Protein–RNA interactions for Protein: P53958

BOP3, Protein BOP3, yeastyeast

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BOP3P53958 ART5YGR068C 1761 nt13.27□□□□□ -0.29
BOP3P53958 SCC4YER147C 1875 nt13.25□□□□□ -0.29
BOP3P53958 GIS3YLR094C 1509 nt13.23□□□□□ -0.29
BOP3P53958 GFD2YCL036W 1701 nt13.23□□□□□ -0.29
BOP3P53958 MNP1YGL068W 585 nt13.23□□□□□ -0.29
BOP3P53958 RTS2YOR077W 699 nt13.19□□□□□ -0.3
BOP3P53958 RKM5YLR137W 1104 nt13.09□□□□□ -0.31
BOP3P53958 TIR4YOR009W 1464 nt13.08□□□□□ -0.32
BOP3P53958 PET9YBL030C 957 nt13.07□□□□□ -0.32
BOP3P53958 PCH2YBR186W 1695 nt13.05□□□□□ -0.32
BOP3P53958 YSC84YHR016C 1407 nt13.02□□□□□ -0.33
BOP3P53958 GUT2YIL155C 1950 nt13.01□□□□□ -0.33
BOP3P53958 YKL097CYKL097C 411 nt13□□□□□ -0.33
BOP3P53958 YMR057CYMR057C 372 nt13□□□□□ -0.33
BOP3P53958 SEC11YIR022W 504 nt12.97□□□□□ -0.33
BOP3P53958 CUE1YMR264W 612 nt12.96□□□□□ -0.33
BOP3P53958 YHL050CYHL050C 2094 nt12.95□□□□□ -0.34
BOP3P53958 RRT12YCR045C 1476 nt12.94□□□□□ -0.34
BOP3P53958 YCH1YGR203W 447 nt12.93□□□□□ -0.34
BOP3P53958 NPL3YDR432W 1245 nt12.89□□□□□ -0.35
BOP3P53958 FPS1YLL043W 2010 nt12.87□□□□□ -0.35
BOP3P53958 PIB2YGL023C 1908 nt12.86□□□□□ -0.35
BOP3P53958 YJL152WYJL152W 360 nt12.83□□□□□ -0.36
BOP3P53958 PAC11YDR488C 1602 nt12.81□□□□□ -0.36
BOP3P53958 YIL100WYIL100W 354 nt12.79□□□□□ -0.36
BOP3P53958 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.79□□□□□ -0.36
BOP3P53958 YNL195CYNL195C 786 nt12.75□□□□□ -0.37
BOP3P53958 RTF1YGL244W 1677 nt12.72□□□□□ -0.37
BOP3P53958 YLR236CYLR236C 324 nt12.71□□□□□ -0.37
BOP3P53958 YOL037CYOL037C 354 nt12.69□□□□□ -0.38
BOP3P53958 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.68□□□□□ -0.38
BOP3P53958 YOR139CYOR139C 393 nt12.64□□□□□ -0.39
BOP3P53958 BOP3YNL042W 1191 nt12.6□□□□□ -0.39
BOP3P53958 PTK1YKL198C 1989 nt12.58□□□□□ -0.4
BOP3P53958 WHI5YOR083W 888 nt12.55□□□□□ -0.4
BOP3P53958 NCP1YHR042W 2076 nt12.54□□□□□ -0.4
BOP3P53958 YLR281CYLR281C 468 nt12.51□□□□□ -0.41
BOP3P53958 RRD1YIL153W 1182 nt12.45□□□□□ -0.42
BOP3P53958 LCB1YMR296C 1677 nt12.44□□□□□ -0.42
BOP3P53958 GBP2YCL011C 1284 nt12.41□□□□□ -0.42
BOP3P53958 DED1YOR204W 1815 nt12.39□□□□□ -0.43
BOP3P53958 IDH1YNL037C 1083 nt12.38□□□□□ -0.43
BOP3P53958 YFL054CYFL054C 1941 nt12.33□□□□□ -0.44
BOP3P53958 FMT1YBL013W 1206 nt12.32□□□□□ -0.44
BOP3P53958 TCD2YKL027W 1344 nt12.29□□□□□ -0.44
BOP3P53958 PCM1YEL058W 1674 nt12.29□□□□□ -0.44
BOP3P53958 PUS2YGL063W 1113 nt12.27□□□□□ -0.45
BOP3P53958 YPR011CYPR011C 981 nt12.26□□□□□ -0.45
BOP3P53958 NVJ2YPR091C 2313 nt12.25□□□□□ -0.45
BOP3P53958 MXR2YCL033C 507 nt12.25□□□□□ -0.45
BOP3P53958 SIM1YIL123W 1431 nt12.25□□□□□ -0.45
BOP3P53958 FMP52YER004W 696 nt12.24□□□□□ -0.45
BOP3P53958 ADH2YMR303C 1047 nt12.24□□□□□ -0.45
BOP3P53958 CWP1YKL096W 720 nt12.22□□□□□ -0.45
BOP3P53958 SPT8YLR055C 1809 nt12.21□□□□□ -0.45
BOP3P53958 YDR433WYDR433W 441 nt12.21□□□□□ -0.45
BOP3P53958 DSK2YMR276W 1122 nt12.21□□□□□ -0.45
BOP3P53958 Q0182Q0182 405 nt12.18□□□□□ -0.46
BOP3P53958 LYS4YDR234W 2082 nt12.18□□□□□ -0.46
BOP3P53958 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.17□□□□□ -0.46
BOP3P53958 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.17□□□□□ -0.46
BOP3P53958 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.17□□□□□ -0.46
BOP3P53958 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.17□□□□□ -0.46
BOP3P53958 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.17□□□□□ -0.46
BOP3P53958 FMP45YDL222C 930 nt12.16□□□□□ -0.46
BOP3P53958 IMP2'YIL154C 1041 nt12.14□□□□□ -0.47
BOP3P53958 BIO4YNR057C 714 nt12.14□□□□□ -0.47
BOP3P53958 SNF6YHL025W 999 nt12.13□□□□□ -0.47
BOP3P53958 LPX1YOR084W 1164 nt12.09□□□□□ -0.47
BOP3P53958 SOR2YDL246C 1074 nt12.04□□□□□ -0.48
BOP3P53958 SOR1YJR159W 1074 nt12.04□□□□□ -0.48
BOP3P53958 YCL042WYCL042W 360 nt12.03□□□□□ -0.48
BOP3P53958 SWE1YJL187C 2460 nt12.02□□□□□ -0.49
BOP3P53958 ERV46YAL042W 1248 nt12.01□□□□□ -0.49
BOP3P53958 FRD1YEL047C 1413 nt12□□□□□ -0.49
BOP3P53958 YKR040CYKR040C 504 nt11.98□□□□□ -0.49
BOP3P53958 YLL053CYLL053C 459 nt11.96□□□□□ -0.49
BOP3P53958 YIH1YCR059C 777 nt11.95□□□□□ -0.5
BOP3P53958 CRR1YLR213C 1269 nt11.92□□□□□ -0.5
BOP3P53958 ERF2YLR246W 1080 nt11.91□□□□□ -0.5
BOP3P53958 BOR1YNL275W 1731 nt11.91□□□□□ -0.5
BOP3P53958 MIC10YCL057C-A 294 nt11.9□□□□□ -0.5
BOP3P53958 ATF2YGR177C 1608 nt11.89□□□□□ -0.51
BOP3P53958 RNQ1YCL028W 1218 nt11.89□□□□□ -0.51
BOP3P53958 HEM12YDR047W 1089 nt11.82□□□□□ -0.52
BOP3P53958 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.81□□□□□ -0.52
BOP3P53958 DIC1YLR348C 897 nt11.81□□□□□ -0.52
BOP3P53958 SNG1YGR197C 1644 nt11.81□□□□□ -0.52
BOP3P53958 TRM5YHR070W 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
BOP3P53958 FTR1YER145C 1215 nt11.8□□□□□ -0.52
BOP3P53958 GAL1YBR020W 1587 nt11.79□□□□□ -0.52
BOP3P53958 HSP60YLR259C 1719 nt11.77□□□□□ -0.52
BOP3P53958 SPP1YPL138C 1062 nt11.75□□□□□ -0.53
BOP3P53958 YFL067WYFL067W 528 nt11.74□□□□□ -0.53
BOP3P53958 PTH1YHR189W 573 nt11.74□□□□□ -0.53
BOP3P53958 CCA1YER168C 1641 nt11.74□□□□□ -0.53
BOP3P53958 DDR2YOL052C-A 186 nt11.72□□□□□ -0.53
BOP3P53958 RAX1YOR301W 1308 nt11.71□□□□□ -0.53
BOP3P53958 FUR4YBR021W 1902 nt11.68□□□□□ -0.54
BOP3P53958 GLK1YCL040W 1503 nt11.67□□□□□ -0.54
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