Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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