Protein–RNA interactions for Protein: P43568

CAK1, Serine/threonine-protein kinase CAK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAK1P43568 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.62□□□□□ -0.55
CAK1P43568 IRC15YPL017C 1500 nt11.59□□□□□ -0.55
CAK1P43568 MNP1YGL068W 585 nt11.57□□□□□ -0.56
CAK1P43568 YKL097CYKL097C 411 nt11.57□□□□□ -0.56
CAK1P43568 ART5YGR068C 1761 nt11.53□□□□□ -0.56
CAK1P43568 GFD2YCL036W 1701 nt11.52□□□□□ -0.56
CAK1P43568 SCC4YER147C 1875 nt11.51□□□□□ -0.57
CAK1P43568 GIS3YLR094C 1509 nt11.5□□□□□ -0.57
CAK1P43568 RKM5YLR137W 1104 nt11.49□□□□□ -0.57
CAK1P43568 PET9YBL030C 957 nt11.42□□□□□ -0.58
CAK1P43568 RTS2YOR077W 699 nt11.42□□□□□ -0.58
CAK1P43568 TIR4YOR009W 1464 nt11.4□□□□□ -0.58
CAK1P43568 YCH1YGR203W 447 nt11.34□□□□□ -0.59
CAK1P43568 PCH2YBR186W 1695 nt11.33□□□□□ -0.6
CAK1P43568 SEC11YIR022W 504 nt11.31□□□□□ -0.6
CAK1P43568 YMR057CYMR057C 372 nt11.3□□□□□ -0.6
CAK1P43568 CUE1YMR264W 612 nt11.3□□□□□ -0.6
CAK1P43568 GUT2YIL155C 1950 nt11.29□□□□□ -0.6
CAK1P43568 NPL3YDR432W 1245 nt11.29□□□□□ -0.6
CAK1P43568 YSC84YHR016C 1407 nt11.27□□□□□ -0.6
CAK1P43568 YHL050CYHL050C 2094 nt11.24□□□□□ -0.61
CAK1P43568 PAC11YDR488C 1602 nt11.24□□□□□ -0.61
CAK1P43568 FPS1YLL043W 2010 nt11.23□□□□□ -0.61
CAK1P43568 RRT12YCR045C 1476 nt11.2□□□□□ -0.62
CAK1P43568 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.2□□□□□ -0.62
CAK1P43568 YOL037CYOL037C 354 nt11.2□□□□□ -0.62
CAK1P43568 PIB2YGL023C 1908 nt11.17□□□□□ -0.62
CAK1P43568 YJL152WYJL152W 360 nt11.16□□□□□ -0.62
CAK1P43568 YIL100WYIL100W 354 nt11.13□□□□□ -0.63
CAK1P43568 YOR139CYOR139C 393 nt11.13□□□□□ -0.63
CAK1P43568 YLR236CYLR236C 324 nt11.08□□□□□ -0.64
CAK1P43568 YNL195CYNL195C 786 nt11.08□□□□□ -0.64
CAK1P43568 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.05□□□□□ -0.64
CAK1P43568 RTF1YGL244W 1677 nt11.04□□□□□ -0.64
CAK1P43568 WHI5YOR083W 888 nt11.02□□□□□ -0.65
CAK1P43568 YLR281CYLR281C 468 nt11□□□□□ -0.65
CAK1P43568 BOP3YNL042W 1191 nt10.96□□□□□ -0.65
CAK1P43568 NCP1YHR042W 2076 nt10.93□□□□□ -0.66
CAK1P43568 PTK1YKL198C 1989 nt10.92□□□□□ -0.66
CAK1P43568 RRD1YIL153W 1182 nt10.89□□□□□ -0.67
CAK1P43568 NVJ2YPR091C 2313 nt10.86□□□□□ -0.67
CAK1P43568 IDH1YNL037C 1083 nt10.85□□□□□ -0.67
CAK1P43568 GBP2YCL011C 1284 nt10.83□□□□□ -0.68
CAK1P43568 DED1YOR204W 1815 nt10.82□□□□□ -0.68
CAK1P43568 LCB1YMR296C 1677 nt10.82□□□□□ -0.68
CAK1P43568 PUS2YGL063W 1113 nt10.77□□□□□ -0.69
CAK1P43568 FMT1YBL013W 1206 nt10.76□□□□□ -0.69
CAK1P43568 FMP52YER004W 696 nt10.75□□□□□ -0.69
CAK1P43568 TCD2YKL027W 1344 nt10.75□□□□□ -0.69
CAK1P43568 YPR011CYPR011C 981 nt10.74□□□□□ -0.69
CAK1P43568 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.73□□□□□ -0.69
CAK1P43568 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.73□□□□□ -0.69
CAK1P43568 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.73□□□□□ -0.69
CAK1P43568 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.73□□□□□ -0.69
CAK1P43568 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.73□□□□□ -0.69
CAK1P43568 IMP2'YIL154C 1041 nt10.73□□□□□ -0.69
CAK1P43568 DSK2YMR276W 1122 nt10.73□□□□□ -0.69
CAK1P43568 PCM1YEL058W 1674 nt10.72□□□□□ -0.69
CAK1P43568 YFL054CYFL054C 1941 nt10.66□□□□□ -0.7
CAK1P43568 FMP45YDL222C 930 nt10.66□□□□□ -0.7
CAK1P43568 ADH2YMR303C 1047 nt10.66□□□□□ -0.7
CAK1P43568 MXR2YCL033C 507 nt10.66□□□□□ -0.7
CAK1P43568 YDR433WYDR433W 441 nt10.65□□□□□ -0.7
CAK1P43568 SIM1YIL123W 1431 nt10.65□□□□□ -0.7
CAK1P43568 CWP1YKL096W 720 nt10.63□□□□□ -0.71
CAK1P43568 LYS4YDR234W 2082 nt10.61□□□□□ -0.71
CAK1P43568 SPT8YLR055C 1809 nt10.6□□□□□ -0.71
CAK1P43568 SOR2YDL246C 1074 nt10.58□□□□□ -0.72
CAK1P43568 SNF6YHL025W 999 nt10.58□□□□□ -0.72
CAK1P43568 SOR1YJR159W 1074 nt10.58□□□□□ -0.72
CAK1P43568 ERV46YAL042W 1248 nt10.58□□□□□ -0.72
CAK1P43568 BIO4YNR057C 714 nt10.58□□□□□ -0.72
CAK1P43568 LPX1YOR084W 1164 nt10.58□□□□□ -0.72
CAK1P43568 YKR040CYKR040C 504 nt10.52□□□□□ -0.73
CAK1P43568 FRD1YEL047C 1413 nt10.51□□□□□ -0.73
CAK1P43568 YCL042WYCL042W 360 nt10.51□□□□□ -0.73
CAK1P43568 YIH1YCR059C 777 nt10.48□□□□□ -0.73
CAK1P43568 SWE1YJL187C 2460 nt10.44□□□□□ -0.74
CAK1P43568 RNQ1YCL028W 1218 nt10.43□□□□□ -0.74
CAK1P43568 YLL053CYLL053C 459 nt10.42□□□□□ -0.74
CAK1P43568 CRR1YLR213C 1269 nt10.42□□□□□ -0.74
CAK1P43568 ERF2YLR246W 1080 nt10.42□□□□□ -0.74
CAK1P43568 ATF2YGR177C 1608 nt10.36□□□□□ -0.75
CAK1P43568 MIC10YCL057C-A 294 nt10.34□□□□□ -0.75
CAK1P43568 FTR1YER145C 1215 nt10.32□□□□□ -0.76
CAK1P43568 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.32□□□□□ -0.76
CAK1P43568 DIC1YLR348C 897 nt10.32□□□□□ -0.76
CAK1P43568 BOR1YNL275W 1731 nt10.32□□□□□ -0.76
CAK1P43568 HEM12YDR047W 1089 nt10.3□□□□□ -0.76
CAK1P43568 SNG1YGR197C 1644 nt10.29□□□□□ -0.76
CAK1P43568 GAL1YBR020W 1587 nt10.29□□□□□ -0.76
CAK1P43568 TRM5YHR070W 1500 nt10.28□□□□□ -0.76
CAK1P43568 YJL225CYJL225C 5277 nt10.27□□□□□ -0.77
CAK1P43568 YFL067WYFL067W 528 nt10.27□□□□□ -0.77
CAK1P43568 SPP1YPL138C 1062 nt10.27□□□□□ -0.77
CAK1P43568 PTH1YHR189W 573 nt10.22□□□□□ -0.77
CAK1P43568 RAX1YOR301W 1308 nt10.21□□□□□ -0.78
CAK1P43568 DDR2YOL052C-A 186 nt10.2□□□□□ -0.78
CAK1P43568 HSP60YLR259C 1719 nt10.19□□□□□ -0.78
CAK1P43568 CCA1YER168C 1641 nt10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.1 ms