Protein–RNA interactions for Protein: Q00578

SSL2, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSL2Q00578 ART5YGR068C 1761 nt13.83□□□□□ -0.2
SSL2Q00578 GIS3YLR094C 1509 nt13.82□□□□□ -0.2
SSL2Q00578 SCC4YER147C 1875 nt13.79□□□□□ -0.2
SSL2Q00578 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.76□□□□□ -0.21
SSL2Q00578 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.76□□□□□ -0.21
SSL2Q00578 RTS2YOR077W 699 nt13.74□□□□□ -0.21
SSL2Q00578 RKM5YLR137W 1104 nt13.7□□□□□ -0.22
SSL2Q00578 TIR4YOR009W 1464 nt13.67□□□□□ -0.22
SSL2Q00578 PCH2YBR186W 1695 nt13.61□□□□□ -0.23
SSL2Q00578 PET9YBL030C 957 nt13.61□□□□□ -0.23
SSL2Q00578 GUT2YIL155C 1950 nt13.58□□□□□ -0.24
SSL2Q00578 YKL097CYKL097C 411 nt13.58□□□□□ -0.24
SSL2Q00578 YSC84YHR016C 1407 nt13.56□□□□□ -0.24
SSL2Q00578 YHL050CYHL050C 2094 nt13.55□□□□□ -0.24
SSL2Q00578 YMR057CYMR057C 372 nt13.53□□□□□ -0.24
SSL2Q00578 PIB2YGL023C 1908 nt13.52□□□□□ -0.24
SSL2Q00578 NPL3YDR432W 1245 nt13.51□□□□□ -0.25
SSL2Q00578 CUE1YMR264W 612 nt13.51□□□□□ -0.25
SSL2Q00578 RRT12YCR045C 1476 nt13.48□□□□□ -0.25
SSL2Q00578 FPS1YLL043W 2010 nt13.48□□□□□ -0.25
SSL2Q00578 SEC11YIR022W 504 nt13.48□□□□□ -0.25
SSL2Q00578 YCH1YGR203W 447 nt13.45□□□□□ -0.26
SSL2Q00578 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.34□□□□□ -0.27
SSL2Q00578 YOR139CYOR139C 393 nt13.31□□□□□ -0.28
SSL2Q00578 PAC11YDR488C 1602 nt13.3□□□□□ -0.28
SSL2Q00578 YJL152WYJL152W 360 nt13.28□□□□□ -0.28
SSL2Q00578 YOL037CYOL037C 354 nt13.27□□□□□ -0.29
SSL2Q00578 YIL100WYIL100W 354 nt13.25□□□□□ -0.29
SSL2Q00578 RTF1YGL244W 1677 nt13.24□□□□□ -0.29
SSL2Q00578 YLR236CYLR236C 324 nt13.18□□□□□ -0.3
SSL2Q00578 PTK1YKL198C 1989 nt13.18□□□□□ -0.3
SSL2Q00578 NCP1YHR042W 2076 nt13.17□□□□□ -0.3
SSL2Q00578 YNL195CYNL195C 786 nt13.15□□□□□ -0.3
SSL2Q00578 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.13□□□□□ -0.31
SSL2Q00578 WHI5YOR083W 888 nt13.11□□□□□ -0.31
SSL2Q00578 YLR281CYLR281C 468 nt13.1□□□□□ -0.31
SSL2Q00578 BOP3YNL042W 1191 nt13.1□□□□□ -0.31
SSL2Q00578 RRD1YIL153W 1182 nt13.06□□□□□ -0.32
SSL2Q00578 LCB1YMR296C 1677 nt13.02□□□□□ -0.32
SSL2Q00578 DED1YOR204W 1815 nt13□□□□□ -0.33
SSL2Q00578 FMT1YBL013W 1206 nt12.94□□□□□ -0.34
SSL2Q00578 YPR011CYPR011C 981 nt12.92□□□□□ -0.34
SSL2Q00578 GBP2YCL011C 1284 nt12.9□□□□□ -0.34
SSL2Q00578 IDH1YNL037C 1083 nt12.88□□□□□ -0.35
SSL2Q00578 Q0182Q0182 405 nt12.86□□□□□ -0.35
SSL2Q00578 NVJ2YPR091C 2313 nt12.82□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 PCM1YEL058W 1674 nt12.82□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 PUS2YGL063W 1113 nt12.81□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 MXR2YCL033C 507 nt12.8□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 YFL054CYFL054C 1941 nt12.79□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 LYS4YDR234W 2082 nt12.78□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.78□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.78□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.78□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.78□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.78□□□□□ -0.36
SSL2Q00578 FMP52YER004W 696 nt12.77□□□□□ -0.37
SSL2Q00578 ADH2YMR303C 1047 nt12.77□□□□□ -0.37
SSL2Q00578 TCD2YKL027W 1344 nt12.77□□□□□ -0.37
SSL2Q00578 DSK2YMR276W 1122 nt12.76□□□□□ -0.37
SSL2Q00578 SPT8YLR055C 1809 nt12.74□□□□□ -0.37
SSL2Q00578 FMP45YDL222C 930 nt12.74□□□□□ -0.37
SSL2Q00578 SIM1YIL123W 1431 nt12.72□□□□□ -0.37
SSL2Q00578 CWP1YKL096W 720 nt12.71□□□□□ -0.37
SSL2Q00578 BIO4YNR057C 714 nt12.7□□□□□ -0.38
SSL2Q00578 YDR433WYDR433W 441 nt12.69□□□□□ -0.38
SSL2Q00578 LPX1YOR084W 1164 nt12.67□□□□□ -0.38
SSL2Q00578 SOR2YDL246C 1074 nt12.64□□□□□ -0.39
SSL2Q00578 IMP2'YIL154C 1041 nt12.64□□□□□ -0.39
SSL2Q00578 SOR1YJR159W 1074 nt12.64□□□□□ -0.39
SSL2Q00578 SNF6YHL025W 999 nt12.61□□□□□ -0.39
SSL2Q00578 ERV46YAL042W 1248 nt12.6□□□□□ -0.39
SSL2Q00578 FRD1YEL047C 1413 nt12.59□□□□□ -0.39
SSL2Q00578 SWE1YJL187C 2460 nt12.55□□□□□ -0.4
SSL2Q00578 YIH1YCR059C 777 nt12.51□□□□□ -0.41
SSL2Q00578 YKR040CYKR040C 504 nt12.51□□□□□ -0.41
SSL2Q00578 CRR1YLR213C 1269 nt12.48□□□□□ -0.41
SSL2Q00578 YLL053CYLL053C 459 nt12.47□□□□□ -0.41
SSL2Q00578 YCL042WYCL042W 360 nt12.47□□□□□ -0.41
SSL2Q00578 MIC10YCL057C-A 294 nt12.44□□□□□ -0.42
SSL2Q00578 ATF2YGR177C 1608 nt12.44□□□□□ -0.42
SSL2Q00578 RNQ1YCL028W 1218 nt12.43□□□□□ -0.42
SSL2Q00578 ERF2YLR246W 1080 nt12.41□□□□□ -0.42
SSL2Q00578 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.36□□□□□ -0.43
SSL2Q00578 SPP1YPL138C 1062 nt12.34□□□□□ -0.43
SSL2Q00578 SNG1YGR197C 1644 nt12.33□□□□□ -0.43
SSL2Q00578 FTR1YER145C 1215 nt12.33□□□□□ -0.44
SSL2Q00578 DIC1YLR348C 897 nt12.32□□□□□ -0.44
SSL2Q00578 MOT3YMR070W 1473 nt12.32□□□□□ -0.44
SSL2Q00578 TRM5YHR070W 1500 nt12.31□□□□□ -0.44
SSL2Q00578 BOR1YNL275W 1731 nt12.31□□□□□ -0.44
SSL2Q00578 GAL1YBR020W 1587 nt12.3□□□□□ -0.44
SSL2Q00578 HEM12YDR047W 1089 nt12.29□□□□□ -0.44
SSL2Q00578 HSP60YLR259C 1719 nt12.27□□□□□ -0.45
SSL2Q00578 CCA1YER168C 1641 nt12.25□□□□□ -0.45
SSL2Q00578 PTH1YHR189W 573 nt12.24□□□□□ -0.45
SSL2Q00578 YFL067WYFL067W 528 nt12.2□□□□□ -0.46
SSL2Q00578 FUR4YBR021W 1902 nt12.17□□□□□ -0.46
SSL2Q00578 RAX1YOR301W 1308 nt12.16□□□□□ -0.46
SSL2Q00578 ANP1YEL036C 1503 nt12.16□□□□□ -0.46
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