Protein–RNA interactions for Protein: P47076

RPC17, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC17P47076 SDH1YKL148C 1923 nt13.05□□□□□ -0.32
RPC17P47076 RKM5YLR137W 1104 nt13□□□□□ -0.33
RPC17P47076 IRC15YPL017C 1500 nt12.97□□□□□ -0.33
RPC17P47076 ART5YGR068C 1761 nt12.97□□□□□ -0.33
RPC17P47076 GFD2YCL036W 1701 nt12.94□□□□□ -0.34
RPC17P47076 SCC4YER147C 1875 nt12.93□□□□□ -0.34
RPC17P47076 GIS3YLR094C 1509 nt12.88□□□□□ -0.35
RPC17P47076 PET9YBL030C 957 nt12.87□□□□□ -0.35
RPC17P47076 YCH1YGR203W 447 nt12.83□□□□□ -0.36
RPC17P47076 RTS2YOR077W 699 nt12.83□□□□□ -0.36
RPC17P47076 TIR4YOR009W 1464 nt12.82□□□□□ -0.36
RPC17P47076 YOL037CYOL037C 354 nt12.75□□□□□ -0.37
RPC17P47076 SEC11YIR022W 504 nt12.72□□□□□ -0.37
RPC17P47076 CUE1YMR264W 612 nt12.72□□□□□ -0.37
RPC17P47076 NPL3YDR432W 1245 nt12.71□□□□□ -0.37
RPC17P47076 YMR057CYMR057C 372 nt12.71□□□□□ -0.37
RPC17P47076 PCH2YBR186W 1695 nt12.68□□□□□ -0.38
RPC17P47076 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.67□□□□□ -0.38
RPC17P47076 YSC84YHR016C 1407 nt12.64□□□□□ -0.39
RPC17P47076 YJL152WYJL152W 360 nt12.63□□□□□ -0.39
RPC17P47076 GUT2YIL155C 1950 nt12.62□□□□□ -0.39
RPC17P47076 YOR139CYOR139C 393 nt12.6□□□□□ -0.39
RPC17P47076 FPS1YLL043W 2010 nt12.6□□□□□ -0.39
RPC17P47076 YIL100WYIL100W 354 nt12.57□□□□□ -0.4
RPC17P47076 YHL050CYHL050C 2094 nt12.57□□□□□ -0.4
RPC17P47076 YLR236CYLR236C 324 nt12.53□□□□□ -0.4
RPC17P47076 YNL195CYNL195C 786 nt12.52□□□□□ -0.41
RPC17P47076 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.52□□□□□ -0.41
RPC17P47076 RRT12YCR045C 1476 nt12.52□□□□□ -0.41
RPC17P47076 WHI5YOR083W 888 nt12.46□□□□□ -0.41
RPC17P47076 YLR281CYLR281C 468 nt12.45□□□□□ -0.42
RPC17P47076 PIB2YGL023C 1908 nt12.42□□□□□ -0.42
RPC17P47076 RTF1YGL244W 1677 nt12.37□□□□□ -0.43
RPC17P47076 IDH1YNL037C 1083 nt12.32□□□□□ -0.44
RPC17P47076 BOP3YNL042W 1191 nt12.31□□□□□ -0.44
RPC17P47076 GBP2YCL011C 1284 nt12.26□□□□□ -0.45
RPC17P47076 PAC11YDR488C 1602 nt12.26□□□□□ -0.45
RPC17P47076 RRD1YIL153W 1182 nt12.23□□□□□ -0.45
RPC17P47076 PUS2YGL063W 1113 nt12.22□□□□□ -0.45
RPC17P47076 IMP2'YIL154C 1041 nt12.22□□□□□ -0.45
RPC17P47076 NCP1YHR042W 2076 nt12.21□□□□□ -0.45
RPC17P47076 DSK2YMR276W 1122 nt12.19□□□□□ -0.46
RPC17P47076 PTK1YKL198C 1989 nt12.18□□□□□ -0.46
RPC17P47076 TCD2YKL027W 1344 nt12.17□□□□□ -0.46
RPC17P47076 FMP52YER004W 696 nt12.16□□□□□ -0.46
RPC17P47076 DED1YOR204W 1815 nt12.16□□□□□ -0.46
RPC17P47076 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.14□□□□□ -0.47
RPC17P47076 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.14□□□□□ -0.47
RPC17P47076 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.14□□□□□ -0.47
RPC17P47076 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.14□□□□□ -0.47
RPC17P47076 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.14□□□□□ -0.47
RPC17P47076 LCB1YMR296C 1677 nt12.12□□□□□ -0.47
RPC17P47076 YDR433WYDR433W 441 nt12.07□□□□□ -0.48
RPC17P47076 FMT1YBL013W 1206 nt12.06□□□□□ -0.48
RPC17P47076 PCM1YEL058W 1674 nt12.06□□□□□ -0.48
RPC17P47076 YPR011CYPR011C 981 nt12.04□□□□□ -0.48
RPC17P47076 FMP45YDL222C 930 nt12.03□□□□□ -0.48
RPC17P47076 MXR2YCL033C 507 nt12.01□□□□□ -0.49
RPC17P47076 SIM1YIL123W 1431 nt11.99□□□□□ -0.49
RPC17P47076 CWP1YKL096W 720 nt11.98□□□□□ -0.49
RPC17P47076 ADH2YMR303C 1047 nt11.98□□□□□ -0.49
RPC17P47076 ERV46YAL042W 1248 nt11.97□□□□□ -0.49
RPC17P47076 SNF6YHL025W 999 nt11.96□□□□□ -0.49
RPC17P47076 YFL054CYFL054C 1941 nt11.96□□□□□ -0.5
RPC17P47076 SOR2YDL246C 1074 nt11.95□□□□□ -0.5
RPC17P47076 SOR1YJR159W 1074 nt11.95□□□□□ -0.5
RPC17P47076 YJL225CYJL225C 5277 nt11.95□□□□□ -0.5
RPC17P47076 LPX1YOR084W 1164 nt11.94□□□□□ -0.5
RPC17P47076 YCL042WYCL042W 360 nt11.93□□□□□ -0.5
RPC17P47076 YKR040CYKR040C 504 nt11.91□□□□□ -0.5
RPC17P47076 BIO4YNR057C 714 nt11.91□□□□□ -0.5
RPC17P47076 LYS4YDR234W 2082 nt11.87□□□□□ -0.51
RPC17P47076 SPT8YLR055C 1809 nt11.86□□□□□ -0.51
RPC17P47076 FRD1YEL047C 1413 nt11.86□□□□□ -0.51
RPC17P47076 YIH1YCR059C 777 nt11.8□□□□□ -0.52
RPC17P47076 ERF2YLR246W 1080 nt11.77□□□□□ -0.53
RPC17P47076 RNQ1YCL028W 1218 nt11.76□□□□□ -0.53
RPC17P47076 YLL053CYLL053C 459 nt11.73□□□□□ -0.53
RPC17P47076 CRR1YLR213C 1269 nt11.73□□□□□ -0.53
RPC17P47076 NVJ2YPR091C 2313 nt11.68□□□□□ -0.54
RPC17P47076 SWE1YJL187C 2460 nt11.67□□□□□ -0.54
RPC17P47076 DIC1YLR348C 897 nt11.67□□□□□ -0.54
RPC17P47076 ATF2YGR177C 1608 nt11.64□□□□□ -0.55
RPC17P47076 FTR1YER145C 1215 nt11.63□□□□□ -0.55
RPC17P47076 HEM12YDR047W 1089 nt11.62□□□□□ -0.55
RPC17P47076 YFL067WYFL067W 528 nt11.61□□□□□ -0.55
RPC17P47076 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.6□□□□□ -0.55
RPC17P47076 MIC10YCL057C-A 294 nt11.59□□□□□ -0.55
RPC17P47076 GAL1YBR020W 1587 nt11.58□□□□□ -0.55
RPC17P47076 TRM5YHR070W 1500 nt11.58□□□□□ -0.56
RPC17P47076 SNG1YGR197C 1644 nt11.57□□□□□ -0.56
RPC17P47076 SPP1YPL138C 1062 nt11.56□□□□□ -0.56
RPC17P47076 PTH1YHR189W 573 nt11.54□□□□□ -0.56
RPC17P47076 DDR2YOL052C-A 186 nt11.54□□□□□ -0.56
RPC17P47076 YLR235CYLR235C 399 nt11.53□□□□□ -0.56
RPC17P47076 MOT3YMR070W 1473 nt11.51□□□□□ -0.57
RPC17P47076 AQY1YPR192W 918 nt11.51□□□□□ -0.57
RPC17P47076 BOR1YNL275W 1731 nt11.51□□□□□ -0.57
RPC17P47076 RAX1YOR301W 1308 nt11.5□□□□□ -0.57
RPC17P47076 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.5 ms