Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QR89 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QR89 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QR89 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QR89 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QR89 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QR89 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QR89 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QR89 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QR89 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QR89 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QR89 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QR89 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QR89 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QR89 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QR89 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QR89 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QR89 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QR89 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QR89 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QR89 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QR89 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QR89 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QR89 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QR89 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QR89 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QR89 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QR89 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QR89 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QR89 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QR89 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QR89 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QR89 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QR89 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3QR89 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QR89 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QR89 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QR89 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QR89 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QR89 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3QR89 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3QR89 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3QR89 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3QR89 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3QR89 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
J3QR89 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3QR89 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3QR89 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
J3QR89 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3QR89 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3QR89 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3QR89 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3QR89 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QR89 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QR89 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QR89 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QR89 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QR89 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QR89 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QR89 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QR89 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QR89 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QR89 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QR89 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QR89 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QR89 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QR89 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR89 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR89 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR89 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR89 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR89 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR89 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR89 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR89 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR89 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR89 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR89 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QR89 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QR89 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QR89 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QR89 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR89 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QR89 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3QR89 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3QR89 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3QR89 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3QR89 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3QR89 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3QR89 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
J3QR89 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3QR89 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3QR89 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3QR89 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3QR89 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
J3QR89 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3QR89 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3QR89 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3QR89 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3QR89 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms