Protein–RNA interactions for Protein: P40088

FTR1, Plasma membrane iron permease, yeastyeast

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FTR1P40088 SIS1YNL007C 1059 nt13.22□□□□□ -0.29
FTR1P40088 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.21□□□□□ -0.29
FTR1P40088 RPP2AYOL039W 321 nt13.19□□□□□ -0.3
FTR1P40088 SSA4YER103W 1929 nt13.17□□□□□ -0.3
FTR1P40088 YJL152WYJL152W 360 nt13.11□□□□□ -0.31
FTR1P40088 PTP1YDL230W 1008 nt13.08□□□□□ -0.32
FTR1P40088 DCW1YKL046C 1350 nt13.06□□□□□ -0.32
FTR1P40088 TIR4YOR009W 1464 nt13.03□□□□□ -0.32
FTR1P40088 IMP2'YIL154C 1041 nt13.01□□□□□ -0.33
FTR1P40088 DSK2YMR276W 1122 nt13.01□□□□□ -0.33
FTR1P40088 ART5YGR068C 1761 nt13.01□□□□□ -0.33
FTR1P40088 YCH1YGR203W 447 nt12.98□□□□□ -0.33
FTR1P40088 PET9YBL030C 957 nt12.96□□□□□ -0.33
FTR1P40088 CAC2YML102W 1407 nt12.96□□□□□ -0.34
FTR1P40088 GFD2YCL036W 1701 nt12.93□□□□□ -0.34
FTR1P40088 YLR236CYLR236C 324 nt12.92□□□□□ -0.34
FTR1P40088 EMI2YDR516C 1503 nt12.92□□□□□ -0.34
FTR1P40088 YPR011CYPR011C 981 nt12.91□□□□□ -0.34
FTR1P40088 IDH1YNL037C 1083 nt12.9□□□□□ -0.34
FTR1P40088 FMP45YDL222C 930 nt12.89□□□□□ -0.35
FTR1P40088 YMR057CYMR057C 372 nt12.89□□□□□ -0.35
FTR1P40088 YMR090WYMR090W 684 nt12.86□□□□□ -0.35
FTR1P40088 YDL221WYDL221W 552 nt12.84□□□□□ -0.35
FTR1P40088 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.82□□□□□ -0.36
FTR1P40088 MOT3YMR070W 1473 nt12.8□□□□□ -0.36
FTR1P40088 RTS2YOR077W 699 nt12.79□□□□□ -0.36
FTR1P40088 GBP2YCL011C 1284 nt12.77□□□□□ -0.37
FTR1P40088 IRC15YPL017C 1500 nt12.76□□□□□ -0.37
FTR1P40088 YDR433WYDR433W 441 nt12.74□□□□□ -0.37
FTR1P40088 LPX1YOR084W 1164 nt12.72□□□□□ -0.37
FTR1P40088 BDF1YLR399C 2061 nt12.71□□□□□ -0.37
FTR1P40088 ERV46YAL042W 1248 nt12.71□□□□□ -0.37
FTR1P40088 GIS3YLR094C 1509 nt12.67□□□□□ -0.38
FTR1P40088 FPS1YLL043W 2010 nt12.67□□□□□ -0.38
FTR1P40088 CUE1YMR264W 612 nt12.67□□□□□ -0.38
FTR1P40088 SDH1YKL148C 1923 nt12.64□□□□□ -0.39
FTR1P40088 TCD2YKL027W 1344 nt12.62□□□□□ -0.39
FTR1P40088 YKR040CYKR040C 504 nt12.62□□□□□ -0.39
FTR1P40088 YBR220CYBR220C 1683 nt12.61□□□□□ -0.39
FTR1P40088 SCC4YER147C 1875 nt12.61□□□□□ -0.39
FTR1P40088 MXR2YCL033C 507 nt12.6□□□□□ -0.39
FTR1P40088 YIL100WYIL100W 354 nt12.55□□□□□ -0.4
FTR1P40088 TAT1YBR069C 1860 nt12.54□□□□□ -0.4
FTR1P40088 RRD1YIL153W 1182 nt12.53□□□□□ -0.4
FTR1P40088 DED1YOR204W 1815 nt12.5□□□□□ -0.41
FTR1P40088 SPP1YPL138C 1062 nt12.49□□□□□ -0.41
FTR1P40088 NVJ2YPR091C 2313 nt12.46□□□□□ -0.41
FTR1P40088 PAC11YDR488C 1602 nt12.44□□□□□ -0.42
FTR1P40088 YCL042WYCL042W 360 nt12.39□□□□□ -0.43
FTR1P40088 FMT1YBL013W 1206 nt12.38□□□□□ -0.43
FTR1P40088 FRD1YEL047C 1413 nt12.37□□□□□ -0.43
FTR1P40088 FMP52YER004W 696 nt12.37□□□□□ -0.43
FTR1P40088 YNL195CYNL195C 786 nt12.36□□□□□ -0.43
FTR1P40088 SOR2YDL246C 1074 nt12.33□□□□□ -0.44
FTR1P40088 SOR1YJR159W 1074 nt12.33□□□□□ -0.44
FTR1P40088 Q0182Q0182 405 nt12.32□□□□□ -0.44
FTR1P40088 MRPL8YJL063C 717 nt12.32□□□□□ -0.44
FTR1P40088 CWP1YKL096W 720 nt12.29□□□□□ -0.44
FTR1P40088 YSC84YHR016C 1407 nt12.27□□□□□ -0.45
FTR1P40088 RTG1YOL067C 534 nt12.26□□□□□ -0.45
FTR1P40088 RRT12YCR045C 1476 nt12.26□□□□□ -0.45
FTR1P40088 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.24□□□□□ -0.45
FTR1P40088 YEL076CYEL076C 651 nt12.24□□□□□ -0.45
FTR1P40088 YLR464WYLR464W 651 nt12.24□□□□□ -0.45
FTR1P40088 ADH2YMR303C 1047 nt12.24□□□□□ -0.45
FTR1P40088 ADO1YJR105W 1023 nt12.22□□□□□ -0.45
FTR1P40088 PTH1YHR189W 573 nt12.21□□□□□ -0.45
FTR1P40088 PCM1YEL058W 1674 nt12.21□□□□□ -0.45
FTR1P40088 YHL050CYHL050C 2094 nt12.18□□□□□ -0.46
FTR1P40088 SNF6YHL025W 999 nt12.18□□□□□ -0.46
FTR1P40088 SEC11YIR022W 504 nt12.18□□□□□ -0.46
FTR1P40088 YLR235CYLR235C 399 nt12.18□□□□□ -0.46
FTR1P40088 PCH2YBR186W 1695 nt12.12□□□□□ -0.47
FTR1P40088 YKL030WYKL030W 606 nt12.11□□□□□ -0.47
FTR1P40088 HUA1YGR268C 597 nt12.1□□□□□ -0.47
FTR1P40088 GUT2YIL155C 1950 nt12.07□□□□□ -0.48
FTR1P40088 DIC1YLR348C 897 nt12.06□□□□□ -0.48
FTR1P40088 LCB1YMR296C 1677 nt12.04□□□□□ -0.48
FTR1P40088 RNQ1YCL028W 1218 nt12.04□□□□□ -0.48
FTR1P40088 YIH1YCR059C 777 nt12.03□□□□□ -0.48
FTR1P40088 SIM1YIL123W 1431 nt12.02□□□□□ -0.49
FTR1P40088 TIM23YNR017W 669 nt12□□□□□ -0.49
FTR1P40088 BIO4YNR057C 714 nt11.98□□□□□ -0.49
FTR1P40088 YLR179CYLR179C 606 nt11.94□□□□□ -0.5
FTR1P40088 YLL053CYLL053C 459 nt11.93□□□□□ -0.5
FTR1P40088 PIB2YGL023C 1908 nt11.9□□□□□ -0.51
FTR1P40088 FTR1YER145C 1215 nt11.86□□□□□ -0.51
FTR1P40088 YPR064WYPR064W 420 nt11.86□□□□□ -0.51
FTR1P40088 BOP3YNL042W 1191 nt11.85□□□□□ -0.51
FTR1P40088 NCP1YHR042W 2076 nt11.83□□□□□ -0.52
FTR1P40088 RTF1YGL244W 1677 nt11.82□□□□□ -0.52
FTR1P40088 AQY1YPR192W 918 nt11.82□□□□□ -0.52
FTR1P40088 GAL1YBR020W 1587 nt11.81□□□□□ -0.52
FTR1P40088 UBX6YJL048C 1191 nt11.81□□□□□ -0.52
FTR1P40088 ERF2YLR246W 1080 nt11.81□□□□□ -0.52
FTR1P40088 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.8□□□□□ -0.52
FTR1P40088 AHT1YHR093W 549 nt11.79□□□□□ -0.52
FTR1P40088 TRM5YHR070W 1500 nt11.79□□□□□ -0.52
FTR1P40088 WSC2YNL283C 1512 nt11.79□□□□□ -0.52
FTR1P40088 TAD3YLR316C 969 nt11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms