Protein–RNA interactions for Protein: P08004

CHS1, Chitin synthase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CHS1P08004 SIS1YNL007C 1059 nt12.99□□□□□ -0.33
CHS1P08004 MEP2YNL142W 1500 nt12.97□□□□□ -0.33
CHS1P08004 YPR011CYPR011C 981 nt12.94□□□□□ -0.34
CHS1P08004 YJL152WYJL152W 360 nt12.93□□□□□ -0.34
CHS1P08004 RPP2AYOL039W 321 nt12.92□□□□□ -0.34
CHS1P08004 DSK2YMR276W 1122 nt12.9□□□□□ -0.34
CHS1P08004 YLR236CYLR236C 324 nt12.89□□□□□ -0.35
CHS1P08004 PTP1YDL230W 1008 nt12.87□□□□□ -0.35
CHS1P08004 TIR4YOR009W 1464 nt12.86□□□□□ -0.35
CHS1P08004 YCH1YGR203W 447 nt12.84□□□□□ -0.35
CHS1P08004 FMP45YDL222C 930 nt12.83□□□□□ -0.36
CHS1P08004 ART5YGR068C 1761 nt12.82□□□□□ -0.36
CHS1P08004 IMP2'YIL154C 1041 nt12.82□□□□□ -0.36
CHS1P08004 DCW1YKL046C 1350 nt12.81□□□□□ -0.36
CHS1P08004 MOT3YMR070W 1473 nt12.79□□□□□ -0.36
CHS1P08004 CAC2YML102W 1407 nt12.76□□□□□ -0.37
CHS1P08004 GFD2YCL036W 1701 nt12.73□□□□□ -0.37
CHS1P08004 YMR057CYMR057C 372 nt12.72□□□□□ -0.37
CHS1P08004 PET9YBL030C 957 nt12.71□□□□□ -0.37
CHS1P08004 IDH1YNL037C 1083 nt12.71□□□□□ -0.37
CHS1P08004 LPX1YOR084W 1164 nt12.67□□□□□ -0.38
CHS1P08004 EMI2YDR516C 1503 nt12.63□□□□□ -0.39
CHS1P08004 YDR433WYDR433W 441 nt12.62□□□□□ -0.39
CHS1P08004 GBP2YCL011C 1284 nt12.62□□□□□ -0.39
CHS1P08004 ERV46YAL042W 1248 nt12.6□□□□□ -0.39
CHS1P08004 RTS2YOR077W 699 nt12.59□□□□□ -0.39
CHS1P08004 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.59□□□□□ -0.39
CHS1P08004 YDL221WYDL221W 552 nt12.55□□□□□ -0.4
CHS1P08004 IRC15YPL017C 1500 nt12.55□□□□□ -0.4
CHS1P08004 MXR2YCL033C 507 nt12.54□□□□□ -0.4
CHS1P08004 SSA4YER103W 1929 nt12.52□□□□□ -0.4
CHS1P08004 FPS1YLL043W 2010 nt12.51□□□□□ -0.41
CHS1P08004 SPP1YPL138C 1062 nt12.51□□□□□ -0.41
CHS1P08004 YKR040CYKR040C 504 nt12.5□□□□□ -0.41
CHS1P08004 YMR090WYMR090W 684 nt12.49□□□□□ -0.41
CHS1P08004 GIS3YLR094C 1509 nt12.46□□□□□ -0.42
CHS1P08004 TCD2YKL027W 1344 nt12.44□□□□□ -0.42
CHS1P08004 CUE1YMR264W 612 nt12.42□□□□□ -0.42
CHS1P08004 DED1YOR204W 1815 nt12.4□□□□□ -0.42
CHS1P08004 RRD1YIL153W 1182 nt12.39□□□□□ -0.43
CHS1P08004 SDH1YKL148C 1923 nt12.37□□□□□ -0.43
CHS1P08004 YBR220CYBR220C 1683 nt12.34□□□□□ -0.43
CHS1P08004 SCC4YER147C 1875 nt12.33□□□□□ -0.44
CHS1P08004 MRPL8YJL063C 717 nt12.28□□□□□ -0.44
CHS1P08004 FMT1YBL013W 1206 nt12.28□□□□□ -0.44
CHS1P08004 FRD1YEL047C 1413 nt12.28□□□□□ -0.44
CHS1P08004 YIL100WYIL100W 354 nt12.26□□□□□ -0.45
CHS1P08004 RTG1YOL067C 534 nt12.26□□□□□ -0.45
CHS1P08004 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.22□□□□□ -0.45
CHS1P08004 YEL076CYEL076C 651 nt12.22□□□□□ -0.45
CHS1P08004 YLR464WYLR464W 651 nt12.22□□□□□ -0.45
CHS1P08004 YCL042WYCL042W 360 nt12.2□□□□□ -0.46
CHS1P08004 SOR2YDL246C 1074 nt12.16□□□□□ -0.46
CHS1P08004 ADO1YJR105W 1023 nt12.16□□□□□ -0.46
CHS1P08004 SOR1YJR159W 1074 nt12.16□□□□□ -0.46
CHS1P08004 FMP52YER004W 696 nt12.14□□□□□ -0.47
CHS1P08004 PTH1YHR189W 573 nt12.13□□□□□ -0.47
CHS1P08004 CWP1YKL096W 720 nt12.13□□□□□ -0.47
CHS1P08004 ADH2YMR303C 1047 nt12.11□□□□□ -0.47
CHS1P08004 RRT12YCR045C 1476 nt12.05□□□□□ -0.48
CHS1P08004 PCM1YEL058W 1674 nt12.03□□□□□ -0.48
CHS1P08004 YNL195CYNL195C 786 nt12.03□□□□□ -0.48
CHS1P08004 HUA1YGR268C 597 nt12.02□□□□□ -0.49
CHS1P08004 YSC84YHR016C 1407 nt12.02□□□□□ -0.49
CHS1P08004 BDF1YLR399C 2061 nt12.01□□□□□ -0.49
CHS1P08004 YLR235CYLR235C 399 nt12.01□□□□□ -0.49
CHS1P08004 YKL030WYKL030W 606 nt12□□□□□ -0.49
CHS1P08004 SNF6YHL025W 999 nt11.97□□□□□ -0.49
CHS1P08004 YHL050CYHL050C 2094 nt11.97□□□□□ -0.49
CHS1P08004 LCB1YMR296C 1677 nt11.97□□□□□ -0.49
CHS1P08004 UBX6YJL048C 1191 nt11.92□□□□□ -0.5
CHS1P08004 DIC1YLR348C 897 nt11.91□□□□□ -0.5
CHS1P08004 TIM23YNR017W 669 nt11.86□□□□□ -0.51
CHS1P08004 TAT1YBR069C 1860 nt11.85□□□□□ -0.51
CHS1P08004 RNQ1YCL028W 1218 nt11.85□□□□□ -0.51
CHS1P08004 YIH1YCR059C 777 nt11.84□□□□□ -0.51
CHS1P08004 SEC11YIR022W 504 nt11.81□□□□□ -0.52
CHS1P08004 SIM1YIL123W 1431 nt11.8□□□□□ -0.52
CHS1P08004 YLR179CYLR179C 606 nt11.8□□□□□ -0.52
CHS1P08004 BIO4YNR057C 714 nt11.79□□□□□ -0.52
CHS1P08004 YDR094WYDR094W 336 nt11.76□□□□□ -0.53
CHS1P08004 YLL053CYLL053C 459 nt11.76□□□□□ -0.53
CHS1P08004 PCH2YBR186W 1695 nt11.75□□□□□ -0.53
CHS1P08004 YPR064WYPR064W 420 nt11.7□□□□□ -0.54
CHS1P08004 WSC2YNL283C 1512 nt11.7□□□□□ -0.54
CHS1P08004 FTR1YER145C 1215 nt11.68□□□□□ -0.54
CHS1P08004 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.68□□□□□ -0.54
CHS1P08004 GUT2YIL155C 1950 nt11.68□□□□□ -0.54
CHS1P08004 AHT1YHR093W 549 nt11.67□□□□□ -0.54
CHS1P08004 GAL1YBR020W 1587 nt11.66□□□□□ -0.54
CHS1P08004 TAD3YLR316C 969 nt11.64□□□□□ -0.55
CHS1P08004 NCP1YHR042W 2076 nt11.64□□□□□ -0.55
CHS1P08004 TRM5YHR070W 1500 nt11.63□□□□□ -0.55
CHS1P08004 AQY1YPR192W 918 nt11.6□□□□□ -0.55
CHS1P08004 ATF2YGR177C 1608 nt11.59□□□□□ -0.55
CHS1P08004 ERF2YLR246W 1080 nt11.55□□□□□ -0.56
CHS1P08004 PIB2YGL023C 1908 nt11.54□□□□□ -0.56
CHS1P08004 YFR018CYFR018C 1092 nt11.54□□□□□ -0.56
CHS1P08004 STB1YNL309W 1263 nt11.54□□□□□ -0.56
CHS1P08004 RTF1YGL244W 1677 nt11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms