Protein–RNA interactions for Protein: P40516

EFM4, Protein-lysine N-methyltransferase EFM4, yeastyeast

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EFM4P40516 IRC15YPL017C 1500 nt13.3□□□□□ -0.28
EFM4P40516 ART5YGR068C 1761 nt13.27□□□□□ -0.28
EFM4P40516 GFD2YCL036W 1701 nt13.24□□□□□ -0.29
EFM4P40516 YKL097CYKL097C 411 nt13.22□□□□□ -0.29
EFM4P40516 SCC4YER147C 1875 nt13.22□□□□□ -0.29
EFM4P40516 RKM5YLR137W 1104 nt13.21□□□□□ -0.29
EFM4P40516 GIS3YLR094C 1509 nt13.21□□□□□ -0.29
EFM4P40516 RTS2YOR077W 699 nt13.19□□□□□ -0.3
EFM4P40516 TIR4YOR009W 1464 nt13.11□□□□□ -0.31
EFM4P40516 PET9YBL030C 957 nt13.1□□□□□ -0.31
EFM4P40516 YMR057CYMR057C 372 nt13.02□□□□□ -0.33
EFM4P40516 YCH1YGR203W 447 nt12.99□□□□□ -0.33
EFM4P40516 PCH2YBR186W 1695 nt12.98□□□□□ -0.33
EFM4P40516 YSC84YHR016C 1407 nt12.97□□□□□ -0.33
EFM4P40516 CUE1YMR264W 612 nt12.97□□□□□ -0.33
EFM4P40516 NPL3YDR432W 1245 nt12.96□□□□□ -0.33
EFM4P40516 GUT2YIL155C 1950 nt12.93□□□□□ -0.34
EFM4P40516 SEC11YIR022W 504 nt12.93□□□□□ -0.34
EFM4P40516 YJL152WYJL152W 360 nt12.91□□□□□ -0.34
EFM4P40516 YHL050CYHL050C 2094 nt12.9□□□□□ -0.34
EFM4P40516 FPS1YLL043W 2010 nt12.89□□□□□ -0.35
EFM4P40516 RRT12YCR045C 1476 nt12.89□□□□□ -0.35
EFM4P40516 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.88□□□□□ -0.35
EFM4P40516 YOL037CYOL037C 354 nt12.85□□□□□ -0.35
EFM4P40516 YIL100WYIL100W 354 nt12.82□□□□□ -0.36
EFM4P40516 YOR139CYOR139C 393 nt12.81□□□□□ -0.36
EFM4P40516 PIB2YGL023C 1908 nt12.76□□□□□ -0.37
EFM4P40516 YNL195CYNL195C 786 nt12.75□□□□□ -0.37
EFM4P40516 YLR236CYLR236C 324 nt12.74□□□□□ -0.37
EFM4P40516 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.74□□□□□ -0.37
EFM4P40516 WHI5YOR083W 888 nt12.67□□□□□ -0.38
EFM4P40516 RTF1YGL244W 1677 nt12.66□□□□□ -0.38
EFM4P40516 PAC11YDR488C 1602 nt12.64□□□□□ -0.39
EFM4P40516 YLR281CYLR281C 468 nt12.63□□□□□ -0.39
EFM4P40516 BOP3YNL042W 1191 nt12.56□□□□□ -0.4
EFM4P40516 PTK1YKL198C 1989 nt12.5□□□□□ -0.41
EFM4P40516 RRD1YIL153W 1182 nt12.5□□□□□ -0.41
EFM4P40516 NCP1YHR042W 2076 nt12.49□□□□□ -0.41
EFM4P40516 IDH1YNL037C 1083 nt12.49□□□□□ -0.41
EFM4P40516 GBP2YCL011C 1284 nt12.49□□□□□ -0.41
EFM4P40516 Q0182Q0182 405 nt12.44□□□□□ -0.42
EFM4P40516 DED1YOR204W 1815 nt12.43□□□□□ -0.42
EFM4P40516 LCB1YMR296C 1677 nt12.42□□□□□ -0.42
EFM4P40516 PUS2YGL063W 1113 nt12.42□□□□□ -0.42
EFM4P40516 TCD2YKL027W 1344 nt12.37□□□□□ -0.43
EFM4P40516 FMT1YBL013W 1206 nt12.36□□□□□ -0.43
EFM4P40516 YPR011CYPR011C 981 nt12.36□□□□□ -0.43
EFM4P40516 DSK2YMR276W 1122 nt12.35□□□□□ -0.43
EFM4P40516 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.33□□□□□ -0.44
EFM4P40516 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.33□□□□□ -0.44
EFM4P40516 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.33□□□□□ -0.44
EFM4P40516 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.33□□□□□ -0.44
EFM4P40516 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.33□□□□□ -0.44
EFM4P40516 MXR2YCL033C 507 nt12.32□□□□□ -0.44
EFM4P40516 PCM1YEL058W 1674 nt12.32□□□□□ -0.44
EFM4P40516 YDR433WYDR433W 441 nt12.31□□□□□ -0.44
EFM4P40516 FMP52YER004W 696 nt12.3□□□□□ -0.44
EFM4P40516 IMP2'YIL154C 1041 nt12.28□□□□□ -0.44
EFM4P40516 YFL054CYFL054C 1941 nt12.27□□□□□ -0.44
EFM4P40516 CWP1YKL096W 720 nt12.27□□□□□ -0.45
EFM4P40516 ADH2YMR303C 1047 nt12.27□□□□□ -0.45
EFM4P40516 SIM1YIL123W 1431 nt12.27□□□□□ -0.45
EFM4P40516 FMP45YDL222C 930 nt12.25□□□□□ -0.45
EFM4P40516 LPX1YOR084W 1164 nt12.2□□□□□ -0.46
EFM4P40516 SNF6YHL025W 999 nt12.19□□□□□ -0.46
EFM4P40516 BIO4YNR057C 714 nt12.17□□□□□ -0.46
EFM4P40516 SPT8YLR055C 1809 nt12.15□□□□□ -0.46
EFM4P40516 LYS4YDR234W 2082 nt12.15□□□□□ -0.46
EFM4P40516 ERV46YAL042W 1248 nt12.13□□□□□ -0.47
EFM4P40516 SOR2YDL246C 1074 nt12.12□□□□□ -0.47
EFM4P40516 SOR1YJR159W 1074 nt12.12□□□□□ -0.47
EFM4P40516 YCL042WYCL042W 360 nt12.11□□□□□ -0.47
EFM4P40516 YKR040CYKR040C 504 nt12.09□□□□□ -0.47
EFM4P40516 FRD1YEL047C 1413 nt12.08□□□□□ -0.48
EFM4P40516 NVJ2YPR091C 2313 nt12.04□□□□□ -0.48
EFM4P40516 YIH1YCR059C 777 nt12.01□□□□□ -0.49
EFM4P40516 YLL053CYLL053C 459 nt11.99□□□□□ -0.49
EFM4P40516 SWE1YJL187C 2460 nt11.97□□□□□ -0.49
EFM4P40516 RNQ1YCL028W 1218 nt11.96□□□□□ -0.49
EFM4P40516 CRR1YLR213C 1269 nt11.95□□□□□ -0.5
EFM4P40516 ERF2YLR246W 1080 nt11.95□□□□□ -0.5
EFM4P40516 ATF2YGR177C 1608 nt11.91□□□□□ -0.5
EFM4P40516 MIC10YCL057C-A 294 nt11.9□□□□□ -0.5
EFM4P40516 DIC1YLR348C 897 nt11.88□□□□□ -0.51
EFM4P40516 SPP1YPL138C 1062 nt11.86□□□□□ -0.51
EFM4P40516 FTR1YER145C 1215 nt11.85□□□□□ -0.51
EFM4P40516 HEM12YDR047W 1089 nt11.84□□□□□ -0.51
EFM4P40516 TRM5YHR070W 1500 nt11.84□□□□□ -0.51
EFM4P40516 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.83□□□□□ -0.52
EFM4P40516 PTH1YHR189W 573 nt11.83□□□□□ -0.52
EFM4P40516 GAL1YBR020W 1587 nt11.83□□□□□ -0.52
EFM4P40516 SNG1YGR197C 1644 nt11.82□□□□□ -0.52
EFM4P40516 BOR1YNL275W 1731 nt11.8□□□□□ -0.52
EFM4P40516 MOT3YMR070W 1473 nt11.78□□□□□ -0.52
EFM4P40516 YFL067WYFL067W 528 nt11.78□□□□□ -0.52
EFM4P40516 DDR2YOL052C-A 186 nt11.76□□□□□ -0.53
EFM4P40516 RAX1YOR301W 1308 nt11.72□□□□□ -0.53
EFM4P40516 CCA1YER168C 1641 nt11.71□□□□□ -0.53
EFM4P40516 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.7□□□□□ -0.54
EFM4P40516 HSP60YLR259C 1719 nt11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.4 ms