Protein–RNA interactions for Protein: P39927

PTI1, Protein PTI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTI1P39927 YBR220CYBR220C 1683 nt11.31□□□□□ -0.6
PTI1P39927 YPS1YLR120C 1710 nt11.3□□□□□ -0.6
PTI1P39927 UBX6YJL048C 1191 nt11.3□□□□□ -0.6
PTI1P39927 YMR090WYMR090W 684 nt11.28□□□□□ -0.6
PTI1P39927 EMI2YDR516C 1503 nt11.26□□□□□ -0.61
PTI1P39927 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.26□□□□□ -0.61
PTI1P39927 YEL076CYEL076C 651 nt11.26□□□□□ -0.61
PTI1P39927 YLR464WYLR464W 651 nt11.26□□□□□ -0.61
PTI1P39927 NVJ2YPR091C 2313 nt11.25□□□□□ -0.61
PTI1P39927 PHO4YFR034C 939 nt11.24□□□□□ -0.61
PTI1P39927 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.24□□□□□ -0.61
PTI1P39927 YPR011CYPR011C 981 nt11.2□□□□□ -0.62
PTI1P39927 INM2YDR287W 879 nt11.19□□□□□ -0.62
PTI1P39927 YLR236CYLR236C 324 nt11.18□□□□□ -0.62
PTI1P39927 SDH1YKL148C 1923 nt11.12□□□□□ -0.63
PTI1P39927 TRM9YML014W 840 nt11.12□□□□□ -0.63
PTI1P39927 SIS1YNL007C 1059 nt11.12□□□□□ -0.63
PTI1P39927 YDL221WYDL221W 552 nt11.11□□□□□ -0.63
PTI1P39927 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.11□□□□□ -0.63
PTI1P39927 YDR095CYDR095C 411 nt11.1□□□□□ -0.63
PTI1P39927 YBL100CYBL100C 315 nt11.1□□□□□ -0.63
PTI1P39927 PCH2YBR186W 1695 nt11.1□□□□□ -0.63
PTI1P39927 RTG1YOL067C 534 nt11.06□□□□□ -0.64
PTI1P39927 GUT2YIL155C 1950 nt11.06□□□□□ -0.64
PTI1P39927 SEC11YIR022W 504 nt11.05□□□□□ -0.64
PTI1P39927 ERV46YAL042W 1248 nt11.03□□□□□ -0.64
PTI1P39927 YDR094WYDR094W 336 nt11.02□□□□□ -0.65
PTI1P39927 HUA1YGR268C 597 nt10.99□□□□□ -0.65
PTI1P39927 CAC2YML102W 1407 nt10.99□□□□□ -0.65
PTI1P39927 LPX1YOR084W 1164 nt10.98□□□□□ -0.65
PTI1P39927 FUN26YAL022C 1554 nt10.96□□□□□ -0.65
PTI1P39927 SPP1YPL138C 1062 nt10.95□□□□□ -0.66
PTI1P39927 SCC4YER147C 1875 nt10.94□□□□□ -0.66
PTI1P39927 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.94□□□□□ -0.66
PTI1P39927 IDH1YNL037C 1083 nt10.94□□□□□ -0.66
PTI1P39927 CCT6YDR188W 1641 nt10.94□□□□□ -0.66
PTI1P39927 PTP1YDL230W 1008 nt10.92□□□□□ -0.66
PTI1P39927 RPP2AYOL039W 321 nt10.91□□□□□ -0.66
PTI1P39927 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.9□□□□□ -0.66
PTI1P39927 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.9□□□□□ -0.66
PTI1P39927 YKR040CYKR040C 504 nt10.89□□□□□ -0.67
PTI1P39927 YJL152WYJL152W 360 nt10.87□□□□□ -0.67
PTI1P39927 YDR433WYDR433W 441 nt10.86□□□□□ -0.67
PTI1P39927 PIB2YGL023C 1908 nt10.84□□□□□ -0.67
PTI1P39927 IRC15YPL017C 1500 nt10.82□□□□□ -0.68
PTI1P39927 ALF1YNL148C 765 nt10.81□□□□□ -0.68
PTI1P39927 GIS3YLR094C 1509 nt10.78□□□□□ -0.68
PTI1P39927 YSC84YHR016C 1407 nt10.77□□□□□ -0.68
PTI1P39927 RTF1YGL244W 1677 nt10.75□□□□□ -0.69
PTI1P39927 GBP2YCL011C 1284 nt10.71□□□□□ -0.69
PTI1P39927 YHL050CYHL050C 2094 nt10.69□□□□□ -0.7
PTI1P39927 SBA1YKL117W 651 nt10.64□□□□□ -0.71
PTI1P39927 BOP3YNL042W 1191 nt10.64□□□□□ -0.71
PTI1P39927 MXR2YCL033C 507 nt10.6□□□□□ -0.71
PTI1P39927 PTK1YKL198C 1989 nt10.59□□□□□ -0.71
PTI1P39927 FPS1YLL043W 2010 nt10.58□□□□□ -0.72
PTI1P39927 RRT12YCR045C 1476 nt10.57□□□□□ -0.72
PTI1P39927 GFD2YCL036W 1701 nt10.57□□□□□ -0.72
PTI1P39927 RTS2YOR077W 699 nt10.55□□□□□ -0.72
PTI1P39927 ART5YGR068C 1761 nt10.54□□□□□ -0.72
PTI1P39927 BOR1YNL275W 1731 nt10.53□□□□□ -0.72
PTI1P39927 TCD2YKL027W 1344 nt10.53□□□□□ -0.72
PTI1P39927 YKL030WYKL030W 606 nt10.52□□□□□ -0.73
PTI1P39927 YLR235CYLR235C 399 nt10.5□□□□□ -0.73
PTI1P39927 YNL195CYNL195C 786 nt10.5□□□□□ -0.73
PTI1P39927 RRT5YFR032C 870 nt10.49□□□□□ -0.73
PTI1P39927 PAU16YKL224C 372 nt10.47□□□□□ -0.73
PTI1P39927 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.46□□□□□ -0.73
PTI1P39927 TIR4YOR009W 1464 nt10.46□□□□□ -0.74
PTI1P39927 CUE1YMR264W 612 nt10.45□□□□□ -0.74
PTI1P39927 UME6YDR207C 2511 nt10.45□□□□□ -0.74
PTI1P39927 PET9YBL030C 957 nt10.44□□□□□ -0.74
PTI1P39927 YJL225CYJL225C 5277 nt10.43□□□□□ -0.74
PTI1P39927 YFR018CYFR018C 1092 nt10.42□□□□□ -0.74
PTI1P39927 FRD1YEL047C 1413 nt10.41□□□□□ -0.74
PTI1P39927 PTH1YHR189W 573 nt10.38□□□□□ -0.75
PTI1P39927 YCL042WYCL042W 360 nt10.37□□□□□ -0.75
PTI1P39927 YFL054CYFL054C 1941 nt10.37□□□□□ -0.75
PTI1P39927 YIL100WYIL100W 354 nt10.36□□□□□ -0.75
PTI1P39927 NCP1YHR042W 2076 nt10.34□□□□□ -0.75
PTI1P39927 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.33□□□□□ -0.76
PTI1P39927 LCB1YMR296C 1677 nt10.33□□□□□ -0.76
PTI1P39927 SPT8YLR055C 1809 nt10.3□□□□□ -0.76
PTI1P39927 YMR057CYMR057C 372 nt10.29□□□□□ -0.76
PTI1P39927 SNF6YHL025W 999 nt10.28□□□□□ -0.76
PTI1P39927 SOR2YDL246C 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
PTI1P39927 SOR1YJR159W 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
PTI1P39927 DED1YOR204W 1815 nt10.24□□□□□ -0.77
PTI1P39927 NAT4YMR069W 858 nt10.2□□□□□ -0.78
PTI1P39927 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.2□□□□□ -0.78
PTI1P39927 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.2□□□□□ -0.78
PTI1P39927 RRD1YIL153W 1182 nt10.19□□□□□ -0.78
PTI1P39927 PRE6YOL038W 765 nt10.19□□□□□ -0.78
PTI1P39927 DIC1YLR348C 897 nt10.17□□□□□ -0.78
PTI1P39927 MCH5YOR306C 1566 nt10.17□□□□□ -0.78
PTI1P39927 HSP60YLR259C 1719 nt10.16□□□□□ -0.78
PTI1P39927 TIM23YNR017W 669 nt10.15□□□□□ -0.78
PTI1P39927 ALG12YNR030W 1656 nt10.13□□□□□ -0.79
PTI1P39927 YPR064WYPR064W 420 nt10.13□□□□□ -0.79
PTI1P39927 GLK1YCL040W 1503 nt10.09□□□□□ -0.79
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