Protein–RNA interactions for Protein: P35177

SPT7, Transcriptional activator SPT7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT7P35177 RPP2AYOL039W 321 nt16.58■□□□□ 0.24
SPT7P35177 SIS1YNL007C 1059 nt16.49■□□□□ 0.23
SPT7P35177 YBR220CYBR220C 1683 nt16.49■□□□□ 0.23
SPT7P35177 YDL221WYDL221W 552 nt16.48■□□□□ 0.23
SPT7P35177 RKM5YLR137W 1104 nt16.43■□□□□ 0.22
SPT7P35177 TAT1YBR069C 1860 nt16.39■□□□□ 0.21
SPT7P35177 IRC15YPL017C 1500 nt16.39■□□□□ 0.21
SPT7P35177 SUF2tP(AGG)C 72 nt16.39■□□□□ 0.21
SPT7P35177 SUF10tP(AGG)N 72 nt16.39■□□□□ 0.21
SPT7P35177 SDH1YKL148C 1923 nt16.36■□□□□ 0.21
SPT7P35177 YMR090WYMR090W 684 nt16.36■□□□□ 0.21
SPT7P35177 ART5YGR068C 1761 nt16.35■□□□□ 0.21
SPT7P35177 GFD2YCL036W 1701 nt16.34■□□□□ 0.21
SPT7P35177 PUS2YGL063W 1113 nt16.32■□□□□ 0.2
SPT7P35177 MOT3YMR070W 1473 nt16.31■□□□□ 0.2
SPT7P35177 GIS3YLR094C 1509 nt16.24■□□□□ 0.19
SPT7P35177 RTS2YOR077W 699 nt16.23■□□□□ 0.19
SPT7P35177 TIR4YOR009W 1464 nt16.23■□□□□ 0.19
SPT7P35177 SCC4YER147C 1875 nt16.2■□□□□ 0.18
SPT7P35177 YLR281CYLR281C 468 nt16.19■□□□□ 0.18
SPT7P35177 PET9YBL030C 957 nt16.13■□□□□ 0.17
SPT7P35177 YMR057CYMR057C 372 nt16.05■□□□□ 0.16
SPT7P35177 WHI5YOR083W 888 nt16.05■□□□□ 0.16
SPT7P35177 YCH1YGR203W 447 nt16■□□□□ 0.15
SPT7P35177 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.96■□□□□ 0.15
SPT7P35177 CUE1YMR264W 612 nt15.96■□□□□ 0.15
SPT7P35177 MRPL8YJL063C 717 nt15.94■□□□□ 0.14
SPT7P35177 FPS1YLL043W 2010 nt15.93■□□□□ 0.14
SPT7P35177 FMP45YDL222C 930 nt15.93■□□□□ 0.14
SPT7P35177 YSC84YHR016C 1407 nt15.9■□□□□ 0.14
SPT7P35177 YJL152WYJL152W 360 nt15.9■□□□□ 0.14
SPT7P35177 PCH2YBR186W 1695 nt15.87■□□□□ 0.13
SPT7P35177 YHL050CYHL050C 2094 nt15.86■□□□□ 0.13
SPT7P35177 RRT12YCR045C 1476 nt15.83■□□□□ 0.12
SPT7P35177 DSK2YMR276W 1122 nt15.82■□□□□ 0.12
SPT7P35177 GUT2YIL155C 1950 nt15.82■□□□□ 0.12
SPT7P35177 SEC11YIR022W 504 nt15.78■□□□□ 0.12
SPT7P35177 IMP2'YIL154C 1041 nt15.76■□□□□ 0.11
SPT7P35177 ADO1YJR105W 1023 nt15.72■□□□□ 0.11
SPT7P35177 YIL100WYIL100W 354 nt15.69■□□□□ 0.1
SPT7P35177 PIB2YGL023C 1908 nt15.69■□□□□ 0.1
SPT7P35177 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.68■□□□□ 0.1
SPT7P35177 YPR011CYPR011C 981 nt15.67■□□□□ 0.1
SPT7P35177 YLR236CYLR236C 324 nt15.66■□□□□ 0.1
SPT7P35177 UBX6YJL048C 1191 nt15.58■□□□□ 0.08
SPT7P35177 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.55■□□□□ 0.08
SPT7P35177 YEL076CYEL076C 651 nt15.55■□□□□ 0.08
SPT7P35177 YLR464WYLR464W 651 nt15.55■□□□□ 0.08
SPT7P35177 YNL195CYNL195C 786 nt15.55■□□□□ 0.08
SPT7P35177 RRD1YIL153W 1182 nt15.51■□□□□ 0.07
SPT7P35177 RTF1YGL244W 1677 nt15.47■□□□□ 0.07
SPT7P35177 DED1YOR204W 1815 nt15.45■□□□□ 0.06
SPT7P35177 IDH1YNL037C 1083 nt15.44■□□□□ 0.06
SPT7P35177 GBP2YCL011C 1284 nt15.43■□□□□ 0.06
SPT7P35177 NCP1YHR042W 2076 nt15.39■□□□□ 0.05
SPT7P35177 LPX1YOR084W 1164 nt15.38■□□□□ 0.05
SPT7P35177 FMT1YBL013W 1206 nt15.36■□□□□ 0.05
SPT7P35177 BOP3YNL042W 1191 nt15.34■□□□□ 0.05
SPT7P35177 PTK1YKL198C 1989 nt15.34■□□□□ 0.05
SPT7P35177 SPP1YPL138C 1062 nt15.33■□□□□ 0.04
SPT7P35177 MXR2YCL033C 507 nt15.32■□□□□ 0.04
SPT7P35177 ERV46YAL042W 1248 nt15.31■□□□□ 0.04
SPT7P35177 RTG1YOL067C 534 nt15.31■□□□□ 0.04
SPT7P35177 LCB1YMR296C 1677 nt15.31■□□□□ 0.04
SPT7P35177 TCD2YKL027W 1344 nt15.28■□□□□ 0.04
SPT7P35177 PAC11YDR488C 1602 nt15.27■□□□□ 0.04
SPT7P35177 YDR433WYDR433W 441 nt15.24■□□□□ 0.03
SPT7P35177 PCM1YEL058W 1674 nt15.19■□□□□ 0.02
SPT7P35177 FMP52YER004W 696 nt15.18■□□□□ 0.02
SPT7P35177 HUA1YGR268C 597 nt15.18■□□□□ 0.02
SPT7P35177 ADH2YMR303C 1047 nt15.17■□□□□ 0.02
SPT7P35177 YDR094WYDR094W 336 nt15.15■□□□□ 0.02
SPT7P35177 YKR040CYKR040C 504 nt15.15■□□□□ 0.02
SPT7P35177 CWP1YKL096W 720 nt15.14■□□□□ 0.01
SPT7P35177 SOR2YDL246C 1074 nt15.06■□□□□ 0
SPT7P35177 SOR1YJR159W 1074 nt15.06■□□□□ 0
SPT7P35177 SIM1YIL123W 1431 nt15.06■□□□□ 0
SPT7P35177 FRD1YEL047C 1413 nt15.03■□□□□ -0
SPT7P35177 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.02■□□□□ -0
SPT7P35177 BIO4YNR057C 714 nt15.02■□□□□ -0
SPT7P35177 SNF6YHL025W 999 nt15□□□□□ -0.01
SPT7P35177 LYS4YDR234W 2082 nt14.99□□□□□ -0.01
SPT7P35177 YFL054CYFL054C 1941 nt14.98□□□□□ -0.01
SPT7P35177 YCL042WYCL042W 360 nt14.93□□□□□ -0.02
SPT7P35177 SPT8YLR055C 1809 nt14.87□□□□□ -0.03
SPT7P35177 YIH1YCR059C 777 nt14.87□□□□□ -0.03
SPT7P35177 YLL053CYLL053C 459 nt14.8□□□□□ -0.04
SPT7P35177 RNQ1YCL028W 1218 nt14.78□□□□□ -0.04
SPT7P35177 CRR1YLR213C 1269 nt14.75□□□□□ -0.05
SPT7P35177 NVJ2YPR091C 2313 nt14.73□□□□□ -0.05
SPT7P35177 DIC1YLR348C 897 nt14.72□□□□□ -0.05
SPT7P35177 ATF2YGR177C 1608 nt14.72□□□□□ -0.05
SPT7P35177 ERF2YLR246W 1080 nt14.7□□□□□ -0.06
SPT7P35177 PTH1YHR189W 573 nt14.69□□□□□ -0.06
SPT7P35177 MIC10YCL057C-A 294 nt14.69□□□□□ -0.06
SPT7P35177 SWE1YJL187C 2460 nt14.67□□□□□ -0.06
SPT7P35177 SBA1YKL117W 651 nt14.66□□□□□ -0.06
SPT7P35177 FTR1YER145C 1215 nt14.65□□□□□ -0.06
SPT7P35177 YKL030WYKL030W 606 nt14.64□□□□□ -0.07
SPT7P35177 GAL1YBR020W 1587 nt14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 154.4 ms