Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms