Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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