Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 IRC15YPL017C 1500 nt10.02□□□□□ -0.8
YHP1Q04116 MNP1YGL068W 585 nt10.02□□□□□ -0.81
YHP1Q04116 YOR139CYOR139C 393 nt10□□□□□ -0.81
YHP1Q04116 NPL3YDR432W 1245 nt9.98□□□□□ -0.81
YHP1Q04116 GFD2YCL036W 1701 nt9.97□□□□□ -0.81
YHP1Q04116 ART5YGR068C 1761 nt9.96□□□□□ -0.82
YHP1Q04116 SCC4YER147C 1875 nt9.96□□□□□ -0.82
YHP1Q04116 GIS3YLR094C 1509 nt9.93□□□□□ -0.82
YHP1Q04116 RKM5YLR137W 1104 nt9.93□□□□□ -0.82
YHP1Q04116 YOL037CYOL037C 354 nt9.9□□□□□ -0.82
YHP1Q04116 PET9YBL030C 957 nt9.88□□□□□ -0.83
YHP1Q04116 TIR4YOR009W 1464 nt9.86□□□□□ -0.83
YHP1Q04116 RTS2YOR077W 699 nt9.86□□□□□ -0.83
YHP1Q04116 PCH2YBR186W 1695 nt9.82□□□□□ -0.84
YHP1Q04116 YCH1YGR203W 447 nt9.81□□□□□ -0.84
YHP1Q04116 SEC11YIR022W 504 nt9.81□□□□□ -0.84
YHP1Q04116 CUE1YMR264W 612 nt9.79□□□□□ -0.84
YHP1Q04116 GUT2YIL155C 1950 nt9.79□□□□□ -0.84
YHP1Q04116 YSC84YHR016C 1407 nt9.75□□□□□ -0.85
YHP1Q04116 YMR057CYMR057C 372 nt9.73□□□□□ -0.85
YHP1Q04116 YHL050CYHL050C 2094 nt9.73□□□□□ -0.85
YHP1Q04116 FPS1YLL043W 2010 nt9.72□□□□□ -0.85
YHP1Q04116 PIB2YGL023C 1908 nt9.68□□□□□ -0.86
YHP1Q04116 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.66□□□□□ -0.86
YHP1Q04116 RRT12YCR045C 1476 nt9.66□□□□□ -0.86
YHP1Q04116 YLR281CYLR281C 468 nt9.64□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.62□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.62□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.62□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.62□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.62□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 YIL100WYIL100W 354 nt9.62□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 WHI5YOR083W 888 nt9.62□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 YJL152WYJL152W 360 nt9.59□□□□□ -0.87
YHP1Q04116 PUS2YGL063W 1113 nt9.58□□□□□ -0.88
YHP1Q04116 YLR236CYLR236C 324 nt9.58□□□□□ -0.88
YHP1Q04116 RTF1YGL244W 1677 nt9.57□□□□□ -0.88
YHP1Q04116 YNL195CYNL195C 786 nt9.56□□□□□ -0.88
YHP1Q04116 PAC11YDR488C 1602 nt9.55□□□□□ -0.88
YHP1Q04116 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.53□□□□□ -0.88
YHP1Q04116 BOP3YNL042W 1191 nt9.49□□□□□ -0.89
YHP1Q04116 NCP1YHR042W 2076 nt9.47□□□□□ -0.89
YHP1Q04116 PTK1YKL198C 1989 nt9.46□□□□□ -0.9
YHP1Q04116 IMP2'YIL154C 1041 nt9.44□□□□□ -0.9
YHP1Q04116 DSK2YMR276W 1122 nt9.43□□□□□ -0.9
YHP1Q04116 RRD1YIL153W 1182 nt9.41□□□□□ -0.9
YHP1Q04116 YJL225CYJL225C 5277 nt9.39□□□□□ -0.91
YHP1Q04116 IDH1YNL037C 1083 nt9.37□□□□□ -0.91
YHP1Q04116 LCB1YMR296C 1677 nt9.36□□□□□ -0.91
YHP1Q04116 DED1YOR204W 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
YHP1Q04116 FMP45YDL222C 930 nt9.34□□□□□ -0.91
YHP1Q04116 GBP2YCL011C 1284 nt9.34□□□□□ -0.91
YHP1Q04116 FMP52YER004W 696 nt9.32□□□□□ -0.92
YHP1Q04116 YPR011CYPR011C 981 nt9.32□□□□□ -0.92
YHP1Q04116 FMT1YBL013W 1206 nt9.29□□□□□ -0.92
YHP1Q04116 TCD2YKL027W 1344 nt9.29□□□□□ -0.92
YHP1Q04116 MOT3YMR070W 1473 nt9.26□□□□□ -0.93
YHP1Q04116 PCM1YEL058W 1674 nt9.26□□□□□ -0.93
YHP1Q04116 YDR433WYDR433W 441 nt9.23□□□□□ -0.93
YHP1Q04116 ERV46YAL042W 1248 nt9.21□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 YFL054CYFL054C 1941 nt9.21□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 LPX1YOR084W 1164 nt9.2□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 ADH2YMR303C 1047 nt9.19□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 SPT8YLR055C 1809 nt9.19□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 SOR2YDL246C 1074 nt9.18□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 LYS4YDR234W 2082 nt9.18□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 SIM1YIL123W 1431 nt9.18□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 SOR1YJR159W 1074 nt9.18□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 MXR2YCL033C 507 nt9.18□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 NVJ2YPR091C 2313 nt9.17□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 CWP1YKL096W 720 nt9.17□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 BIO4YNR057C 714 nt9.17□□□□□ -0.94
YHP1Q04116 SNF6YHL025W 999 nt9.14□□□□□ -0.95
YHP1Q04116 YKR040CYKR040C 504 nt9.14□□□□□ -0.95
YHP1Q04116 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.12□□□□□ -0.95
YHP1Q04116 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.12□□□□□ -0.95
YHP1Q04116 FRD1YEL047C 1413 nt9.09□□□□□ -0.95
YHP1Q04116 YIH1YCR059C 777 nt9.08□□□□□ -0.96
YHP1Q04116 YCL042WYCL042W 360 nt9.06□□□□□ -0.96
YHP1Q04116 CRR1YLR213C 1269 nt9.05□□□□□ -0.96
YHP1Q04116 SWE1YJL187C 2460 nt9.04□□□□□ -0.96
YHP1Q04116 ERF2YLR246W 1080 nt9.03□□□□□ -0.96
YHP1Q04116 SPP1YPL138C 1062 nt9.02□□□□□ -0.97
YHP1Q04116 RNQ1YCL028W 1218 nt9.02□□□□□ -0.97
YHP1Q04116 YLL053CYLL053C 459 nt9□□□□□ -0.97
YHP1Q04116 ATF2YGR177C 1608 nt8.95□□□□□ -0.98
YHP1Q04116 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.95□□□□□ -0.98
YHP1Q04116 MRPL8YJL063C 717 nt8.93□□□□□ -0.98
YHP1Q04116 DIC1YLR348C 897 nt8.93□□□□□ -0.98
YHP1Q04116 MIC10YCL057C-A 294 nt8.93□□□□□ -0.98
YHP1Q04116 FTR1YER145C 1215 nt8.92□□□□□ -0.98
YHP1Q04116 HEM12YDR047W 1089 nt8.91□□□□□ -0.98
YHP1Q04116 SNG1YGR197C 1644 nt8.9□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 GAL1YBR020W 1587 nt8.9□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 BOR1YNL275W 1731 nt8.89□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 YFL067WYFL067W 528 nt8.88□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 TRM5YHR070W 1500 nt8.88□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 RTG1YOL067C 534 nt8.87□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.86□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 YEL076CYEL076C 651 nt8.86□□□□□ -0.99
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