Protein–RNA interactions for Protein: P22217

TRX1, Thioredoxin-1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRX1P22217 ART5YGR068C 1761 nt12.79□□□□□ -0.36
TRX1P22217 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.77□□□□□ -0.37
TRX1P22217 YLR281CYLR281C 468 nt12.77□□□□□ -0.37
TRX1P22217 WHI5YOR083W 888 nt12.75□□□□□ -0.37
TRX1P22217 TIR4YOR009W 1464 nt12.72□□□□□ -0.37
TRX1P22217 GFD2YCL036W 1701 nt12.72□□□□□ -0.37
TRX1P22217 YMR090WYMR090W 684 nt12.72□□□□□ -0.37
TRX1P22217 YDL221WYDL221W 552 nt12.71□□□□□ -0.37
TRX1P22217 YJL152WYJL152W 360 nt12.69□□□□□ -0.38
TRX1P22217 PET9YBL030C 957 nt12.69□□□□□ -0.38
TRX1P22217 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.68□□□□□ -0.38
TRX1P22217 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.68□□□□□ -0.38
TRX1P22217 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.68□□□□□ -0.38
TRX1P22217 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.68□□□□□ -0.38
TRX1P22217 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.68□□□□□ -0.38
TRX1P22217 YCH1YGR203W 447 nt12.65□□□□□ -0.38
TRX1P22217 IRC15YPL017C 1500 nt12.64□□□□□ -0.39
TRX1P22217 PUS2YGL063W 1113 nt12.63□□□□□ -0.39
TRX1P22217 YMR057CYMR057C 372 nt12.62□□□□□ -0.39
TRX1P22217 YBR220CYBR220C 1683 nt12.61□□□□□ -0.39
TRX1P22217 RTS2YOR077W 699 nt12.58□□□□□ -0.4
TRX1P22217 SDH1YKL148C 1923 nt12.58□□□□□ -0.4
TRX1P22217 GIS3YLR094C 1509 nt12.56□□□□□ -0.4
TRX1P22217 SCC4YER147C 1875 nt12.51□□□□□ -0.41
TRX1P22217 BDF1YLR399C 2061 nt12.49□□□□□ -0.41
TRX1P22217 DSK2YMR276W 1122 nt12.46□□□□□ -0.41
TRX1P22217 FPS1YLL043W 2010 nt12.45□□□□□ -0.42
TRX1P22217 CUE1YMR264W 612 nt12.45□□□□□ -0.42
TRX1P22217 YPR011CYPR011C 981 nt12.45□□□□□ -0.42
TRX1P22217 IMP2'YIL154C 1041 nt12.44□□□□□ -0.42
TRX1P22217 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.44□□□□□ -0.42
TRX1P22217 YLR236CYLR236C 324 nt12.42□□□□□ -0.42
TRX1P22217 IDH1YNL037C 1083 nt12.41□□□□□ -0.42
TRX1P22217 GBP2YCL011C 1284 nt12.36□□□□□ -0.43
TRX1P22217 TAT1YBR069C 1860 nt12.31□□□□□ -0.44
TRX1P22217 YIL100WYIL100W 354 nt12.3□□□□□ -0.44
TRX1P22217 FMP45YDL222C 930 nt12.29□□□□□ -0.44
TRX1P22217 YDR433WYDR433W 441 nt12.27□□□□□ -0.45
TRX1P22217 LPX1YOR084W 1164 nt12.23□□□□□ -0.45
TRX1P22217 RRD1YIL153W 1182 nt12.22□□□□□ -0.45
TRX1P22217 TCD2YKL027W 1344 nt12.21□□□□□ -0.45
TRX1P22217 ERV46YAL042W 1248 nt12.2□□□□□ -0.46
TRX1P22217 MXR2YCL033C 507 nt12.2□□□□□ -0.46
TRX1P22217 DED1YOR204W 1815 nt12.2□□□□□ -0.46
TRX1P22217 YSC84YHR016C 1407 nt12.2□□□□□ -0.46
TRX1P22217 RRT12YCR045C 1476 nt12.19□□□□□ -0.46
TRX1P22217 YHL050CYHL050C 2094 nt12.16□□□□□ -0.46
TRX1P22217 YNL195CYNL195C 786 nt12.16□□□□□ -0.46
TRX1P22217 YKR040CYKR040C 504 nt12.15□□□□□ -0.46
TRX1P22217 SEC11YIR022W 504 nt12.13□□□□□ -0.47
TRX1P22217 FMT1YBL013W 1206 nt12.1□□□□□ -0.47
TRX1P22217 MOT3YMR070W 1473 nt12.09□□□□□ -0.47
TRX1P22217 PCH2YBR186W 1695 nt12.09□□□□□ -0.47
TRX1P22217 FMP52YER004W 696 nt12.04□□□□□ -0.48
TRX1P22217 GUT2YIL155C 1950 nt12.02□□□□□ -0.49
TRX1P22217 FRD1YEL047C 1413 nt11.98□□□□□ -0.49
TRX1P22217 CWP1YKL096W 720 nt11.98□□□□□ -0.49
TRX1P22217 SPP1YPL138C 1062 nt11.98□□□□□ -0.49
TRX1P22217 YCL042WYCL042W 360 nt11.97□□□□□ -0.49
TRX1P22217 ADH2YMR303C 1047 nt11.96□□□□□ -0.49
TRX1P22217 PCM1YEL058W 1674 nt11.96□□□□□ -0.5
TRX1P22217 SOR2YDL246C 1074 nt11.95□□□□□ -0.5
TRX1P22217 SOR1YJR159W 1074 nt11.95□□□□□ -0.5
TRX1P22217 PIB2YGL023C 1908 nt11.86□□□□□ -0.51
TRX1P22217 SNF6YHL025W 999 nt11.86□□□□□ -0.51
TRX1P22217 LCB1YMR296C 1677 nt11.83□□□□□ -0.52
TRX1P22217 NCP1YHR042W 2076 nt11.82□□□□□ -0.52
TRX1P22217 RTF1YGL244W 1677 nt11.82□□□□□ -0.52
TRX1P22217 SIM1YIL123W 1431 nt11.79□□□□□ -0.52
TRX1P22217 BOP3YNL042W 1191 nt11.79□□□□□ -0.52
TRX1P22217 PTH1YHR189W 573 nt11.77□□□□□ -0.53
TRX1P22217 BIO4YNR057C 714 nt11.74□□□□□ -0.53
TRX1P22217 YIH1YCR059C 777 nt11.73□□□□□ -0.53
TRX1P22217 RNQ1YCL028W 1218 nt11.72□□□□□ -0.53
TRX1P22217 DIC1YLR348C 897 nt11.69□□□□□ -0.54
TRX1P22217 RTG1YOL067C 534 nt11.69□□□□□ -0.54
TRX1P22217 YLR235CYLR235C 399 nt11.68□□□□□ -0.54
TRX1P22217 PTK1YKL198C 1989 nt11.67□□□□□ -0.54
TRX1P22217 YLL053CYLL053C 459 nt11.67□□□□□ -0.54
TRX1P22217 YKL030WYKL030W 606 nt11.61□□□□□ -0.55
TRX1P22217 LYS4YDR234W 2082 nt11.59□□□□□ -0.55
TRX1P22217 TIM23YNR017W 669 nt11.59□□□□□ -0.55
TRX1P22217 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.57□□□□□ -0.56
TRX1P22217 YEL076CYEL076C 651 nt11.57□□□□□ -0.56
TRX1P22217 MRPL8YJL063C 717 nt11.57□□□□□ -0.56
TRX1P22217 YLR464WYLR464W 651 nt11.57□□□□□ -0.56
TRX1P22217 FTR1YER145C 1215 nt11.56□□□□□ -0.56
TRX1P22217 ERF2YLR246W 1080 nt11.55□□□□□ -0.56
TRX1P22217 YLR179CYLR179C 606 nt11.54□□□□□ -0.56
TRX1P22217 GAL1YBR020W 1587 nt11.54□□□□□ -0.56
TRX1P22217 ATF2YGR177C 1608 nt11.53□□□□□ -0.56
TRX1P22217 TRM5YHR070W 1500 nt11.52□□□□□ -0.57
TRX1P22217 CRR1YLR213C 1269 nt11.5□□□□□ -0.57
TRX1P22217 ADO1YJR105W 1023 nt11.49□□□□□ -0.57
TRX1P22217 YFL067WYFL067W 528 nt11.47□□□□□ -0.57
TRX1P22217 YFL054CYFL054C 1941 nt11.47□□□□□ -0.57
TRX1P22217 HUA1YGR268C 597 nt11.46□□□□□ -0.57
TRX1P22217 DDR2YOL052C-A 186 nt11.46□□□□□ -0.57
TRX1P22217 AQY1YPR192W 918 nt11.45□□□□□ -0.58
TRX1P22217 WSC2YNL283C 1512 nt11.44□□□□□ -0.58
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