Protein–RNA interactions for Protein: P40309

KHA1, K(+)/H(+) antiporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KHA1P40309 ART5YGR068C 1761 nt12.75□□□□□ -0.37
KHA1P40309 TIR4YOR009W 1464 nt12.73□□□□□ -0.37
KHA1P40309 YDL221WYDL221W 552 nt12.73□□□□□ -0.37
KHA1P40309 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.73□□□□□ -0.37
KHA1P40309 YLR281CYLR281C 468 nt12.73□□□□□ -0.37
KHA1P40309 GFD2YCL036W 1701 nt12.73□□□□□ -0.37
KHA1P40309 WHI5YOR083W 888 nt12.7□□□□□ -0.38
KHA1P40309 YMR090WYMR090W 684 nt12.68□□□□□ -0.38
KHA1P40309 PET9YBL030C 957 nt12.67□□□□□ -0.38
KHA1P40309 IRC15YPL017C 1500 nt12.66□□□□□ -0.38
KHA1P40309 YCH1YGR203W 447 nt12.64□□□□□ -0.39
KHA1P40309 YBR220CYBR220C 1683 nt12.63□□□□□ -0.39
KHA1P40309 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.61□□□□□ -0.39
KHA1P40309 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.61□□□□□ -0.39
KHA1P40309 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.61□□□□□ -0.39
KHA1P40309 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.61□□□□□ -0.39
KHA1P40309 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.61□□□□□ -0.39
KHA1P40309 YJL152WYJL152W 360 nt12.6□□□□□ -0.39
KHA1P40309 SDH1YKL148C 1923 nt12.58□□□□□ -0.39
KHA1P40309 YMR057CYMR057C 372 nt12.57□□□□□ -0.4
KHA1P40309 RTS2YOR077W 699 nt12.57□□□□□ -0.4
KHA1P40309 PUS2YGL063W 1113 nt12.55□□□□□ -0.4
KHA1P40309 GIS3YLR094C 1509 nt12.55□□□□□ -0.4
KHA1P40309 BDF1YLR399C 2061 nt12.53□□□□□ -0.4
KHA1P40309 SCC4YER147C 1875 nt12.5□□□□□ -0.41
KHA1P40309 CUE1YMR264W 612 nt12.46□□□□□ -0.41
KHA1P40309 FPS1YLL043W 2010 nt12.45□□□□□ -0.42
KHA1P40309 YLR236CYLR236C 324 nt12.42□□□□□ -0.42
KHA1P40309 DSK2YMR276W 1122 nt12.42□□□□□ -0.42
KHA1P40309 YPR011CYPR011C 981 nt12.41□□□□□ -0.42
KHA1P40309 IMP2'YIL154C 1041 nt12.4□□□□□ -0.42
KHA1P40309 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.39□□□□□ -0.43
KHA1P40309 TAT1YBR069C 1860 nt12.38□□□□□ -0.43
KHA1P40309 IDH1YNL037C 1083 nt12.37□□□□□ -0.43
KHA1P40309 MOT3YMR070W 1473 nt12.35□□□□□ -0.43
KHA1P40309 GBP2YCL011C 1284 nt12.29□□□□□ -0.44
KHA1P40309 YIL100WYIL100W 354 nt12.27□□□□□ -0.45
KHA1P40309 FMP45YDL222C 930 nt12.23□□□□□ -0.45
KHA1P40309 RRD1YIL153W 1182 nt12.22□□□□□ -0.45
KHA1P40309 YSC84YHR016C 1407 nt12.2□□□□□ -0.46
KHA1P40309 ERV46YAL042W 1248 nt12.2□□□□□ -0.46
KHA1P40309 LPX1YOR084W 1164 nt12.2□□□□□ -0.46
KHA1P40309 DED1YOR204W 1815 nt12.18□□□□□ -0.46
KHA1P40309 YDR433WYDR433W 441 nt12.18□□□□□ -0.46
KHA1P40309 YHL050CYHL050C 2094 nt12.17□□□□□ -0.46
KHA1P40309 TCD2YKL027W 1344 nt12.16□□□□□ -0.46
KHA1P40309 RRT12YCR045C 1476 nt12.15□□□□□ -0.46
KHA1P40309 SEC11YIR022W 504 nt12.15□□□□□ -0.46
KHA1P40309 MXR2YCL033C 507 nt12.15□□□□□ -0.46
KHA1P40309 PCH2YBR186W 1695 nt12.1□□□□□ -0.47
KHA1P40309 YNL195CYNL195C 786 nt12.1□□□□□ -0.47
KHA1P40309 YKR040CYKR040C 504 nt12.09□□□□□ -0.47
KHA1P40309 FMT1YBL013W 1206 nt12.09□□□□□ -0.47
KHA1P40309 GUT2YIL155C 1950 nt12.05□□□□□ -0.48
KHA1P40309 FMP52YER004W 696 nt12.04□□□□□ -0.48
KHA1P40309 SOR2YDL246C 1074 nt11.99□□□□□ -0.49
KHA1P40309 SOR1YJR159W 1074 nt11.99□□□□□ -0.49
KHA1P40309 FRD1YEL047C 1413 nt11.97□□□□□ -0.49
KHA1P40309 ADH2YMR303C 1047 nt11.93□□□□□ -0.5
KHA1P40309 SPP1YPL138C 1062 nt11.93□□□□□ -0.5
KHA1P40309 PCM1YEL058W 1674 nt11.92□□□□□ -0.5
KHA1P40309 CWP1YKL096W 720 nt11.92□□□□□ -0.5
KHA1P40309 PIB2YGL023C 1908 nt11.92□□□□□ -0.5
KHA1P40309 YCL042WYCL042W 360 nt11.9□□□□□ -0.5
KHA1P40309 RTF1YGL244W 1677 nt11.84□□□□□ -0.51
KHA1P40309 LCB1YMR296C 1677 nt11.84□□□□□ -0.51
KHA1P40309 NCP1YHR042W 2076 nt11.83□□□□□ -0.51
KHA1P40309 SNF6YHL025W 999 nt11.83□□□□□ -0.52
KHA1P40309 BOP3YNL042W 1191 nt11.8□□□□□ -0.52
KHA1P40309 SIM1YIL123W 1431 nt11.76□□□□□ -0.53
KHA1P40309 BIO4YNR057C 714 nt11.75□□□□□ -0.53
KHA1P40309 YIH1YCR059C 777 nt11.74□□□□□ -0.53
KHA1P40309 PTH1YHR189W 573 nt11.71□□□□□ -0.53
KHA1P40309 RNQ1YCL028W 1218 nt11.71□□□□□ -0.53
KHA1P40309 PTK1YKL198C 1989 nt11.68□□□□□ -0.54
KHA1P40309 DIC1YLR348C 897 nt11.68□□□□□ -0.54
KHA1P40309 RTG1YOL067C 534 nt11.68□□□□□ -0.54
KHA1P40309 YLR235CYLR235C 399 nt11.65□□□□□ -0.54
KHA1P40309 YLL053CYLL053C 459 nt11.64□□□□□ -0.55
KHA1P40309 LYS4YDR234W 2082 nt11.59□□□□□ -0.55
KHA1P40309 FTR1YER145C 1215 nt11.56□□□□□ -0.56
KHA1P40309 YKL030WYKL030W 606 nt11.56□□□□□ -0.56
KHA1P40309 MRPL8YJL063C 717 nt11.55□□□□□ -0.56
KHA1P40309 ERF2YLR246W 1080 nt11.55□□□□□ -0.56
KHA1P40309 TIM23YNR017W 669 nt11.55□□□□□ -0.56
KHA1P40309 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.54□□□□□ -0.56
KHA1P40309 YEL076CYEL076C 651 nt11.54□□□□□ -0.56
KHA1P40309 CRR1YLR213C 1269 nt11.54□□□□□ -0.56
KHA1P40309 YLR464WYLR464W 651 nt11.54□□□□□ -0.56
KHA1P40309 GAL1YBR020W 1587 nt11.51□□□□□ -0.57
KHA1P40309 ATF2YGR177C 1608 nt11.51□□□□□ -0.57
KHA1P40309 YLR179CYLR179C 606 nt11.49□□□□□ -0.57
KHA1P40309 TRM5YHR070W 1500 nt11.49□□□□□ -0.57
KHA1P40309 AQY1YPR192W 918 nt11.45□□□□□ -0.58
KHA1P40309 WSC2YNL283C 1512 nt11.45□□□□□ -0.58
KHA1P40309 YFL054CYFL054C 1941 nt11.44□□□□□ -0.58
KHA1P40309 YFL067WYFL067W 528 nt11.43□□□□□ -0.58
KHA1P40309 AHT1YHR093W 549 nt11.42□□□□□ -0.58
KHA1P40309 ADO1YJR105W 1023 nt11.42□□□□□ -0.58
KHA1P40309 MIC10YCL057C-A 294 nt11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms