Protein–RNA interactions for Protein: P38835

YHR131C, PH domain-containing protein YHR131C, yeastyeast

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR131CP38835 DAL1YIR027C 1383 nt13.04□□□□□ -0.32
YHR131CP38835 LSM3YLR438C-A 270 nt13.03□□□□□ -0.32
YHR131CP38835 YDR094WYDR094W 336 nt12.99□□□□□ -0.33
YHR131CP38835 SPP1YPL138C 1062 nt12.99□□□□□ -0.33
YHR131CP38835 INM2YDR287W 879 nt12.97□□□□□ -0.33
YHR131CP38835 FPR4YLR449W 1179 nt12.95□□□□□ -0.34
YHR131CP38835 PHO4YFR034C 939 nt12.94□□□□□ -0.34
YHR131CP38835 LPX1YOR084W 1164 nt12.87□□□□□ -0.35
YHR131CP38835 SBA1YKL117W 651 nt12.85□□□□□ -0.35
YHR131CP38835 YBL100CYBL100C 315 nt12.85□□□□□ -0.35
YHR131CP38835 ERV46YAL042W 1248 nt12.82□□□□□ -0.36
YHR131CP38835 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.82□□□□□ -0.36
YHR131CP38835 HUA1YGR268C 597 nt12.8□□□□□ -0.36
YHR131CP38835 YPS1YLR120C 1710 nt12.74□□□□□ -0.37
YHR131CP38835 FUN26YAL022C 1554 nt12.69□□□□□ -0.38
YHR131CP38835 TRM9YML014W 840 nt12.66□□□□□ -0.38
YHR131CP38835 MEP2YNL142W 1500 nt12.66□□□□□ -0.38
YHR131CP38835 YDR095CYDR095C 411 nt12.65□□□□□ -0.38
YHR131CP38835 YKR040CYKR040C 504 nt12.63□□□□□ -0.39
YHR131CP38835 YDR433WYDR433W 441 nt12.58□□□□□ -0.4
YHR131CP38835 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.55□□□□□ -0.4
YHR131CP38835 IDH1YNL037C 1083 nt12.55□□□□□ -0.4
YHR131CP38835 CCT6YDR188W 1641 nt12.55□□□□□ -0.4
YHR131CP38835 SSA4YER103W 1929 nt12.54□□□□□ -0.4
YHR131CP38835 YJL152WYJL152W 360 nt12.5□□□□□ -0.41
YHR131CP38835 ALF1YNL148C 765 nt12.49□□□□□ -0.41
YHR131CP38835 DCW1YKL046C 1350 nt12.46□□□□□ -0.41
YHR131CP38835 Q0182Q0182 405 nt12.42□□□□□ -0.42
YHR131CP38835 PTP1YDL230W 1008 nt12.4□□□□□ -0.42
YHR131CP38835 MXR2YCL033C 507 nt12.4□□□□□ -0.42
YHR131CP38835 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YHR131CP38835 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YHR131CP38835 PAU16YKL224C 372 nt12.39□□□□□ -0.43
YHR131CP38835 RPP2AYOL039W 321 nt12.37□□□□□ -0.43
YHR131CP38835 GBP2YCL011C 1284 nt12.34□□□□□ -0.43
YHR131CP38835 CAC2YML102W 1407 nt12.3□□□□□ -0.44
YHR131CP38835 EMI2YDR516C 1503 nt12.29□□□□□ -0.44
YHR131CP38835 RRT5YFR032C 870 nt12.22□□□□□ -0.45
YHR131CP38835 YDL221WYDL221W 552 nt12.21□□□□□ -0.45
YHR131CP38835 YFR018CYFR018C 1092 nt12.19□□□□□ -0.46
YHR131CP38835 YKL030WYKL030W 606 nt12.19□□□□□ -0.46
YHR131CP38835 ART5YGR068C 1761 nt12.19□□□□□ -0.46
YHR131CP38835 GFD2YCL036W 1701 nt12.17□□□□□ -0.46
YHR131CP38835 YLR235CYLR235C 399 nt12.17□□□□□ -0.46
YHR131CP38835 TIR4YOR009W 1464 nt12.15□□□□□ -0.46
YHR131CP38835 PTH1YHR189W 573 nt12.14□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 YMR090WYMR090W 684 nt12.14□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 YBR220CYBR220C 1683 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 IRC15YPL017C 1500 nt12.12□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 PRE6YOL038W 765 nt12.11□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 FRD1YEL047C 1413 nt12.11□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 BDF1YLR399C 2061 nt12.1□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 PET9YBL030C 957 nt12.1□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 SNF6YHL025W 999 nt12.09□□□□□ -0.47
YHR131CP38835 SDH1YKL148C 1923 nt12.07□□□□□ -0.48
YHR131CP38835 TCD2YKL027W 1344 nt12.06□□□□□ -0.48
YHR131CP38835 LCB1YMR296C 1677 nt12.04□□□□□ -0.48
YHR131CP38835 GIS3YLR094C 1509 nt12.02□□□□□ -0.48
YHR131CP38835 RTS2YOR077W 699 nt12.02□□□□□ -0.49
YHR131CP38835 YMR057CYMR057C 372 nt11.99□□□□□ -0.49
YHR131CP38835 SCC4YER147C 1875 nt11.98□□□□□ -0.49
YHR131CP38835 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.95□□□□□ -0.5
YHR131CP38835 TAT1YBR069C 1860 nt11.95□□□□□ -0.5
YHR131CP38835 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.92□□□□□ -0.5
YHR131CP38835 CUE1YMR264W 612 nt11.91□□□□□ -0.5
YHR131CP38835 FPS1YLL043W 2010 nt11.91□□□□□ -0.5
YHR131CP38835 YMR244WYMR244W 1068 nt11.9□□□□□ -0.5
YHR131CP38835 DED1YOR204W 1815 nt11.89□□□□□ -0.51
YHR131CP38835 NAT4YMR069W 858 nt11.89□□□□□ -0.51
YHR131CP38835 YCL042WYCL042W 360 nt11.86□□□□□ -0.51
YHR131CP38835 TIM23YNR017W 669 nt11.83□□□□□ -0.52
YHR131CP38835 DIC1YLR348C 897 nt11.82□□□□□ -0.52
YHR131CP38835 SOR2YDL246C 1074 nt11.78□□□□□ -0.52
YHR131CP38835 RRD1YIL153W 1182 nt11.78□□□□□ -0.52
YHR131CP38835 SOR1YJR159W 1074 nt11.78□□□□□ -0.52
YHR131CP38835 YFL066CYFL066C 1179 nt11.74□□□□□ -0.53
YHR131CP38835 FMT1YBL013W 1206 nt11.73□□□□□ -0.53
YHR131CP38835 YIL100WYIL100W 354 nt11.72□□□□□ -0.53
YHR131CP38835 GLK1YCL040W 1503 nt11.71□□□□□ -0.53
YHR131CP38835 PAC11YDR488C 1602 nt11.71□□□□□ -0.54
YHR131CP38835 YSC84YHR016C 1407 nt11.69□□□□□ -0.54
YHR131CP38835 MSF1YPR047W 1410 nt11.69□□□□□ -0.54
YHR131CP38835 YHL050CYHL050C 2094 nt11.68□□□□□ -0.54
YHR131CP38835 RBG2YGR173W 1107 nt11.65□□□□□ -0.54
YHR131CP38835 SEC11YIR022W 504 nt11.65□□□□□ -0.54
YHR131CP38835 RRT12YCR045C 1476 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 GLR1YPL091W 1452 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 PCH2YBR186W 1695 nt11.63□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 YPR064WYPR064W 420 nt11.63□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 PEX25YPL112C 1185 nt11.62□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 RPM1RPM1 483 nt11.61□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 TAD3YLR316C 969 nt11.6□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 YLR179CYLR179C 606 nt11.59□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 GUT2YIL155C 1950 nt11.59□□□□□ -0.55
YHR131CP38835 YNL195CYNL195C 786 nt11.57□□□□□ -0.56
YHR131CP38835 THI74YDR438W 1113 nt11.56□□□□□ -0.56
YHR131CP38835 FMP52YER004W 696 nt11.5□□□□□ -0.57
YHR131CP38835 MIR1YJR077C 936 nt11.5□□□□□ -0.57
YHR131CP38835 CWP1YKL096W 720 nt11.5□□□□□ -0.57
YHR131CP38835 PIB2YGL023C 1908 nt11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms