Protein–RNA interactions for Protein: Q03210

NGL3, Probable RNA exonuclease NGL3, yeastyeast

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NGL3Q03210 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.26□□□□□ -0.29
NGL3Q03210 IRC15YPL017C 1500 nt13.21□□□□□ -0.29
NGL3Q03210 ART5YGR068C 1761 nt13.2□□□□□ -0.3
NGL3Q03210 GFD2YCL036W 1701 nt13.16□□□□□ -0.3
NGL3Q03210 SCC4YER147C 1875 nt13.14□□□□□ -0.31
NGL3Q03210 GIS3YLR094C 1509 nt13.13□□□□□ -0.31
NGL3Q03210 RKM5YLR137W 1104 nt13.11□□□□□ -0.31
NGL3Q03210 RTS2YOR077W 699 nt13.11□□□□□ -0.31
NGL3Q03210 TIR4YOR009W 1464 nt13.03□□□□□ -0.32
NGL3Q03210 PET9YBL030C 957 nt13.01□□□□□ -0.33
NGL3Q03210 YOR139CYOR139C 393 nt12.96□□□□□ -0.33
NGL3Q03210 YMR057CYMR057C 372 nt12.95□□□□□ -0.34
NGL3Q03210 NPL3YDR432W 1245 nt12.94□□□□□ -0.34
NGL3Q03210 YOL037CYOL037C 354 nt12.91□□□□□ -0.34
NGL3Q03210 PCH2YBR186W 1695 nt12.91□□□□□ -0.34
NGL3Q03210 YSC84YHR016C 1407 nt12.9□□□□□ -0.34
NGL3Q03210 YCH1YGR203W 447 nt12.89□□□□□ -0.35
NGL3Q03210 CUE1YMR264W 612 nt12.88□□□□□ -0.35
NGL3Q03210 GUT2YIL155C 1950 nt12.87□□□□□ -0.35
NGL3Q03210 SEC11YIR022W 504 nt12.85□□□□□ -0.35
NGL3Q03210 YHL050CYHL050C 2094 nt12.83□□□□□ -0.36
NGL3Q03210 RRT12YCR045C 1476 nt12.83□□□□□ -0.36
NGL3Q03210 YJL152WYJL152W 360 nt12.82□□□□□ -0.36
NGL3Q03210 FPS1YLL043W 2010 nt12.81□□□□□ -0.36
NGL3Q03210 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.79□□□□□ -0.36
NGL3Q03210 YIL100WYIL100W 354 nt12.73□□□□□ -0.37
NGL3Q03210 PIB2YGL023C 1908 nt12.7□□□□□ -0.38
NGL3Q03210 YNL195CYNL195C 786 nt12.68□□□□□ -0.38
NGL3Q03210 YLR236CYLR236C 324 nt12.66□□□□□ -0.38
NGL3Q03210 WHI5YOR083W 888 nt12.66□□□□□ -0.38
NGL3Q03210 YLR281CYLR281C 468 nt12.65□□□□□ -0.38
NGL3Q03210 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.65□□□□□ -0.38
NGL3Q03210 RTF1YGL244W 1677 nt12.6□□□□□ -0.39
NGL3Q03210 Q0182Q0182 405 nt12.59□□□□□ -0.39
NGL3Q03210 PAC11YDR488C 1602 nt12.59□□□□□ -0.39
NGL3Q03210 PUS2YGL063W 1113 nt12.51□□□□□ -0.41
NGL3Q03210 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
NGL3Q03210 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.5□□□□□ -0.41
NGL3Q03210 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
NGL3Q03210 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.5□□□□□ -0.41
NGL3Q03210 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.5□□□□□ -0.41
NGL3Q03210 BOP3YNL042W 1191 nt12.49□□□□□ -0.41
NGL3Q03210 PTK1YKL198C 1989 nt12.45□□□□□ -0.42
NGL3Q03210 NCP1YHR042W 2076 nt12.44□□□□□ -0.42
NGL3Q03210 RRD1YIL153W 1182 nt12.41□□□□□ -0.42
NGL3Q03210 IDH1YNL037C 1083 nt12.4□□□□□ -0.42
NGL3Q03210 GBP2YCL011C 1284 nt12.4□□□□□ -0.42
NGL3Q03210 DSK2YMR276W 1122 nt12.36□□□□□ -0.43
NGL3Q03210 LCB1YMR296C 1677 nt12.35□□□□□ -0.43
NGL3Q03210 DED1YOR204W 1815 nt12.35□□□□□ -0.43
NGL3Q03210 IMP2'YIL154C 1041 nt12.35□□□□□ -0.43
NGL3Q03210 TCD2YKL027W 1344 nt12.3□□□□□ -0.44
NGL3Q03210 YPR011CYPR011C 981 nt12.29□□□□□ -0.44
NGL3Q03210 FMT1YBL013W 1206 nt12.27□□□□□ -0.45
NGL3Q03210 PCM1YEL058W 1674 nt12.24□□□□□ -0.45
NGL3Q03210 YDR433WYDR433W 441 nt12.23□□□□□ -0.45
NGL3Q03210 MXR2YCL033C 507 nt12.23□□□□□ -0.45
NGL3Q03210 FMP52YER004W 696 nt12.22□□□□□ -0.45
NGL3Q03210 YFL054CYFL054C 1941 nt12.21□□□□□ -0.45
NGL3Q03210 ADH2YMR303C 1047 nt12.2□□□□□ -0.46
NGL3Q03210 SIM1YIL123W 1431 nt12.2□□□□□ -0.46
NGL3Q03210 FMP45YDL222C 930 nt12.19□□□□□ -0.46
NGL3Q03210 CWP1YKL096W 720 nt12.19□□□□□ -0.46
NGL3Q03210 LPX1YOR084W 1164 nt12.12□□□□□ -0.47
NGL3Q03210 SNF6YHL025W 999 nt12.1□□□□□ -0.47
NGL3Q03210 MOT3YMR070W 1473 nt12.09□□□□□ -0.47
NGL3Q03210 ERV46YAL042W 1248 nt12.09□□□□□ -0.47
NGL3Q03210 BIO4YNR057C 714 nt12.09□□□□□ -0.47
NGL3Q03210 LYS4YDR234W 2082 nt12.09□□□□□ -0.47
NGL3Q03210 SPT8YLR055C 1809 nt12.09□□□□□ -0.47
NGL3Q03210 YKR040CYKR040C 504 nt12.06□□□□□ -0.48
NGL3Q03210 YCL042WYCL042W 360 nt12.04□□□□□ -0.48
NGL3Q03210 SOR2YDL246C 1074 nt12.03□□□□□ -0.48
NGL3Q03210 SOR1YJR159W 1074 nt12.03□□□□□ -0.48
NGL3Q03210 NVJ2YPR091C 2313 nt12.01□□□□□ -0.49
NGL3Q03210 FRD1YEL047C 1413 nt12□□□□□ -0.49
NGL3Q03210 YIH1YCR059C 777 nt11.92□□□□□ -0.5
NGL3Q03210 YLL053CYLL053C 459 nt11.92□□□□□ -0.5
NGL3Q03210 SWE1YJL187C 2460 nt11.9□□□□□ -0.5
NGL3Q03210 RNQ1YCL028W 1218 nt11.88□□□□□ -0.51
NGL3Q03210 ERF2YLR246W 1080 nt11.87□□□□□ -0.51
NGL3Q03210 CRR1YLR213C 1269 nt11.86□□□□□ -0.51
NGL3Q03210 SPP1YPL138C 1062 nt11.84□□□□□ -0.51
NGL3Q03210 ATF2YGR177C 1608 nt11.83□□□□□ -0.52
NGL3Q03210 MIC10YCL057C-A 294 nt11.83□□□□□ -0.52
NGL3Q03210 DIC1YLR348C 897 nt11.8□□□□□ -0.52
NGL3Q03210 HEM12YDR047W 1089 nt11.77□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 FTR1YER145C 1215 nt11.77□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 TRM5YHR070W 1500 nt11.76□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 GAL1YBR020W 1587 nt11.75□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.75□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 PTH1YHR189W 573 nt11.75□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 SNG1YGR197C 1644 nt11.75□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 BOR1YNL275W 1731 nt11.74□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 YFL067WYFL067W 528 nt11.71□□□□□ -0.53
NGL3Q03210 DDR2YOL052C-A 186 nt11.69□□□□□ -0.54
NGL3Q03210 RAX1YOR301W 1308 nt11.65□□□□□ -0.54
NGL3Q03210 CCA1YER168C 1641 nt11.65□□□□□ -0.54
NGL3Q03210 HSP60YLR259C 1719 nt11.63□□□□□ -0.55
NGL3Q03210 YLR235CYLR235C 399 nt11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms