Protein–RNA interactions for Protein: P42841

PFS2, Polyadenylation factor subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFS2P42841 SCC4YER147C 1875 nt11.21□□□□□ -0.62
PFS2P42841 HOM6YJR139C 1080 nt11.2□□□□□ -0.62
PFS2P42841 GIS3YLR094C 1509 nt11.14□□□□□ -0.63
PFS2P42841 ART5YGR068C 1761 nt11.14□□□□□ -0.63
PFS2P42841 GFD2YCL036W 1701 nt11.14□□□□□ -0.63
PFS2P42841 MNP1YGL068W 585 nt11.12□□□□□ -0.63
PFS2P42841 SEC11YIR022W 504 nt11.09□□□□□ -0.63
PFS2P42841 PCH2YBR186W 1695 nt11.08□□□□□ -0.64
PFS2P42841 RTS2YOR077W 699 nt11.08□□□□□ -0.64
PFS2P42841 PET9YBL030C 957 nt11.05□□□□□ -0.64
PFS2P42841 RKM5YLR137W 1104 nt11.04□□□□□ -0.64
PFS2P42841 GUT2YIL155C 1950 nt11.03□□□□□ -0.64
PFS2P42841 YSC84YHR016C 1407 nt11□□□□□ -0.65
PFS2P42841 YOR139CYOR139C 393 nt10.98□□□□□ -0.65
PFS2P42841 TIR4YOR009W 1464 nt10.98□□□□□ -0.65
PFS2P42841 YCH1YGR203W 447 nt10.97□□□□□ -0.65
PFS2P42841 CUE1YMR264W 612 nt10.96□□□□□ -0.65
PFS2P42841 PAC11YDR488C 1602 nt10.95□□□□□ -0.66
PFS2P42841 NPL3YDR432W 1245 nt10.92□□□□□ -0.66
PFS2P42841 YOL037CYOL037C 354 nt10.92□□□□□ -0.66
PFS2P42841 YHL050CYHL050C 2094 nt10.91□□□□□ -0.66
PFS2P42841 YMR057CYMR057C 372 nt10.89□□□□□ -0.67
PFS2P42841 RRT12YCR045C 1476 nt10.86□□□□□ -0.67
PFS2P42841 PIB2YGL023C 1908 nt10.84□□□□□ -0.67
PFS2P42841 YIL100WYIL100W 354 nt10.84□□□□□ -0.67
PFS2P42841 YNL195CYNL195C 786 nt10.84□□□□□ -0.67
PFS2P42841 FPS1YLL043W 2010 nt10.81□□□□□ -0.68
PFS2P42841 RTF1YGL244W 1677 nt10.8□□□□□ -0.68
PFS2P42841 YLR236CYLR236C 324 nt10.76□□□□□ -0.69
PFS2P42841 YJL152WYJL152W 360 nt10.75□□□□□ -0.69
PFS2P42841 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.73□□□□□ -0.69
PFS2P42841 BOP3YNL042W 1191 nt10.72□□□□□ -0.69
PFS2P42841 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.69□□□□□ -0.7
PFS2P42841 YLR281CYLR281C 468 nt10.68□□□□□ -0.7
PFS2P42841 WHI5YOR083W 888 nt10.66□□□□□ -0.7
PFS2P42841 PTK1YKL198C 1989 nt10.63□□□□□ -0.71
PFS2P42841 NCP1YHR042W 2076 nt10.57□□□□□ -0.72
PFS2P42841 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.57□□□□□ -0.72
PFS2P42841 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.57□□□□□ -0.72
PFS2P42841 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.57□□□□□ -0.72
PFS2P42841 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.57□□□□□ -0.72
PFS2P42841 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.57□□□□□ -0.72
PFS2P42841 PUS2YGL063W 1113 nt10.54□□□□□ -0.72
PFS2P42841 LCB1YMR296C 1677 nt10.47□□□□□ -0.73
PFS2P42841 NVJ2YPR091C 2313 nt10.46□□□□□ -0.74
PFS2P42841 IMP2'YIL154C 1041 nt10.44□□□□□ -0.74
PFS2P42841 YFL054CYFL054C 1941 nt10.44□□□□□ -0.74
PFS2P42841 RRD1YIL153W 1182 nt10.43□□□□□ -0.74
PFS2P42841 IDH1YNL037C 1083 nt10.43□□□□□ -0.74
PFS2P42841 DSK2YMR276W 1122 nt10.41□□□□□ -0.74
PFS2P42841 GBP2YCL011C 1284 nt10.4□□□□□ -0.74
PFS2P42841 FMP52YER004W 696 nt10.38□□□□□ -0.75
PFS2P42841 YPR011CYPR011C 981 nt10.37□□□□□ -0.75
PFS2P42841 SPT8YLR055C 1809 nt10.35□□□□□ -0.75
PFS2P42841 TCD2YKL027W 1344 nt10.34□□□□□ -0.75
PFS2P42841 DED1YOR204W 1815 nt10.34□□□□□ -0.75
PFS2P42841 PCM1YEL058W 1674 nt10.33□□□□□ -0.76
PFS2P42841 SIM1YIL123W 1431 nt10.33□□□□□ -0.76
PFS2P42841 FMT1YBL013W 1206 nt10.28□□□□□ -0.76
PFS2P42841 FMP45YDL222C 930 nt10.27□□□□□ -0.77
PFS2P42841 YJL225CYJL225C 5277 nt10.26□□□□□ -0.77
PFS2P42841 LYS4YDR234W 2082 nt10.24□□□□□ -0.77
PFS2P42841 YDR433WYDR433W 441 nt10.24□□□□□ -0.77
PFS2P42841 CWP1YKL096W 720 nt10.24□□□□□ -0.77
PFS2P42841 ADH2YMR303C 1047 nt10.24□□□□□ -0.77
PFS2P42841 SNF6YHL025W 999 nt10.23□□□□□ -0.77
PFS2P42841 BIO4YNR057C 714 nt10.23□□□□□ -0.77
PFS2P42841 ERV46YAL042W 1248 nt10.22□□□□□ -0.77
PFS2P42841 LPX1YOR084W 1164 nt10.21□□□□□ -0.77
PFS2P42841 SWE1YJL187C 2460 nt10.18□□□□□ -0.78
PFS2P42841 BOR1YNL275W 1731 nt10.18□□□□□ -0.78
PFS2P42841 MXR2YCL033C 507 nt10.17□□□□□ -0.78
PFS2P42841 YKR040CYKR040C 504 nt10.16□□□□□ -0.78
PFS2P42841 SOR2YDL246C 1074 nt10.15□□□□□ -0.78
PFS2P42841 SOR1YJR159W 1074 nt10.15□□□□□ -0.78
PFS2P42841 YCL042WYCL042W 360 nt10.13□□□□□ -0.79
PFS2P42841 ERF2YLR246W 1080 nt10.11□□□□□ -0.79
PFS2P42841 MOT3YMR070W 1473 nt10.1□□□□□ -0.79
PFS2P42841 CRR1YLR213C 1269 nt10.09□□□□□ -0.79
PFS2P42841 YIH1YCR059C 777 nt10.08□□□□□ -0.8
PFS2P42841 YLL053CYLL053C 459 nt10.04□□□□□ -0.8
PFS2P42841 FRD1YEL047C 1413 nt10.03□□□□□ -0.8
PFS2P42841 RNQ1YCL028W 1218 nt10.03□□□□□ -0.8
PFS2P42841 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.02□□□□□ -0.81
PFS2P42841 HSP60YLR259C 1719 nt10.02□□□□□ -0.81
PFS2P42841 HEM12YDR047W 1089 nt9.99□□□□□ -0.81
PFS2P42841 ATF2YGR177C 1608 nt9.98□□□□□ -0.81
PFS2P42841 SPP1YPL138C 1062 nt9.98□□□□□ -0.81
PFS2P42841 MIC10YCL057C-A 294 nt9.97□□□□□ -0.81
PFS2P42841 SNG1YGR197C 1644 nt9.94□□□□□ -0.82
PFS2P42841 YFL067WYFL067W 528 nt9.94□□□□□ -0.82
PFS2P42841 GLK1YCL040W 1503 nt9.93□□□□□ -0.82
PFS2P42841 RAX1YOR301W 1308 nt9.93□□□□□ -0.82
PFS2P42841 FTR1YER145C 1215 nt9.93□□□□□ -0.82
PFS2P42841 DIC1YLR348C 897 nt9.92□□□□□ -0.82
PFS2P42841 FUR4YBR021W 1902 nt9.9□□□□□ -0.82
PFS2P42841 CCA1YER168C 1641 nt9.9□□□□□ -0.82
PFS2P42841 GAL1YBR020W 1587 nt9.9□□□□□ -0.82
PFS2P42841 TRM5YHR070W 1500 nt9.9□□□□□ -0.82
PFS2P42841 DDR2YOL052C-A 186 nt9.88□□□□□ -0.83
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