Protein–RNA interactions for Protein: P50101

UBP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, yeastyeast

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP15P50101 YPS1YLR120C 1710 nt13.64□□□□□ -0.23
UBP15P50101 FMP45YDL222C 930 nt13.61□□□□□ -0.23
UBP15P50101 YDR095CYDR095C 411 nt13.61□□□□□ -0.23
UBP15P50101 YLR236CYLR236C 324 nt13.61□□□□□ -0.23
UBP15P50101 SIS1YNL007C 1059 nt13.51□□□□□ -0.25
UBP15P50101 YCH1YGR203W 447 nt13.5□□□□□ -0.25
UBP15P50101 YJL152WYJL152W 360 nt13.5□□□□□ -0.25
UBP15P50101 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.45□□□□□ -0.26
UBP15P50101 SPT5YML010W 3192 nt13.44□□□□□ -0.26
UBP15P50101 SSA4YER103W 1929 nt13.39□□□□□ -0.27
UBP15P50101 IDH1YNL037C 1083 nt13.38□□□□□ -0.27
UBP15P50101 TIR4YOR009W 1464 nt13.36□□□□□ -0.27
UBP15P50101 ERV46YAL042W 1248 nt13.36□□□□□ -0.27
UBP15P50101 RPP2AYOL039W 321 nt13.36□□□□□ -0.27
UBP15P50101 LPX1YOR084W 1164 nt13.36□□□□□ -0.27
UBP15P50101 MRPL8YJL063C 717 nt13.32□□□□□ -0.28
UBP15P50101 MEP2YNL142W 1500 nt13.29□□□□□ -0.28
UBP15P50101 PTP1YDL230W 1008 nt13.28□□□□□ -0.28
UBP15P50101 YDR433WYDR433W 441 nt13.26□□□□□ -0.29
UBP15P50101 ART5YGR068C 1761 nt13.25□□□□□ -0.29
UBP15P50101 YKR040CYKR040C 504 nt13.23□□□□□ -0.29
UBP15P50101 SPP1YPL138C 1062 nt13.23□□□□□ -0.29
UBP15P50101 Q0182Q0182 405 nt13.22□□□□□ -0.29
UBP15P50101 PET9YBL030C 957 nt13.22□□□□□ -0.29
UBP15P50101 GBP2YCL011C 1284 nt13.22□□□□□ -0.29
UBP15P50101 CAC2YML102W 1407 nt13.21□□□□□ -0.3
UBP15P50101 YMR057CYMR057C 372 nt13.18□□□□□ -0.3
UBP15P50101 GFD2YCL036W 1701 nt13.16□□□□□ -0.3
UBP15P50101 ADO1YJR105W 1023 nt13.14□□□□□ -0.31
UBP15P50101 MXR2YCL033C 507 nt13.13□□□□□ -0.31
UBP15P50101 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP15P50101 YEL076CYEL076C 651 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP15P50101 YLR464WYLR464W 651 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP15P50101 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP15P50101 RTG1YOL067C 534 nt13.1□□□□□ -0.31
UBP15P50101 DCW1YKL046C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
UBP15P50101 TCD2YKL027W 1344 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP15P50101 FPS1YLL043W 2010 nt12.97□□□□□ -0.33
UBP15P50101 DED1YOR204W 1815 nt12.95□□□□□ -0.34
UBP15P50101 EMI2YDR516C 1503 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP15P50101 YGR139WYGR139W 339 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP15P50101 RTS2YOR077W 699 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP15P50101 RRD1YIL153W 1182 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP15P50101 FRD1YEL047C 1413 nt12.9□□□□□ -0.34
UBP15P50101 IRC15YPL017C 1500 nt12.9□□□□□ -0.34
UBP15P50101 BDF1YLR399C 2061 nt12.9□□□□□ -0.34
UBP15P50101 UBX6YJL048C 1191 nt12.89□□□□□ -0.35
UBP15P50101 YDL221WYDL221W 552 nt12.88□□□□□ -0.35
UBP15P50101 HUA1YGR268C 597 nt12.85□□□□□ -0.35
UBP15P50101 CUE1YMR264W 612 nt12.85□□□□□ -0.35
UBP15P50101 YMR090WYMR090W 684 nt12.82□□□□□ -0.36
UBP15P50101 FMT1YBL013W 1206 nt12.81□□□□□ -0.36
UBP15P50101 GIS3YLR094C 1509 nt12.79□□□□□ -0.36
UBP15P50101 SOR2YDL246C 1074 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP15P50101 SOR1YJR159W 1074 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP15P50101 YCL042WYCL042W 360 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP15P50101 PTH1YHR189W 573 nt12.73□□□□□ -0.37
UBP15P50101 TAT1YBR069C 1860 nt12.72□□□□□ -0.37
UBP15P50101 YLR235CYLR235C 399 nt12.71□□□□□ -0.37
UBP15P50101 FMP52YER004W 696 nt12.7□□□□□ -0.38
UBP15P50101 YKL030WYKL030W 606 nt12.7□□□□□ -0.38
UBP15P50101 YDR094WYDR094W 336 nt12.69□□□□□ -0.38
UBP15P50101 YIL100WYIL100W 354 nt12.67□□□□□ -0.38
UBP15P50101 SDH1YKL148C 1923 nt12.65□□□□□ -0.38
UBP15P50101 SCC4YER147C 1875 nt12.63□□□□□ -0.39
UBP15P50101 CWP1YKL096W 720 nt12.62□□□□□ -0.39
UBP15P50101 LCB1YMR296C 1677 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP15P50101 ADH2YMR303C 1047 nt12.6□□□□□ -0.39
UBP15P50101 YBR220CYBR220C 1683 nt12.57□□□□□ -0.4
UBP15P50101 PCM1YEL058W 1674 nt12.5□□□□□ -0.41
UBP15P50101 PAC11YDR488C 1602 nt12.49□□□□□ -0.41
UBP15P50101 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.49□□□□□ -0.41
UBP15P50101 TIM23YNR017W 669 nt12.48□□□□□ -0.41
UBP15P50101 SNF6YHL025W 999 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP15P50101 DIC1YLR348C 897 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP15P50101 RNQ1YCL028W 1218 nt12.4□□□□□ -0.42
UBP15P50101 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.39□□□□□ -0.43
UBP15P50101 YNL195CYNL195C 786 nt12.39□□□□□ -0.43
UBP15P50101 YIH1YCR059C 777 nt12.38□□□□□ -0.43
UBP15P50101 YLR179CYLR179C 606 nt12.38□□□□□ -0.43
UBP15P50101 YFR018CYFR018C 1092 nt12.34□□□□□ -0.43
UBP15P50101 YPR064WYPR064W 420 nt12.34□□□□□ -0.43
UBP15P50101 RRT12YCR045C 1476 nt12.32□□□□□ -0.44
UBP15P50101 NVJ2YPR091C 2313 nt12.31□□□□□ -0.44
UBP15P50101 NME1NME1 340 nt12.31□□□□□ -0.44
UBP15P50101 WSC2YNL283C 1512 nt12.29□□□□□ -0.44
UBP15P50101 TAD3YLR316C 969 nt12.29□□□□□ -0.44
UBP15P50101 AHT1YHR093W 549 nt12.28□□□□□ -0.44
UBP15P50101 PAU16YKL224C 372 nt12.28□□□□□ -0.44
UBP15P50101 YSC84YHR016C 1407 nt12.26□□□□□ -0.45
UBP15P50101 RRT5YFR032C 870 nt12.24□□□□□ -0.45
UBP15P50101 YLL053CYLL053C 459 nt12.23□□□□□ -0.45
UBP15P50101 PRE6YOL038W 765 nt12.23□□□□□ -0.45
UBP15P50101 YHL050CYHL050C 2094 nt12.23□□□□□ -0.45
UBP15P50101 BIO4YNR057C 714 nt12.22□□□□□ -0.45
UBP15P50101 PCH2YBR186W 1695 nt12.2□□□□□ -0.46
UBP15P50101 SEC11YIR022W 504 nt12.2□□□□□ -0.46
UBP15P50101 FTR1YER145C 1215 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP15P50101 AQY1YPR192W 918 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP15P50101 SIM1YIL123W 1431 nt12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms