Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms