Protein–RNA interactions for Protein: P15179

MSD1, Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSD1P15179 PHO4YFR034C 939 nt13.2□□□□□ -0.3
MSD1P15179 YLR236CYLR236C 324 nt13.2□□□□□ -0.3
MSD1P15179 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.19□□□□□ -0.3
MSD1P15179 CCT6YDR188W 1641 nt13.14□□□□□ -0.31
MSD1P15179 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.05□□□□□ -0.32
MSD1P15179 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.05□□□□□ -0.32
MSD1P15179 ADO1YJR105W 1023 nt13.05□□□□□ -0.32
MSD1P15179 ALF1YNL148C 765 nt13□□□□□ -0.33
MSD1P15179 YJL152WYJL152W 360 nt12.98□□□□□ -0.33
MSD1P15179 MEP2YNL142W 1500 nt12.97□□□□□ -0.33
MSD1P15179 LPX1YOR084W 1164 nt12.96□□□□□ -0.33
MSD1P15179 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.94□□□□□ -0.34
MSD1P15179 YEL076CYEL076C 651 nt12.94□□□□□ -0.34
MSD1P15179 ERV46YAL042W 1248 nt12.94□□□□□ -0.34
MSD1P15179 YLR464WYLR464W 651 nt12.94□□□□□ -0.34
MSD1P15179 IDH1YNL037C 1083 nt12.93□□□□□ -0.34
MSD1P15179 SPP1YPL138C 1062 nt12.87□□□□□ -0.35
MSD1P15179 UBX6YJL048C 1191 nt12.86□□□□□ -0.35
MSD1P15179 YPS1YLR120C 1710 nt12.85□□□□□ -0.35
MSD1P15179 YDR433WYDR433W 441 nt12.84□□□□□ -0.35
MSD1P15179 RTG1YOL067C 534 nt12.83□□□□□ -0.36
MSD1P15179 SIS1YNL007C 1059 nt12.81□□□□□ -0.36
MSD1P15179 YKR040CYKR040C 504 nt12.79□□□□□ -0.36
MSD1P15179 DCW1YKL046C 1350 nt12.79□□□□□ -0.36
MSD1P15179 YDR095CYDR095C 411 nt12.77□□□□□ -0.37
MSD1P15179 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.73□□□□□ -0.37
MSD1P15179 GBP2YCL011C 1284 nt12.73□□□□□ -0.37
MSD1P15179 BDF1YLR399C 2061 nt12.72□□□□□ -0.37
MSD1P15179 TIR4YOR009W 1464 nt12.67□□□□□ -0.38
MSD1P15179 HUA1YGR268C 597 nt12.66□□□□□ -0.38
MSD1P15179 MXR2YCL033C 507 nt12.64□□□□□ -0.39
MSD1P15179 EMI2YDR516C 1503 nt12.58□□□□□ -0.4
MSD1P15179 YDR094WYDR094W 336 nt12.57□□□□□ -0.4
MSD1P15179 CAC2YML102W 1407 nt12.55□□□□□ -0.4
MSD1P15179 TAT1YBR069C 1860 nt12.55□□□□□ -0.4
MSD1P15179 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.55□□□□□ -0.4
MSD1P15179 RPP2AYOL039W 321 nt12.54□□□□□ -0.4
MSD1P15179 TCD2YKL027W 1344 nt12.52□□□□□ -0.41
MSD1P15179 YBR220CYBR220C 1683 nt12.5□□□□□ -0.41
MSD1P15179 PTP1YDL230W 1008 nt12.48□□□□□ -0.41
MSD1P15179 PET9YBL030C 957 nt12.48□□□□□ -0.41
MSD1P15179 YMR057CYMR057C 372 nt12.48□□□□□ -0.41
MSD1P15179 YMR090WYMR090W 684 nt12.48□□□□□ -0.41
MSD1P15179 ART5YGR068C 1761 nt12.48□□□□□ -0.41
MSD1P15179 YDL221WYDL221W 552 nt12.45□□□□□ -0.42
MSD1P15179 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.44□□□□□ -0.42
MSD1P15179 FRD1YEL047C 1413 nt12.38□□□□□ -0.43
MSD1P15179 SDH1YKL148C 1923 nt12.37□□□□□ -0.43
MSD1P15179 GFD2YCL036W 1701 nt12.37□□□□□ -0.43
MSD1P15179 YKL030WYKL030W 606 nt12.33□□□□□ -0.44
MSD1P15179 PTH1YHR189W 573 nt12.32□□□□□ -0.44
MSD1P15179 YLR235CYLR235C 399 nt12.31□□□□□ -0.44
MSD1P15179 DED1YOR204W 1815 nt12.31□□□□□ -0.44
MSD1P15179 YCL042WYCL042W 360 nt12.3□□□□□ -0.44
MSD1P15179 IRC15YPL017C 1500 nt12.29□□□□□ -0.44
MSD1P15179 RRD1YIL153W 1182 nt12.28□□□□□ -0.44
MSD1P15179 SCC4YER147C 1875 nt12.24□□□□□ -0.45
MSD1P15179 SOR2YDL246C 1074 nt12.22□□□□□ -0.45
MSD1P15179 SOR1YJR159W 1074 nt12.22□□□□□ -0.45
MSD1P15179 FPS1YLL043W 2010 nt12.21□□□□□ -0.46
MSD1P15179 GIS3YLR094C 1509 nt12.2□□□□□ -0.46
MSD1P15179 LCB1YMR296C 1677 nt12.19□□□□□ -0.46
MSD1P15179 PAC11YDR488C 1602 nt12.19□□□□□ -0.46
MSD1P15179 RTS2YOR077W 699 nt12.16□□□□□ -0.46
MSD1P15179 FMT1YBL013W 1206 nt12.15□□□□□ -0.46
MSD1P15179 PAU16YKL224C 372 nt12.11□□□□□ -0.47
MSD1P15179 PCH2YBR186W 1695 nt12.1□□□□□ -0.47
MSD1P15179 FMP52YER004W 696 nt12.08□□□□□ -0.48
MSD1P15179 RRT5YFR032C 870 nt12.08□□□□□ -0.48
MSD1P15179 SBA1YKL117W 651 nt12.08□□□□□ -0.48
MSD1P15179 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.07□□□□□ -0.48
MSD1P15179 SEC11YIR022W 504 nt12.07□□□□□ -0.48
MSD1P15179 CUE1YMR264W 612 nt12.07□□□□□ -0.48
MSD1P15179 YFR018CYFR018C 1092 nt12.06□□□□□ -0.48
MSD1P15179 GUT2YIL155C 1950 nt12.06□□□□□ -0.48
MSD1P15179 NVJ2YPR091C 2313 nt12.06□□□□□ -0.48
MSD1P15179 CWP1YKL096W 720 nt12.04□□□□□ -0.48
MSD1P15179 TIM23YNR017W 669 nt12.02□□□□□ -0.49
MSD1P15179 YSC84YHR016C 1407 nt12.02□□□□□ -0.49
MSD1P15179 ADH2YMR303C 1047 nt11.97□□□□□ -0.49
MSD1P15179 YIL100WYIL100W 354 nt11.96□□□□□ -0.49
MSD1P15179 DIC1YLR348C 897 nt11.95□□□□□ -0.5
MSD1P15179 PRE6YOL038W 765 nt11.94□□□□□ -0.5
MSD1P15179 YHL050CYHL050C 2094 nt11.94□□□□□ -0.5
MSD1P15179 YLR179CYLR179C 606 nt11.93□□□□□ -0.5
MSD1P15179 YPR064WYPR064W 420 nt11.92□□□□□ -0.5
MSD1P15179 RRT12YCR045C 1476 nt11.89□□□□□ -0.51
MSD1P15179 PIB2YGL023C 1908 nt11.88□□□□□ -0.51
MSD1P15179 SNF6YHL025W 999 nt11.86□□□□□ -0.51
MSD1P15179 TAD3YLR316C 969 nt11.85□□□□□ -0.51
MSD1P15179 PCM1YEL058W 1674 nt11.82□□□□□ -0.52
MSD1P15179 RNQ1YCL028W 1218 nt11.8□□□□□ -0.52
MSD1P15179 RTF1YGL244W 1677 nt11.78□□□□□ -0.52
MSD1P15179 YNL195CYNL195C 786 nt11.78□□□□□ -0.52
MSD1P15179 NAT4YMR069W 858 nt11.77□□□□□ -0.53
MSD1P15179 WSC2YNL283C 1512 nt11.76□□□□□ -0.53
MSD1P15179 AHT1YHR093W 549 nt11.76□□□□□ -0.53
MSD1P15179 YIH1YCR059C 777 nt11.75□□□□□ -0.53
MSD1P15179 PEX25YPL112C 1185 nt11.73□□□□□ -0.53
MSD1P15179 YFL066CYFL066C 1179 nt11.72□□□□□ -0.53
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