YOL039W	321 nt		12.15	□□□□□ -0.46
PPN1	Q04119	MOT3	YMR070W	1473 nt		12.13	□□□□□ -0.47
PPN1	Q04119	DCW1	YKL046C	1350 nt		12.11	□□□□□ -0.47
PPN1	Q04119	FMP45	YDL222C	930 nt		12.08	□□□□□ -0.48
PPN1	Q04119	YLR236C	YLR236C	324 nt		12.06	□□□□□ -0.48
PPN1	Q04119	YPR011C	YPR011C	981 nt		12.05	□□□□□ -0.48
PPN1	Q04119	PTP1	YDL230W	1008 nt		12.03	□□□□□ -0.48
PPN1	Q04119	YCH1	YGR203W	447 nt		12.03	□□□□□ -0.48
PPN1	Q04119	TIR4	YOR009W	1464 nt		12.02	□□□□□ -0.48
PPN1	Q04119	TAT1	YBR069C	1860 nt		12.02	□□□□□ -0.48
PPN1	Q04119	IDH1	YNL037C	1083 nt		12.02	□□□□□ -0.49
PPN1	Q04119	ART5	YGR068C	1761 nt		11.98	□□□□□ -0.49
PPN1	Q04119	PET9	YBL030C	957 nt		11.98	□□□□□ -0.49
PPN1	Q04119	YMR090W	YMR090W	684 nt		11.98	□□□□□ -0.49
PPN1	Q04119	EMI2	YDR516C	1503 nt		11.96	□□□□□ -0.49
PPN1	Q04119	CAC2	YML102W	1407 nt		11.94	□□□□□ -0.5
PPN1	Q04119	GFD2	YCL036W	1701 nt		11.91	□□□□□ -0.5
PPN1	Q04119	YBR220C	YBR220C	1683 nt		11.91	□□□□□ -0.5
PPN1	Q04119	ERV46	YAL042W	1248 nt		11.89	□□□□□ -0.51
PPN1	Q04119	YMR057C	YMR057C	372 nt		11.89	□□□□□ -0.51
PPN1	Q04119	GBP2	YCL011C	1284 nt		11.88	□□□□□ -0.51
PPN1	Q04119	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		11.88	□□□□□ -0.51
PPN1	Q04119	YDL221W	YDL221W	552 nt		11.87	□□□□□ -0.51
PPN1	Q04119	YDR433W	YDR433W	441 nt		11.87	□□□□□ -0.51
PPN1	Q04119	LPX1	YOR084W	1164 nt		11.86	□□□□□ -0.51
PPN1	Q04119	YKR040C	YKR040C	504 nt		11.8	□□□□□ -0.52
PPN1	Q04119	SDH1	YKL148C	1923 nt		11.8	□□□□□ -0.52
PPN1	Q04119	YJL225C	YJL225C	5277 nt		11.79	□□□□□ -0.52
PPN1	Q04119	IRC15	YPL017C	1500 nt		11.77	□□□□□ -0.52
PPN1	Q04119	TCD2	YKL027W	1344 nt		11.73	□□□□□ -0.53
PPN1	Q04119	RTS2	YOR077W	699 nt		11.73	□□□□□ -0.53
PPN1	Q04119	MRPL8	YJL063C	717 nt		11.7	□□□□□ -0.54
PPN1	Q04119	MXR2	YCL033C	507 nt		11.7	□□□□□ -0.54
PPN1	Q04119	FPS1	YLL043W	2010 nt		11.69	□□□□□ -0.54
PPN1	Q04119	CUE1	YMR264W	612 nt		11.67	□□□□□ -0.54
PPN1	Q04119	GIS3	YLR094C	1509 nt		11.66	□□□□□ -0.54
PPN1	Q04119	SPP1	YPL138C	1062 nt		11.66	□□□□□ -0.54
PPN1	Q04119	SCC4	YER147C	1875 nt		11.66	□□□□□ -0.54
PPN1	Q04119	SEC11	YIR022W	504 nt		11.61	□□□□□ -0.55
PPN1	Q04119	RRD1	YIL153W	1182 nt		11.59	□□□□□ -0.55
PPN1	Q04119	ADO1	YJR105W	1023 nt		11.58	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	DED1	YOR204W	1815 nt		11.58	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	PCH2	YBR186W	1695 nt		11.57	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	YIL100W	YIL100W	354 nt		11.56	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	YEL076C-A	YEL076C-A	651 nt		11.55	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	YEL076C	YEL076C	651 nt		11.55	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	YLR464W	YLR464W	651 nt		11.55	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		11.52	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		11.52	□□□□□ -0.56
PPN1	Q04119	RTG1	YOL067C	534 nt		11.52	□□□□□ -0.57
PPN1	Q04119	YCL042W	YCL042W	360 nt		11.52	□□□□□ -0.57
PPN1	Q04119	GUT2	YIL155C	1950 nt		11.52	□□□□□ -0.57
PPN1	Q04119	FRD1	YEL047C	1413 nt		11.51	□□□□□ -0.57
PPN1	Q04119	FMP52	YER004W	696 nt		11.49	□□□□□ -0.57
PPN1	Q04119	PAC11	YDR488C	1602 nt		11.46	□□□□□ -0.57
PPN1	Q04119	SOR2	YDL246C	1074 nt		11.46	□□□□□ -0.57
PPN1	Q04119	SOR1	YJR159W	1074 nt		11.46	□□□□□ -0.57
PPN1	Q04119	FMT1	YBL013W	1206 nt		11.45	□□□□□ -0.58
PPN1	Q04119	HUA1	YGR268C	597 nt		11.4	□□□□□ -0.58
PPN1	Q04119	YSC84	YHR016C	1407 nt		11.4	□□□□□ -0.58
PPN1	Q04119	YLR235C	YLR235C	399 nt		11.38	□□□□□ -0.59
PPN1	Q04119	CWP1	YKL096W	720 nt		11.37	□□□□□ -0.59
PPN1	Q04119	YNL195C	YNL195C	786 nt		11.37	□□□□□ -0.59
PPN1	Q04119	PTH1	YHR189W	573 nt		11.35	□□□□□ -0.59
PPN1	Q04119	YHL050C	YHL050C	2094 nt		11.34	□□□□□ -0.59
PPN1	Q04119	YKL030W	YKL030W	606 nt		11.33	□□□□□ -0.6
PPN1	Q04119	ADH2	YMR303C	1047 nt		11.32	□□□□□ -0.6
PPN1	Q04119	PIB2	YGL023C	1908 nt		11.32	□□□□□ -0.6
PPN1	Q04119	RRT12	YCR045C	1476 nt		11.3	□□□□□ -0.6
PPN1	Q04119	PCM1	YEL058W	1674 nt		11.28	□□□□□ -0.6
PPN1	Q04119	SNF6	YHL025W	999 nt		11.27	□□□□□ -0.61
PPN1	Q04119	RTF1	YGL244W	1677 nt		11.26	□□□□□ -0.61
PPN1	Q04119	LCB1	YMR296C	1677 nt		11.23	□□□□□ -0.61
PPN1	Q04119	DIC1	YLR348C	897 nt		11.2	□□□□□ -0.62
PPN1	Q04119	BOP3	YNL042W	1191 nt		11.2	□□□□□ -0.62
PPN1	Q04119	UBX6	YJL048C	1191 nt		11.18	□□□□□ -0.62
PPN1	Q04119	TIM23	YNR017W	669 nt		11.18	□□□□□ -0.62
PPN1	Q04119	RNQ1	YCL028W	1218 nt		11.17	□□□□□ -0.62
PPN1	Q04119	YIH1	YCR059C	777 nt		11.15	□□□□□ -0.62
PPN1	Q04119	YDR094W	YDR094W	336 nt		11.13	□□□□□ -0.63
PPN1	Q04119	YLR179C	YLR179C	606 nt		11.11	□□□□□ -0.63
PPN1	Q04119	PTK1	YKL198C	1989 nt		11.08	□□□□□ -0.64
PPN1	Q04119	YPR064W	YPR064W	420 nt		11.07	□□□□□ -0.64
PPN1	Q04119	SIM1	YIL123W	1431 nt		11.07	□□□□□ -0.64
PPN1	Q04119	tL(GAG)G	tL(GAG)G	82 nt		11.06	□□□□□ -0.64
PPN1	Q04119	BIO4	YNR057C	714 nt		11.04	□□□□□ -0.64
PPN1	Q04119	YLL053C	YLL053C	459 nt		11.03	□□□□□ -0.64
PPN1	Q04119	NCP1	YHR042W	2076 nt		11.03	□□□□□ -0.64
PPN1	Q04119	NVJ2	YPR091C	2313 nt		11.02	□□□□□ -0.64
PPN1	Q04119	AQY1	YPR192W	918 nt		11.01	□□□□□ -0.65
PPN1	Q04119	TAD3	YLR316C	969 nt		10.99	□□□□□ -0.65
PPN1	Q04119	FTR1	YER145C	1215 nt		10.98	□□□□□ -0.65

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