Protein–RNA interactions for Protein: Q03796

TPP1, Polynucleotide 3'-phosphatase, yeastyeast

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPP1Q03796 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.47□□□□□ -0.57
TPP1Q03796 YPS1YLR120C 1710 nt11.46□□□□□ -0.58
TPP1Q03796 DSK2YMR276W 1122 nt11.43□□□□□ -0.58
TPP1Q03796 YDR095CYDR095C 411 nt11.42□□□□□ -0.58
TPP1Q03796 BDF1YLR399C 2061 nt11.41□□□□□ -0.58
TPP1Q03796 PAC11YDR488C 1602 nt11.41□□□□□ -0.58
TPP1Q03796 FMP45YDL222C 930 nt11.35□□□□□ -0.59
TPP1Q03796 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.34□□□□□ -0.59
TPP1Q03796 SIS1YNL007C 1059 nt11.33□□□□□ -0.6
TPP1Q03796 YJL152WYJL152W 360 nt11.32□□□□□ -0.6
TPP1Q03796 YPR011CYPR011C 981 nt11.29□□□□□ -0.6
TPP1Q03796 YCH1YGR203W 447 nt11.28□□□□□ -0.6
TPP1Q03796 YLR236CYLR236C 324 nt11.28□□□□□ -0.6
TPP1Q03796 NVJ2YPR091C 2313 nt11.25□□□□□ -0.61
TPP1Q03796 IDH1YNL037C 1083 nt11.23□□□□□ -0.61
TPP1Q03796 RPP2AYOL039W 321 nt11.23□□□□□ -0.61
TPP1Q03796 TAT1YBR069C 1860 nt11.21□□□□□ -0.61
TPP1Q03796 YGR139WYGR139W 339 nt11.2□□□□□ -0.62
TPP1Q03796 NME1NME1 340 nt11.2□□□□□ -0.62
TPP1Q03796 MEP2YNL142W 1500 nt11.16□□□□□ -0.62
TPP1Q03796 TIR4YOR009W 1464 nt11.15□□□□□ -0.62
TPP1Q03796 ERV46YAL042W 1248 nt11.14□□□□□ -0.63
TPP1Q03796 MRPL8YJL063C 717 nt11.11□□□□□ -0.63
TPP1Q03796 PET9YBL030C 957 nt11.11□□□□□ -0.63
TPP1Q03796 YDR433WYDR433W 441 nt11.1□□□□□ -0.63
TPP1Q03796 LPX1YOR084W 1164 nt11.1□□□□□ -0.63
TPP1Q03796 ART5YGR068C 1761 nt11.09□□□□□ -0.63
TPP1Q03796 PTP1YDL230W 1008 nt11.09□□□□□ -0.63
TPP1Q03796 GBP2YCL011C 1284 nt11.08□□□□□ -0.64
TPP1Q03796 CAC2YML102W 1407 nt11.08□□□□□ -0.64
TPP1Q03796 YKR040CYKR040C 504 nt11.06□□□□□ -0.64
TPP1Q03796 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.04□□□□□ -0.64
TPP1Q03796 YMR057CYMR057C 372 nt11.02□□□□□ -0.65
TPP1Q03796 GFD2YCL036W 1701 nt11.01□□□□□ -0.65
TPP1Q03796 ADO1YJR105W 1023 nt10.99□□□□□ -0.65
TPP1Q03796 TCD2YKL027W 1344 nt10.95□□□□□ -0.66
TPP1Q03796 SPP1YPL138C 1062 nt10.94□□□□□ -0.66
TPP1Q03796 DCW1YKL046C 1350 nt10.93□□□□□ -0.66
TPP1Q03796 MXR2YCL033C 507 nt10.92□□□□□ -0.66
TPP1Q03796 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.91□□□□□ -0.66
TPP1Q03796 YEL076CYEL076C 651 nt10.91□□□□□ -0.66
TPP1Q03796 YLR464WYLR464W 651 nt10.91□□□□□ -0.66
TPP1Q03796 YMR090WYMR090W 684 nt10.87□□□□□ -0.67
TPP1Q03796 EMI2YDR516C 1503 nt10.87□□□□□ -0.67
TPP1Q03796 RTG1YOL067C 534 nt10.85□□□□□ -0.67
TPP1Q03796 FPS1YLL043W 2010 nt10.84□□□□□ -0.67
TPP1Q03796 YDL221WYDL221W 552 nt10.82□□□□□ -0.68
TPP1Q03796 RTS2YOR077W 699 nt10.81□□□□□ -0.68
TPP1Q03796 CUE1YMR264W 612 nt10.79□□□□□ -0.68
TPP1Q03796 IRC15YPL017C 1500 nt10.78□□□□□ -0.68
TPP1Q03796 DED1YOR204W 1815 nt10.77□□□□□ -0.68
TPP1Q03796 RRD1YIL153W 1182 nt10.77□□□□□ -0.69
TPP1Q03796 HUA1YGR268C 597 nt10.76□□□□□ -0.69
TPP1Q03796 YCL042WYCL042W 360 nt10.75□□□□□ -0.69
TPP1Q03796 FRD1YEL047C 1413 nt10.75□□□□□ -0.69
TPP1Q03796 GIS3YLR094C 1509 nt10.71□□□□□ -0.69
TPP1Q03796 YIL100WYIL100W 354 nt10.69□□□□□ -0.7
TPP1Q03796 SOR2YDL246C 1074 nt10.68□□□□□ -0.7
TPP1Q03796 FMP52YER004W 696 nt10.68□□□□□ -0.7
TPP1Q03796 SOR1YJR159W 1074 nt10.68□□□□□ -0.7
TPP1Q03796 YLR235CYLR235C 399 nt10.66□□□□□ -0.7
TPP1Q03796 FMT1YBL013W 1206 nt10.64□□□□□ -0.71
TPP1Q03796 SDH1YKL148C 1923 nt10.63□□□□□ -0.71
TPP1Q03796 UBX6YJL048C 1191 nt10.63□□□□□ -0.71
TPP1Q03796 SCC4YER147C 1875 nt10.62□□□□□ -0.71
TPP1Q03796 YKL030WYKL030W 606 nt10.62□□□□□ -0.71
TPP1Q03796 PTH1YHR189W 573 nt10.6□□□□□ -0.71
TPP1Q03796 YBR220CYBR220C 1683 nt10.59□□□□□ -0.71
TPP1Q03796 CWP1YKL096W 720 nt10.57□□□□□ -0.72
TPP1Q03796 YDR094WYDR094W 336 nt10.55□□□□□ -0.72
TPP1Q03796 LCB1YMR296C 1677 nt10.51□□□□□ -0.73
TPP1Q03796 ADH2YMR303C 1047 nt10.51□□□□□ -0.73
TPP1Q03796 YNL195CYNL195C 786 nt10.49□□□□□ -0.73
TPP1Q03796 SNF6YHL025W 999 nt10.47□□□□□ -0.73
TPP1Q03796 PCM1YEL058W 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
TPP1Q03796 PCH2YBR186W 1695 nt10.46□□□□□ -0.74
TPP1Q03796 UME6YDR207C 2511 nt10.45□□□□□ -0.74
TPP1Q03796 GUT2YIL155C 1950 nt10.45□□□□□ -0.74
TPP1Q03796 TIM23YNR017W 669 nt10.44□□□□□ -0.74
TPP1Q03796 DIC1YLR348C 897 nt10.43□□□□□ -0.74
TPP1Q03796 RNQ1YCL028W 1218 nt10.39□□□□□ -0.75
TPP1Q03796 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.37□□□□□ -0.75
TPP1Q03796 YLR179CYLR179C 606 nt10.37□□□□□ -0.75
TPP1Q03796 YIH1YCR059C 777 nt10.36□□□□□ -0.75
TPP1Q03796 YPR064WYPR064W 420 nt10.36□□□□□ -0.75
TPP1Q03796 CSM2YIL132C 642 nt10.34□□□□□ -0.75
TPP1Q03796 PIB2YGL023C 1908 nt10.32□□□□□ -0.76
TPP1Q03796 RRT12YCR045C 1476 nt10.3□□□□□ -0.76
TPP1Q03796 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.29□□□□□ -0.76
TPP1Q03796 SEC11YIR022W 504 nt10.29□□□□□ -0.76
TPP1Q03796 YSC84YHR016C 1407 nt10.28□□□□□ -0.76
TPP1Q03796 YFR018CYFR018C 1092 nt10.28□□□□□ -0.76
TPP1Q03796 TAD3YLR316C 969 nt10.28□□□□□ -0.76
TPP1Q03796 YJL225CYJL225C 5277 nt10.26□□□□□ -0.77
TPP1Q03796 AHT1YHR093W 549 nt10.26□□□□□ -0.77
TPP1Q03796 AQY1YPR192W 918 nt10.26□□□□□ -0.77
TPP1Q03796 RRT5YFR032C 870 nt10.25□□□□□ -0.77
TPP1Q03796 YLL053CYLL053C 459 nt10.24□□□□□ -0.77
TPP1Q03796 YHL050CYHL050C 2094 nt10.24□□□□□ -0.77
TPP1Q03796 SIM1YIL123W 1431 nt10.24□□□□□ -0.77
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