Protein–RNA interactions for Protein: O15226

NKRF, NF-kappa-B-repressing factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKRFO15226 IGDCC3-202ENST00000558354 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.38■□□□□ 0.854e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.664e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.284e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-216ENST00000556990 568 ntTSL 416.75■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.24e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -04e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.394e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.544e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-213ENST00000555716 558 ntTSL 47.79□□□□□ -1.164e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.374e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.384e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.454e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.454e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.524e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.594e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 45.04□□□□□ -1.64e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.46■■□□□ 1.032e-46■■■■■ 35.1
NKRFO15226 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.82e-46■■■■■ 35.1
NKRFO15226 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 35
NKRFO15226 SYNGR2-209ENST00000592456 3036 nt13.79□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 35
NKRFO15226 GLYCTK-206ENST00000473583 1021 ntTSL 1 (best)19.71■□□□□ 0.751e-10■■■■■ 35
NKRFO15226 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 34.6
NKRFO15226 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 34.5
NKRFO15226 PISD-216ENST00000486675 837 ntTSL 316.28■□□□□ 0.27e-9■■■■■ 34.2
NKRFO15226 C10orf10-202ENST00000448778 613 ntTSL 316.2■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 34.2
NKRFO15226 RERE-215ENST00000492766 367 ntTSL 315.56■□□□□ 0.082e-10■■■■■ 34.2
NKRFO15226 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 34.2
NKRFO15226 PISD-204ENST00000422020 1015 ntTSL 512.94□□□□□ -0.347e-9■■■■■ 34.2
NKRFO15226 RERE-205ENST00000460659 454 ntTSL 212.14□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 34.2
NKRFO15226 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 423.57■■□□□ 1.362e-8■■■■■ 33.8
NKRFO15226 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.278e-9■■■■■ 33.8
NKRFO15226 SAMD1-203ENST00000541938 143 ntTSL 322.38■■□□□ 1.178e-9■■■■■ 33.8
NKRFO15226 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 221.47■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 33.8
NKRFO15226 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 33.8
NKRFO15226 ZZZ3-204ENST00000433749 603 ntTSL 46.25□□□□□ -1.412e-8■■■■■ 33.8
NKRFO15226 ZZZ3-207ENST00000469944 686 ntTSL 35.77□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 33.8
NKRFO15226 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.622e-8■■■■■ 33.8
NKRFO15226 POU2F1-216ENST00000560232 1195 ntTSL 213.6□□□□□ -0.234e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-213ENST00000557909 588 ntTSL 412.43□□□□□ -0.424e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-211ENST00000492850 615 ntTSL 510.74□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-214ENST00000559038 557 ntTSL 410.57□□□□□ -0.724e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-207ENST00000442313 496 ntTSL 39.66□□□□□ -0.864e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-201ENST00000271411 13945 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.344e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.64e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.64e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-203ENST00000367865 14332 ntTSL 24.91□□□□□ -1.624e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.74e-9■■■■■ 33.5
NKRFO15226 PANK3-203ENST00000522176 552 ntTSL 513.07□□□□□ -0.324e-10■■■■■ 33.4
NKRFO15226 AGO2-210ENST00000524328 316 ntTSL 513.79□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 32.9
NKRFO15226 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 233.73■■■□□ 2.992e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 233.73■■■□□ 2.992e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.592e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 431.01■■■□□ 2.552e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 530.98■■■□□ 2.552e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.932e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.772e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.472e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 222.27■■□□□ 1.162e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 222.21■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 221.88■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 REV1-203ENST00000413697 4727 ntTSL 220.42■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 519.88■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 319.62■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-208ENST00000456696 518 ntTSL 519.18■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 PRKAR1B-210ENST00000488474 617 ntTSL 316.5■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 415.2■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 32.4
NKRFO15226 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 31.9
NKRFO15226 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-18■■■■■ 31.5
NKRFO15226 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-18■■■■■ 31.5
NKRFO15226 TRIM25-207ENST00000573108 952 ntTSL 314.15□□□□□ -0.141e-18■■■■■ 31.5
NKRFO15226 EPC1-205ENST00000469059 591 ntTSL 519.3■□□□□ 0.685e-12■■■■■ 31.2
NKRFO15226 EPC1-208ENST00000480402 907 ntTSL 218.86■□□□□ 0.615e-12■■■■■ 31.2
NKRFO15226 EPC1-201ENST00000263062 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-12■■■■■ 31.2
NKRFO15226 EPC1-202ENST00000319778 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.715e-12■■■■■ 31.2
NKRFO15226 EPC1-210ENST00000495790 7386 ntTSL 56.71□□□□□ -1.345e-12■■■■■ 31.2
NKRFO15226 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.735e-12■■■■■ 31.2
NKRFO15226 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.934e-8■■■■■ 31.1
NKRFO15226 OXSR1-206ENST00000492714 471 ntTSL 324.14■■□□□ 1.454e-8■■■■■ 31.1
NKRFO15226 TTYH3-206ENST00000477439 731 ntTSL 218.84■□□□□ 0.614e-8■■■■■ 31.1
NKRFO15226 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-8■■■■■ 31.1
NKRFO15226 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC14.42□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 31.1
NKRFO15226 PISD-215ENST00000479851 655 ntTSL 323.55■■□□□ 1.361e-8■■■■■ 30.9
NKRFO15226 PISD-212ENST00000473770 2378 ntTSL 518.16■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 30.9
NKRFO15226 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 30.9
NKRFO15226 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 30.9
NKRFO15226 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-11■■■■■ 30.4
NKRFO15226 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 318.58■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 30.4
NKRFO15226 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.432e-10■■■■■ 30.4
NKRFO15226 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.432e-10■■■■■ 30.4
NKRFO15226 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 30.3
Retrieved 100 of 9,198 protein–RNA pairs in 39.6 ms