Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YGR021W	YGR021W	873 nt		11.91	□□□□□ -0.5
DSL1	P53847	UME6	YDR207C	2511 nt		11.91	□□□□□ -0.5
DSL1	P53847	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		11.9	□□□□□ -0.5
DSL1	P53847	SCC4	YER147C	1875 nt		11.86	□□□□□ -0.51
DSL1	P53847	GUT2	YIL155C	1950 nt		11.85	□□□□□ -0.51
DSL1	P53847	IRC15	YPL017C	1500 nt		11.83	□□□□□ -0.52
DSL1	P53847	ART5	YGR068C	1761 nt		11.78	□□□□□ -0.52
DSL1	P53847	GIS3	YLR094C	1509 nt		11.78	□□□□□ -0.52
DSL1	P53847	SHU1	YHL006C	453 nt		11.78	□□□□□ -0.52
DSL1	P53847	HOM6	YJR139C	1080 nt		11.78	□□□□□ -0.52
DSL1	P53847	GFD2	YCL036W	1701 nt		11.76	□□□□□ -0.53
DSL1	P53847	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		11.74	□□□□□ -0.53
DSL1	P53847	PET9	YBL030C	957 nt		11.72	□□□□□ -0.53
DSL1	P53847	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		11.71	□□□□□ -0.53
DSL1	P53847	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		11.71	□□□□□ -0.53
DSL1	P53847	YCH1	YGR203W	447 nt		11.68	□□□□□ -0.54
DSL1	P53847	RTS2	YOR077W	699 nt		11.68	□□□□□ -0.54
DSL1	P53847	MNP1	YGL068W	585 nt		11.64	□□□□□ -0.55
DSL1	P53847	YSC84	YHR016C	1407 nt		11.62	□□□□□ -0.55
DSL1	P53847	RKM5	YLR137W	1104 nt		11.62	□□□□□ -0.55
DSL1	P53847	CUE1	YMR264W	612 nt		11.59	□□□□□ -0.55
DSL1	P53847	TIR4	YOR009W	1464 nt		11.57	□□□□□ -0.56
DSL1	P53847	RTF1	YGL244W	1677 nt		11.55	□□□□□ -0.56
DSL1	P53847	YMR057C	YMR057C	372 nt		11.53	□□□□□ -0.56
DSL1	P53847	YNL195C	YNL195C	786 nt		11.53	□□□□□ -0.56
DSL1	P53847	YIL100W	YIL100W	354 nt		11.51	□□□□□ -0.57
DSL1	P53847	YKL097C	YKL097C	411 nt		11.51	□□□□□ -0.57
DSL1	P53847	YHL050C	YHL050C	2094 nt		11.51	□□□□□ -0.57
DSL1	P53847	PIB2	YGL023C	1908 nt		11.5	□□□□□ -0.57
DSL1	P53847	BOR1	YNL275W	1731 nt		11.48	□□□□□ -0.57
DSL1	P53847	RRT12	YCR045C	1476 nt		11.46	□□□□□ -0.57
DSL1	P53847	BOP3	YNL042W	1191 nt		11.46	□□□□□ -0.57
DSL1	P53847	YLR236C	YLR236C	324 nt		11.43	□□□□□ -0.58
DSL1	P53847	YJL152W	YJL152W	360 nt		11.42	□□□□□ -0.58
DSL1	P53847	NPL3	YDR432W	1245 nt		11.4	□□□□□ -0.58
DSL1	P53847	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		11.38	□□□□□ -0.59
DSL1	P53847	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		11.35	□□□□□ -0.59
DSL1	P53847	YOL037C	YOL037C	354 nt		11.34	□□□□□ -0.59
DSL1	P53847	MCH5	YOR306C	1566 nt		11.33	□□□□□ -0.6
DSL1	P53847	PTK1	YKL198C	1989 nt		11.27	□□□□□ -0.61
DSL1	P53847	Q0182	Q0182	405 nt		11.24	□□□□□ -0.61
DSL1	P53847	RPM1	RPM1	483 nt		11.21	□□□□□ -0.61
DSL1	P53847	NCP1	YHR042W	2076 nt		11.16	□□□□□ -0.62
DSL1	P53847	YFL054C	YFL054C	1941 nt		11.13	□□□□□ -0.63
DSL1	P53847	WHI5	YOR083W	888 nt		11.11	□□□□□ -0.63
DSL1	P53847	ALG12	YNR030W	1656 nt		11.08	□□□□□ -0.64
DSL1	P53847	YLR281C	YLR281C	468 nt		11.07	□□□□□ -0.64
DSL1	P53847	IDH1	YNL037C	1083 nt		11.07	□□□□□ -0.64
DSL1	P53847	YOR139C	YOR139C	393 nt		11.06	□□□□□ -0.64
DSL1	P53847	SPT8	YLR055C	1809 nt		11.05	□□□□□ -0.64
DSL1	P53847	LCB1	YMR296C	1677 nt		11.04	□□□□□ -0.64
DSL1	P53847	GBP2	YCL011C	1284 nt		11.03	□□□□□ -0.64
DSL1	P53847	FMP52	YER004W	696 nt		11.02	□□□□□ -0.65
DSL1	P53847	RRD1	YIL153W	1182 nt		11.01	□□□□□ -0.65
DSL1	P53847	TCD2	YKL027W	1344 nt		10.99	□□□□□ -0.65
DSL1	P53847	HSP60	YLR259C	1719 nt		10.95	□□□□□ -0.66
DSL1	P53847	SIM1	YIL123W	1431 nt		10.94	□□□□□ -0.66
DSL1	P53847	PCM1	YEL058W	1674 nt		10.94	□□□□□ -0.66
DSL1	P53847	IMP2'	YIL154C	1041 nt		10.93	□□□□□ -0.66
DSL1	P53847	DED1	YOR204W	1815 nt		10.91	□□□□□ -0.66
DSL1	P53847	SNF6	YHL025W	999 nt		10.85	□□□□□ -0.67
DSL1	P53847	DSK2	YMR276W	1122 nt		10.85	□□□□□ -0.67
DSL1	P53847	PUS2	YGL063W	1113 nt		10.84	□□□□□ -0.67
DSL1	P53847	CWP1	YKL096W	720 nt		10.84	□□□□□ -0.67
DSL1	P53847	FMT1	YBL013W	1206 nt		10.84	□□□□□ -0.67
DSL1	P53847	YDR433W	YDR433W	441 nt		10.83	□□□□□ -0.68
DSL1	P53847	ADH2	YMR303C	1047 nt		10.82	□□□□□ -0.68
DSL1	P53847	GLK1	YCL040W	1503 nt		10.82	□□□□□ -0.68
DSL1	P53847	LYS4	YDR234W	2082 nt		10.81	□□□□□ -0.68
DSL1	P53847	BIO4	YNR057C	714 nt		10.8	□□□□□ -0.68
DSL1	P53847	SWE1	YJL187C	2460 nt		10.79	□□□□□ -0.68
DSL1	P53847	YCL042W	YCL042W	360 nt		10.76	□□□□□ -0.69
DSL1	P53847	MXR2	YCL033C	507 nt		10.74	□□□□□ -0.69
DSL1	P53847	FMP45	YDL222C	930 nt		10.73	□□□□□ -0.69
DSL1	P53847	SOR2	YDL246C	1074 nt		10.73	□□□□□ -0.69
DSL1	P53847	SOR1	YJR159W	1074 nt		10.73	□□□□□ -0.69
DSL1	P53847	ERF2	YLR246W	1080 nt		10.72	□□□□□ -0.69
DSL1	P53847	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		10.69	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		10.69	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		10.69	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		10.69	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		10.69	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	YIH1	YCR059C	777 nt		10.67	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	NAR1	YNL240C	1476 nt		10.67	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	YPR011C	YPR011C	981 nt		10.66	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	ERV46	YAL042W	1248 nt		10.65	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	YKR040C	YKR040C	504 nt		10.65	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	CRR1	YLR213C	1269 nt		10.65	□□□□□ -0.7
DSL1	P53847	AAC1	YMR056C	930 nt		10.64	□□□□□ -0.71
DSL1	P53847	YLL053C	YLL053C	459 nt		10.63	□□□□□ -0.71
DSL1	P53847	RNQ1	YCL028W	1218 nt		10.63	□□□□□ -0.71
DSL1	P53847	MOT3	YMR070W	1473 nt		10.62	□□□□□ -0.71
DSL1	P53847	LPX1	YOR084W	1164 nt		10.61	□□□□□ -0.71
DSL1	P53847	HSL7	YBR133C	2484 nt		10.61	□□□□□ -0.71
DSL1	P53847	FRD1	YEL047C	1413 nt		10.59	□□□□□ -0.71
DSL1	P53847	HEM12	YDR047W	1089 nt		10.59	□□□□□ -0.71
DSL1	P53847	YHR056W-A	YHR056W-A	435 nt		10.58	□□□□□ -0.72
DSL1	P53847	PRP4	YPR178W	1398 nt		10.56	□□□□□ -0.72
DSL1	P53847	YFL067W	YFL067W	528 nt		10.56	□□□□□ -0.72
DSL1	P53847	FUR4	YBR021W	1902 nt		10.56	□□□□□ -0.72

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