Protein–RNA interactions for Protein: P32487

LYP1, Lysine-specific permease, yeast

Predictions only

Length 611 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYP1	P32487	PTP1	YDL230W	1008 nt		11.64	□□□□□ -0.55
LYP1	P32487	EMI2	YDR516C	1503 nt		11.63	□□□□□ -0.55
LYP1	P32487	TAT1	YBR069C	1860 nt		11.62	□□□□□ -0.55
LYP1	P32487	NME1	NME1	340 nt		11.61	□□□□□ -0.55
LYP1	P32487	YBR220C	YBR220C	1683 nt		11.58	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	FPS1	YLL043W	2010 nt		11.57	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	LSM3	YLR438C-A	270 nt		11.57	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	CAC2	YML102W	1407 nt		11.57	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	TRM9	YML014W	840 nt		11.56	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	RPP2A	YOL039W	321 nt		11.55	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	WHI5	YOR083W	888 nt		11.55	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	CCT6	YDR188W	1641 nt		11.55	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	YDL221W	YDL221W	552 nt		11.53	□□□□□ -0.56
LYP1	P32487	ALF1	YNL148C	765 nt		11.52	□□□□□ -0.57
LYP1	P32487	SIS1	YNL007C	1059 nt		11.49	□□□□□ -0.57
LYP1	P32487	YMR090W	YMR090W	684 nt		11.48	□□□□□ -0.57
LYP1	P32487	SDH1	YKL148C	1923 nt		11.46	□□□□□ -0.58
LYP1	P32487	YPR011C	YPR011C	981 nt		11.43	□□□□□ -0.58
LYP1	P32487	IRC15	YPL017C	1500 nt		11.41	□□□□□ -0.58
LYP1	P32487	SUF2	tP(AGG)C	72 nt		11.39	□□□□□ -0.59
LYP1	P32487	SUF10	tP(AGG)N	72 nt		11.39	□□□□□ -0.59
LYP1	P32487	MRPL8	YJL063C	717 nt		11.39	□□□□□ -0.59
LYP1	P32487	FMP45	YDL222C	930 nt		11.38	□□□□□ -0.59
LYP1	P32487	DSK2	YMR276W	1122 nt		11.35	□□□□□ -0.59
LYP1	P32487	GFD2	YCL036W	1701 nt		11.34	□□□□□ -0.59
LYP1	P32487	YLR236C	YLR236C	324 nt		11.33	□□□□□ -0.6
LYP1	P32487	SCC4	YER147C	1875 nt		11.32	□□□□□ -0.6
LYP1	P32487	ART5	YGR068C	1761 nt		11.31	□□□□□ -0.6
LYP1	P32487	YCH1	YGR203W	447 nt		11.31	□□□□□ -0.6
LYP1	P32487	GIS3	YLR094C	1509 nt		11.3	□□□□□ -0.6
LYP1	P32487	IMP2'	YIL154C	1041 nt		11.29	□□□□□ -0.6
LYP1	P32487	PET9	YBL030C	957 nt		11.23	□□□□□ -0.61
LYP1	P32487	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		11.22	□□□□□ -0.61
LYP1	P32487	TIR4	YOR009W	1464 nt		11.2	□□□□□ -0.62
LYP1	P32487	RTS2	YOR077W	699 nt		11.18	□□□□□ -0.62
LYP1	P32487	PCH2	YBR186W	1695 nt		11.17	□□□□□ -0.62
LYP1	P32487	UBX6	YJL048C	1191 nt		11.17	□□□□□ -0.62
LYP1	P32487	ADO1	YJR105W	1023 nt		11.17	□□□□□ -0.62
LYP1	P32487	GUT2	YIL155C	1950 nt		11.15	□□□□□ -0.62
LYP1	P32487	SEC11	YIR022W	504 nt		11.14	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	YEL076C-A	YEL076C-A	651 nt		11.13	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	YEL076C	YEL076C	651 nt		11.13	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	YLR464W	YLR464W	651 nt		11.13	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	CUE1	YMR264W	612 nt		11.12	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	LPX1	YOR084W	1164 nt		11.1	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	SPP1	YPL138C	1062 nt		11.1	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	RTG1	YOL067C	534 nt		11.09	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	YSC84	YHR016C	1407 nt		11.09	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	YHL050C	YHL050C	2094 nt		11.08	□□□□□ -0.63
LYP1	P32487	ERV46	YAL042W	1248 nt		11.08	□□□□□ -0.64
LYP1	P32487	PIB2	YGL023C	1908 nt		11.07	□□□□□ -0.64
LYP1	P32487	YMR057C	YMR057C	372 nt		11.06	□□□□□ -0.64
LYP1	P32487	RRT12	YCR045C	1476 nt		11	□□□□□ -0.65
LYP1	P32487	YJL152W	YJL152W	360 nt		11	□□□□□ -0.65
LYP1	P32487	YGR139W	YGR139W	339 nt		10.95	□□□□□ -0.66
LYP1	P32487	IDH1	YNL037C	1083 nt		10.94	□□□□□ -0.66
LYP1	P32487	YKR040C	YKR040C	504 nt		10.93	□□□□□ -0.66
LYP1	P32487	YDR433W	YDR433W	441 nt		10.89	□□□□□ -0.67
LYP1	P32487	YIL100W	YIL100W	354 nt		10.89	□□□□□ -0.67
LYP1	P32487	RPM1	RPM1	483 nt		10.88	□□□□□ -0.67
LYP1	P32487	RTF1	YGL244W	1677 nt		10.87	□□□□□ -0.67
LYP1	P32487	YDR094W	YDR094W	336 nt		10.85	□□□□□ -0.67
LYP1	P32487	YFL015W-A	YFL015W-A	318 nt		10.84	□□□□□ -0.67
LYP1	P32487	YNL195C	YNL195C	786 nt		10.83	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	UME6	YDR207C	2511 nt		10.82	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	NCP1	YHR042W	2076 nt		10.81	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	HUA1	YGR268C	597 nt		10.8	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	MXR2	YCL033C	507 nt		10.8	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	PTK1	YKL198C	1989 nt		10.79	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	BOP3	YNL042W	1191 nt		10.79	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	GBP2	YCL011C	1284 nt		10.79	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		10.79	□□□□□ -0.68
LYP1	P32487	RRD1	YIL153W	1182 nt		10.72	□□□□□ -0.69
LYP1	P32487	LCB1	YMR296C	1677 nt		10.66	□□□□□ -0.7
LYP1	P32487	DED1	YOR204W	1815 nt		10.65	□□□□□ -0.7
LYP1	P32487	TCD2	YKL027W	1344 nt		10.62	□□□□□ -0.71
LYP1	P32487	FRD1	YEL047C	1413 nt		10.6	□□□□□ -0.71
LYP1	P32487	FMT1	YBL013W	1206 nt		10.59	□□□□□ -0.71
LYP1	P32487	FMP52	YER004W	696 nt		10.58	□□□□□ -0.72
LYP1	P32487	SBA1	YKL117W	651 nt		10.52	□□□□□ -0.73
LYP1	P32487	PCM1	YEL058W	1674 nt		10.52	□□□□□ -0.73
LYP1	P32487	YKL030W	YKL030W	606 nt		10.51	□□□□□ -0.73
LYP1	P32487	PTH1	YHR189W	573 nt		10.5	□□□□□ -0.73
LYP1	P32487	YJL225C	YJL225C	5277 nt		10.49	□□□□□ -0.73
LYP1	P32487	LYS4	YDR234W	2082 nt		10.48	□□□□□ -0.73
LYP1	P32487	YFL054C	YFL054C	1941 nt		10.46	□□□□□ -0.73
LYP1	P32487	YLR235C	YLR235C	399 nt		10.46	□□□□□ -0.73
LYP1	P32487	SPT8	YLR055C	1809 nt		10.46	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	ADH2	YMR303C	1047 nt		10.45	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	SIM1	YIL123W	1431 nt		10.43	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	SOR2	YDL246C	1074 nt		10.43	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	SOR1	YJR159W	1074 nt		10.43	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	YCL042W	YCL042W	360 nt		10.43	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	PAU16	YKL224C	372 nt		10.42	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	BIO4	YNR057C	714 nt		10.41	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	CWP1	YKL096W	720 nt		10.4	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	MET8	YBR213W	825 nt		10.4	□□□□□ -0.74
LYP1	P32487	YFR018C	YFR018C	1092 nt		10.38	□□□□□ -0.75
LYP1	P32487	SNF6	YHL025W	999 nt		10.36	□□□□□ -0.75
LYP1	P32487	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		10.35	□□□□□ -0.75

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