Protein–RNA interactions for Protein: P53867

ATG4, Cysteine protease ATG4, yeastyeast

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG4P53867 YLR236CYLR236C 324 nt11.03□□□□□ -0.64
ATG4P53867 YPR011CYPR011C 981 nt11.03□□□□□ -0.64
ATG4P53867 FMP45YDL222C 930 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG4P53867 YDR095CYDR095C 411 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG4P53867 IMP2'YIL154C 1041 nt11□□□□□ -0.65
ATG4P53867 YJL152WYJL152W 360 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG4P53867 YCH1YGR203W 447 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG4P53867 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG4P53867 SIS1YNL007C 1059 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG4P53867 SPT5YML010W 3192 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG4P53867 TIR4YOR009W 1464 nt10.82□□□□□ -0.68
ATG4P53867 IDH1YNL037C 1083 nt10.82□□□□□ -0.68
ATG4P53867 LPX1YOR084W 1164 nt10.82□□□□□ -0.68
ATG4P53867 RPP2AYOL039W 321 nt10.8□□□□□ -0.68
ATG4P53867 ERV46YAL042W 1248 nt10.79□□□□□ -0.68
ATG4P53867 MEP2YNL142W 1500 nt10.75□□□□□ -0.69
ATG4P53867 PTP1YDL230W 1008 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG4P53867 YDR433WYDR433W 441 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG4P53867 ART5YGR068C 1761 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG4P53867 MRPL8YJL063C 717 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG4P53867 FPS1YLL043W 2010 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG4P53867 SPP1YPL138C 1062 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG4P53867 SSA4YER103W 1929 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG4P53867 GBP2YCL011C 1284 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG4P53867 PET9YBL030C 957 nt10.68□□□□□ -0.7
ATG4P53867 YKR040CYKR040C 504 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG4P53867 CAC2YML102W 1407 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG4P53867 YMR057CYMR057C 372 nt10.66□□□□□ -0.7
ATG4P53867 GFD2YCL036W 1701 nt10.66□□□□□ -0.7
ATG4P53867 MXR2YCL033C 507 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG4P53867 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG4P53867 NVJ2YPR091C 2313 nt10.61□□□□□ -0.71
ATG4P53867 DCW1YKL046C 1350 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG4P53867 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.59□□□□□ -0.71
ATG4P53867 YEL076CYEL076C 651 nt10.59□□□□□ -0.71
ATG4P53867 YLR464WYLR464W 651 nt10.59□□□□□ -0.71
ATG4P53867 RTG1YOL067C 534 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG4P53867 ADO1YJR105W 1023 nt10.57□□□□□ -0.72
ATG4P53867 TCD2YKL027W 1344 nt10.54□□□□□ -0.72
ATG4P53867 RTS2YOR077W 699 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG4P53867 PAC11YDR488C 1602 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG4P53867 DED1YOR204W 1815 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG4P53867 EMI2YDR516C 1503 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG4P53867 RRD1YIL153W 1182 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG4P53867 IRC15YPL017C 1500 nt10.44□□□□□ -0.74
ATG4P53867 FRD1YEL047C 1413 nt10.43□□□□□ -0.74
ATG4P53867 YDL221WYDL221W 552 nt10.42□□□□□ -0.74
ATG4P53867 UBX6YJL048C 1191 nt10.4□□□□□ -0.74
ATG4P53867 CUE1YMR264W 612 nt10.39□□□□□ -0.75
ATG4P53867 BDF1YLR399C 2061 nt10.37□□□□□ -0.75
ATG4P53867 HUA1YGR268C 597 nt10.37□□□□□ -0.75
ATG4P53867 YMR090WYMR090W 684 nt10.36□□□□□ -0.75
ATG4P53867 GIS3YLR094C 1509 nt10.35□□□□□ -0.75
ATG4P53867 FMT1YBL013W 1206 nt10.35□□□□□ -0.75
ATG4P53867 YCL042WYCL042W 360 nt10.34□□□□□ -0.75
ATG4P53867 SOR2YDL246C 1074 nt10.33□□□□□ -0.76
ATG4P53867 SOR1YJR159W 1074 nt10.33□□□□□ -0.76
ATG4P53867 PTH1YHR189W 573 nt10.32□□□□□ -0.76
ATG4P53867 FMP52YER004W 696 nt10.26□□□□□ -0.77
ATG4P53867 YIL100WYIL100W 354 nt10.26□□□□□ -0.77
ATG4P53867 YLR235CYLR235C 399 nt10.26□□□□□ -0.77
ATG4P53867 YKL030WYKL030W 606 nt10.25□□□□□ -0.77
ATG4P53867 YDR094WYDR094W 336 nt10.24□□□□□ -0.77
ATG4P53867 SDH1YKL148C 1923 nt10.24□□□□□ -0.77
ATG4P53867 SCC4YER147C 1875 nt10.23□□□□□ -0.77
ATG4P53867 CWP1YKL096W 720 nt10.22□□□□□ -0.77
ATG4P53867 TAT1YBR069C 1860 nt10.21□□□□□ -0.77
ATG4P53867 LCB1YMR296C 1677 nt10.19□□□□□ -0.78
ATG4P53867 ADH2YMR303C 1047 nt10.19□□□□□ -0.78
ATG4P53867 YBR220CYBR220C 1683 nt10.18□□□□□ -0.78
ATG4P53867 YJL225CYJL225C 5277 nt10.14□□□□□ -0.79
ATG4P53867 PCM1YEL058W 1674 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG4P53867 DIC1YLR348C 897 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG4P53867 SNF6YHL025W 999 nt10.09□□□□□ -0.79
ATG4P53867 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.08□□□□□ -0.8
ATG4P53867 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.08□□□□□ -0.8
ATG4P53867 TIM23YNR017W 669 nt10.08□□□□□ -0.8
ATG4P53867 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.07□□□□□ -0.8
ATG4P53867 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.02□□□□□ -0.81
ATG4P53867 YLR179CYLR179C 606 nt10.02□□□□□ -0.81
ATG4P53867 YNL195CYNL195C 786 nt10.02□□□□□ -0.81
ATG4P53867 RNQ1YCL028W 1218 nt10.01□□□□□ -0.81
ATG4P53867 YIH1YCR059C 777 nt10□□□□□ -0.81
ATG4P53867 RRT12YCR045C 1476 nt9.97□□□□□ -0.81
ATG4P53867 YPR064WYPR064W 420 nt9.96□□□□□ -0.82
ATG4P53867 YFR018CYFR018C 1092 nt9.95□□□□□ -0.82
ATG4P53867 WSC2YNL283C 1512 nt9.93□□□□□ -0.82
ATG4P53867 YSC84YHR016C 1407 nt9.93□□□□□ -0.82
ATG4P53867 PAU16YKL224C 372 nt9.93□□□□□ -0.82
ATG4P53867 AHT1YHR093W 549 nt9.91□□□□□ -0.82
ATG4P53867 TAD3YLR316C 969 nt9.91□□□□□ -0.82
ATG4P53867 YHL050CYHL050C 2094 nt9.91□□□□□ -0.82
ATG4P53867 PRE6YOL038W 765 nt9.9□□□□□ -0.82
ATG4P53867 YLL053CYLL053C 459 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG4P53867 BIO4YNR057C 714 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG4P53867 RRT5YFR032C 870 nt9.88□□□□□ -0.83
ATG4P53867 SIM1YIL123W 1431 nt9.86□□□□□ -0.83
ATG4P53867 FTR1YER145C 1215 nt9.84□□□□□ -0.83
ATG4P53867 AQY1YPR192W 918 nt9.84□□□□□ -0.83
ATG4P53867 GAL1YBR020W 1587 nt9.82□□□□□ -0.84
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