Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 WDR82-203ENST00000469000 587 ntTSL 526.45■■□□□ 1.821e-13■■■■■ 60.4
HNRNPMP52272 WDR82-202ENST00000463624 574 ntTSL 421.59■■□□□ 1.051e-13■■■■■ 60.4
HNRNPMP52272 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.071e-13■■■■■ 60.4
HNRNPMP52272 SLC25A37-201ENST00000290075 1889 ntTSL 1 (best)31.56■■■□□ 2.649e-9■■■■■ 59.7
HNRNPMP52272 SLC25A37-202ENST00000417331 735 ntTSL 531.04■■■□□ 2.569e-9■■■■■ 59.7
HNRNPMP52272 SLC25A37-212ENST00000523930 823 ntTSL 522.2■■□□□ 1.149e-9■■■■■ 59.7
HNRNPMP52272 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.879e-9■■■■■ 59.7
HNRNPMP52272 SLC25A37-204ENST00000518881 3404 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.459e-9■■■■■ 59.7
HNRNPMP52272 SLC25A37-207ENST00000520654 3018 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.129e-9■■■■■ 59.7
HNRNPMP52272 AP3D1-207ENST00000589369 618 ntTSL 327.47■■□□□ 1.992e-9■■■■■ 59.6
HNRNPMP52272 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)26.55■■□□□ 1.842e-9■■■■■ 59.6
HNRNPMP52272 AP3D1-203ENST00000585652 4433 ntTSL 217.44■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 59.6
HNRNPMP52272 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 216.78■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 59.6
HNRNPMP52272 AP3D1-205ENST00000586370 911 ntTSL 211.52□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 59.6
HNRNPMP52272 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.573e-10■■■■■ 58.4
HNRNPMP52272 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.43e-10■■■■■ 58.4
HNRNPMP52272 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.883e-10■■■■■ 58.4
HNRNPMP52272 MXRA7-205ENST00000588114 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.43e-10■■■■■ 58.4
HNRNPMP52272 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.963e-15■■■■■ 58.4
HNRNPMP52272 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.286e-13■■■■■ 58.2
HNRNPMP52272 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.726e-13■■■■■ 58.2
HNRNPMP52272 INO80B-WBP1-201ENST00000441673 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.21■■□□□ 1.476e-13■■■■■ 58.2
HNRNPMP52272 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.338e-7■■■■■ 58.1
HNRNPMP52272 FOXP1-205ENST00000468577 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 57.6
HNRNPMP52272 FOXP1-215ENST00000497355 1778 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 57.6
HNRNPMP52272 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 57.6
HNRNPMP52272 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.485e-7■■■■■ 57.3
HNRNPMP52272 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 324.38■■□□□ 1.495e-7■■■■■ 57.3
HNRNPMP52272 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.275e-7■■■■■ 57.3
HNRNPMP52272 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 57.3
HNRNPMP52272 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 57.3
HNRNPMP52272 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 418.69■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 57.3
HNRNPMP52272 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.643e-7■■■■■ 57
HNRNPMP52272 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.423e-7■■■■■ 57
HNRNPMP52272 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 56.8
HNRNPMP52272 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.47■■□□□ 1.516e-17■■■■■ 56.1
HNRNPMP52272 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 55.8
HNRNPMP52272 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.467e-9■■■■■ 55.7
HNRNPMP52272 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.227e-9■■■■■ 55.7
HNRNPMP52272 DUSP16-206ENST00000545864 554 ntTSL 44.5□□□□□ -1.697e-9■■■■■ 55.7
HNRNPMP52272 GALNT11-212ENST00000482812 580 ntTSL 436.67■■■■□ 3.463e-9■■■■■ 55.2
HNRNPMP52272 GALNT11-209ENST00000446096 521 ntTSL 327.73■■■□□ 2.033e-9■■■■■ 55.2
HNRNPMP52272 GALNT11-210ENST00000447778 1231 ntTSL 527.64■■■□□ 2.023e-9■■■■■ 55.2
HNRNPMP52272 GALNT11-206ENST00000431668 626 ntTSL 324.63■■□□□ 1.533e-9■■■■■ 55.2
HNRNPMP52272 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.443e-9■■■■■ 55.2
HNRNPMP52272 GALNT11-204ENST00000423337 580 ntTSL 321.69■■□□□ 1.063e-9■■■■■ 55.2
HNRNPMP52272 PRKCZ-218ENST00000482686 614 ntTSL 329.53■■■□□ 2.321e-7■■■■■ 54.7
HNRNPMP52272 PRKCZ-220ENST00000486681 966 ntTSL 329.53■■■□□ 2.321e-7■■■■■ 54.7
HNRNPMP52272 PRKCZ-211ENST00000470986 706 ntTSL 219.78■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 54.7
HNRNPMP52272 PRKCZ-209ENST00000470511 567 ntTSL 416.07■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 54.7
HNRNPMP52272 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.73■□□□□ 0.598e-12■■■■■ 54.4
HNRNPMP52272 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.518e-12■■■■■ 54.4
HNRNPMP52272 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 216.09■□□□□ 0.178e-12■■■■■ 54.4
HNRNPMP52272 HERC2-209ENST00000567869 3523 ntTSL 211.62□□□□□ -0.553e-10■■■■■ 54.3
HNRNPMP52272 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 534.36■■■■□ 3.094e-14■■■■■ 54.2
HNRNPMP52272 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.129e-7■■■■■ 53.6
HNRNPMP52272 BCAR3-207ENST00000479503 321 ntTSL 220.28■□□□□ 0.849e-7■■■■■ 53.6
HNRNPMP52272 BCAR3-203ENST00000370244 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 53.6
HNRNPMP52272 BCAR3-202ENST00000370243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 53.6
HNRNPMP52272 UPF1-212ENST00000601689 561 ntTSL 430.17■■■□□ 2.428e-16■■■■■ 52.8
HNRNPMP52272 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.698e-16■■■■■ 52.8
HNRNPMP52272 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.438e-16■■■■■ 52.8
HNRNPMP52272 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.181e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.61e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.521e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.461e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.831e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.61e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 NR3C1-211ENST00000504336 611 ntTSL 25.08□□□□□ -1.61e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.71e-15■■■■■ 52
HNRNPMP52272 MOCS1-208ENST00000473742 591 ntTSL 426.48■■□□□ 1.832e-9■■■■■ 51.5
HNRNPMP52272 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 51.5
HNRNPMP52272 MOCS1-202ENST00000373181 1527 ntTSL 1 (best)21.57■■□□□ 1.042e-9■■■■■ 51.5
HNRNPMP52272 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 51.5
HNRNPMP52272 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 51.5
HNRNPMP52272 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.752e-9■■■■■ 51.5
HNRNPMP52272 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-9■■■■■ 51.5
HNRNPMP52272 MOCS1-203ENST00000373186 4256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 51.5
HNRNPMP52272 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.566e-7■■■■■ 51.3
HNRNPMP52272 BACH1-206ENST00000451655 777 ntTSL 313.28□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 51.3
HNRNPMP52272 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 50.4
HNRNPMP52272 CTPS1-210ENST00000486889 568 ntTSL 214.7□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 50.4
HNRNPMP52272 CTPS1-203ENST00000463285 739 ntTSL 314.37□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 50.4
HNRNPMP52272 CTPS1-209ENST00000480420 750 ntTSL 312.87□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 50.4
HNRNPMP52272 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 50.4
HNRNPMP52272 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.185e-19■■■■■ 50.3
HNRNPMP52272 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.455e-19■■■■■ 50.3
HNRNPMP52272 AFDN-217ENST00000507679 670 ntTSL 312.29□□□□□ -0.441e-14■■■■■ 50.2
HNRNPMP52272 TAS2R4-201ENST00000247881 2378 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.199e-14■■■■■ 50.2
HNRNPMP52272 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 50.1
HNRNPMP52272 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 50.1
HNRNPMP52272 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 211.82□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 50.1
HNRNPMP52272 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 50.1
HNRNPMP52272 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 510.18□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 50.1
HNRNPMP52272 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 50.1
HNRNPMP52272 DDI2-205ENST00000546927 592 ntTSL 231.18■■■□□ 2.585e-13■■■■■ 50
HNRNPMP52272 DDI2-204ENST00000486680 1501 ntTSL 1 (best)23.99■■□□□ 1.435e-13■■■■■ 50
HNRNPMP52272 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.655e-13■■■■■ 50
HNRNPMP52272 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.925e-13■■■■■ 50
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 672.5 ms