Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM258P61165 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM258P61165 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM258P61165 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM258P61165 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM258P61165 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM258P61165 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM258P61165 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM258P61165 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM258P61165 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM258P61165 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM258P61165 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM258P61165 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM258P61165 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM258P61165 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM258P61165 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM258P61165 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM258P61165 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM258P61165 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM258P61165 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM258P61165 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM258P61165 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM258P61165 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM258P61165 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM258P61165 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM258P61165 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM258P61165 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM258P61165 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM258P61165 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM258P61165 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM258P61165 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM258P61165 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM258P61165 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM258P61165 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM258P61165 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM258P61165 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM258P61165 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM258P61165 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM258P61165 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM258P61165 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM258P61165 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM258P61165 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM258P61165 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM258P61165 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM258P61165 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM258P61165 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM258P61165 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM258P61165 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM258P61165 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM258P61165 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM258P61165 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms