Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 GUT2YIL155C 1950 nt11.41□□□□□ -0.58
NUP49Q02199 GIS3YLR094C 1509 nt11.4□□□□□ -0.58
NUP49Q02199 YKL097CYKL097C 411 nt11.35□□□□□ -0.59
NUP49Q02199 GFD2YCL036W 1701 nt11.35□□□□□ -0.59
NUP49Q02199 YGR021WYGR021W 873 nt11.33□□□□□ -0.6
NUP49Q02199 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.33□□□□□ -0.6
NUP49Q02199 ART5YGR068C 1761 nt11.33□□□□□ -0.6
NUP49Q02199 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.29□□□□□ -0.6
NUP49Q02199 HOM6YJR139C 1080 nt11.29□□□□□ -0.6
NUP49Q02199 YSC84YHR016C 1407 nt11.27□□□□□ -0.6
NUP49Q02199 RTS2YOR077W 699 nt11.26□□□□□ -0.61
NUP49Q02199 PET9YBL030C 957 nt11.25□□□□□ -0.61
NUP49Q02199 PIB2YGL023C 1908 nt11.24□□□□□ -0.61
NUP49Q02199 YHL050CYHL050C 2094 nt11.21□□□□□ -0.61
NUP49Q02199 MNP1YGL068W 585 nt11.19□□□□□ -0.62
NUP49Q02199 CUE1YMR264W 612 nt11.18□□□□□ -0.62
NUP49Q02199 YCH1YGR203W 447 nt11.16□□□□□ -0.62
NUP49Q02199 RTF1YGL244W 1677 nt11.13□□□□□ -0.63
NUP49Q02199 TIR4YOR009W 1464 nt11.12□□□□□ -0.63
NUP49Q02199 RKM5YLR137W 1104 nt11.12□□□□□ -0.63
NUP49Q02199 RRT12YCR045C 1476 nt11.12□□□□□ -0.63
NUP49Q02199 YNL195CYNL195C 786 nt11.05□□□□□ -0.64
NUP49Q02199 BOP3YNL042W 1191 nt11.04□□□□□ -0.64
NUP49Q02199 NVJ2YPR091C 2313 nt11.04□□□□□ -0.64
NUP49Q02199 YMR057CYMR057C 372 nt11.03□□□□□ -0.64
NUP49Q02199 YIL100WYIL100W 354 nt11.02□□□□□ -0.65
NUP49Q02199 FPS1YLL043W 2010 nt11.01□□□□□ -0.65
NUP49Q02199 PTK1YKL198C 1989 nt10.98□□□□□ -0.65
NUP49Q02199 YOL037CYOL037C 354 nt10.96□□□□□ -0.65
NUP49Q02199 YOR139CYOR139C 393 nt10.94□□□□□ -0.66
NUP49Q02199 YLR236CYLR236C 324 nt10.93□□□□□ -0.66
NUP49Q02199 NPL3YDR432W 1245 nt10.91□□□□□ -0.66
NUP49Q02199 NCP1YHR042W 2076 nt10.89□□□□□ -0.67
NUP49Q02199 YJL225CYJL225C 5277 nt10.88□□□□□ -0.67
NUP49Q02199 YJL152WYJL152W 360 nt10.8□□□□□ -0.68
NUP49Q02199 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.8□□□□□ -0.68
NUP49Q02199 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.79□□□□□ -0.68
NUP49Q02199 YFL054CYFL054C 1941 nt10.72□□□□□ -0.69
NUP49Q02199 LCB1YMR296C 1677 nt10.71□□□□□ -0.69
NUP49Q02199 YLR281CYLR281C 468 nt10.7□□□□□ -0.7
NUP49Q02199 WHI5YOR083W 888 nt10.69□□□□□ -0.7
NUP49Q02199 SPT8YLR055C 1809 nt10.68□□□□□ -0.7
NUP49Q02199 RRD1YIL153W 1182 nt10.58□□□□□ -0.72
NUP49Q02199 BOR1YNL275W 1731 nt10.56□□□□□ -0.72
NUP49Q02199 FMP52YER004W 696 nt10.54□□□□□ -0.72
NUP49Q02199 PUS2YGL063W 1113 nt10.52□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.52□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.52□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.52□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.52□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.52□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 LYS4YDR234W 2082 nt10.51□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 SIM1YIL123W 1431 nt10.5□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 PCM1YEL058W 1674 nt10.49□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 SWE1YJL187C 2460 nt10.49□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 IDH1YNL037C 1083 nt10.48□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 DED1YOR204W 1815 nt10.47□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 IMP2'YIL154C 1041 nt10.47□□□□□ -0.73
NUP49Q02199 DSK2YMR276W 1122 nt10.45□□□□□ -0.74
NUP49Q02199 GBP2YCL011C 1284 nt10.45□□□□□ -0.74
NUP49Q02199 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.44□□□□□ -0.74
NUP49Q02199 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.44□□□□□ -0.74
NUP49Q02199 TCD2YKL027W 1344 nt10.42□□□□□ -0.74
NUP49Q02199 FMT1YBL013W 1206 nt10.42□□□□□ -0.74
NUP49Q02199 BIO4YNR057C 714 nt10.4□□□□□ -0.74
NUP49Q02199 YPR011CYPR011C 981 nt10.39□□□□□ -0.75
NUP49Q02199 HSP60YLR259C 1719 nt10.37□□□□□ -0.75
NUP49Q02199 SNF6YHL025W 999 nt10.36□□□□□ -0.75
NUP49Q02199 ADH2YMR303C 1047 nt10.36□□□□□ -0.75
NUP49Q02199 CWP1YKL096W 720 nt10.34□□□□□ -0.75
NUP49Q02199 UME6YDR207C 2511 nt10.32□□□□□ -0.76
NUP49Q02199 FMP45YDL222C 930 nt10.29□□□□□ -0.76
NUP49Q02199 YDR433WYDR433W 441 nt10.29□□□□□ -0.76
NUP49Q02199 CRR1YLR213C 1269 nt10.29□□□□□ -0.76
NUP49Q02199 ERF2YLR246W 1080 nt10.29□□□□□ -0.76
NUP49Q02199 SOR2YDL246C 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
NUP49Q02199 SOR1YJR159W 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
NUP49Q02199 ERV46YAL042W 1248 nt10.28□□□□□ -0.76
NUP49Q02199 GLK1YCL040W 1503 nt10.25□□□□□ -0.77
NUP49Q02199 LPX1YOR084W 1164 nt10.25□□□□□ -0.77
NUP49Q02199 YIH1YCR059C 777 nt10.24□□□□□ -0.77
NUP49Q02199 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.24□□□□□ -0.77
NUP49Q02199 MXR2YCL033C 507 nt10.24□□□□□ -0.77
NUP49Q02199 YKR040CYKR040C 504 nt10.2□□□□□ -0.78
NUP49Q02199 ALG12YNR030W 1656 nt10.2□□□□□ -0.78
NUP49Q02199 FUR4YBR021W 1902 nt10.2□□□□□ -0.78
NUP49Q02199 YLL053CYLL053C 459 nt10.18□□□□□ -0.78
NUP49Q02199 YCL042WYCL042W 360 nt10.18□□□□□ -0.78
NUP49Q02199 HEM12YDR047W 1089 nt10.16□□□□□ -0.78
NUP49Q02199 RNQ1YCL028W 1218 nt10.16□□□□□ -0.78
NUP49Q02199 MIC10YCL057C-A 294 nt10.16□□□□□ -0.78
NUP49Q02199 CCA1YER168C 1641 nt10.15□□□□□ -0.79
NUP49Q02199 ATF2YGR177C 1608 nt10.15□□□□□ -0.79
NUP49Q02199 RAX1YOR301W 1308 nt10.13□□□□□ -0.79
NUP49Q02199 SNG1YGR197C 1644 nt10.12□□□□□ -0.79
NUP49Q02199 MCH5YOR306C 1566 nt10.12□□□□□ -0.79
NUP49Q02199 FRD1YEL047C 1413 nt10.11□□□□□ -0.79
NUP49Q02199 YFL067WYFL067W 528 nt10.1□□□□□ -0.79
NUP49Q02199 FTR1YER145C 1215 nt10.08□□□□□ -0.8
NUP49Q02199 PRP4YPR178W 1398 nt10.06□□□□□ -0.8
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